- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT05319392
Sygnatury transkryptomiczne w gruczolakoraku żołądka (GAC)
Badanie sygnatur transkryptomicznych i ich znaczenia w gruczolakoraku żołądka
Przegląd badań
Status
Warunki
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
To badanie dotyczące gruczolakoraka żołądka jest retrospektywne i prospektywne, które zostanie przeprowadzone w SGPGIMS, Lucknow, Indie. Do badania zostaną zakwalifikowani pacjenci poddawani resekcji żołądka na oddziale gastroenterologii chirurgicznej, u których na podstawie biopsji endoskopowej w oddziale patologii rozpoznano GAC. Do retrospektywnej części badania przypadki zostaną wybrane na podstawie wyników badań histologicznych pobranych ze szpitalnego systemu informacyjnego i dokumentacji pacjentów.
W celu pobrania próbek świeże, wycięte chirurgicznie próbki zostaną pobrane w RNAlater i przechowywane w temperaturze -80⁰C. Zarchiwizowane bloczki tkankowe utrwalone w formalinie zatopione w parafinie (FFPE) dla przypadków retrospektywnych zostaną odzyskane i poddane przeglądowi histopatologicznemu. Po potwierdzeniu rozpoznania GAC, tkanki zostaną poddane obróbce w celu uzyskania tkanki guza i prawidłowej do części doświadczalnej.
RNA z guza i normalnego obszaru zostanie wyekstrahowane z bloków FFPE i świeżych próbek tkanek. Całe transkryptomiczne sekwencjonowanie nowej generacji zostanie przeprowadzone po udanej kontroli jakości, przygotowaniu biblioteki i amplifikacji. Dane dotyczące ekspresji genów uzyskane z sekwencjonowania zostaną poddane analizie bioinformatycznej w celu wyjaśnienia różnic w ekspresji genów między guzem a sąsiadującą normalną tkanką w odniesieniu do TME. Geny o znacznie zróżnicowanej ekspresji między guzem a normalnymi obszarami zostaną opisane i zidentyfikowane przy użyciu pakietów bioinformatycznych do adnotacji genów. Za pomocą analizy statystycznej geny ulegające zróżnicowanej ekspresji zostaną skorelowane z cechami klinicznymi pacjenta i wynikiem, aby zidentyfikować geny TME o istotnej wartości prognostycznej.
Typ studiów
Zapisy (Oczekiwany)
Kontakty i lokalizacje
Kontakt w sprawie studiów
- Nazwa: Raghavendra Lingaiah
- Numer telefonu: +91-522-2494250
- E-mail: raghulingaiah@gmail.com
Kopia zapasowa kontaktu do badania
- Nazwa: Shalini Singh
- E-mail: shal_singh@yahoo.co.uk
Lokalizacje studiów
-
-
Uttar Pradesh
-
Lucknow, Uttar Pradesh, Indie, 226014
- Rekrutacyjny
- Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences
-
Kontakt:
- Raghavendra Lingaiah
- Numer telefonu: +91-522-2494250
- E-mail: raghulingaiah@gmail.com
-
Kontakt:
- Shalini Singh
- E-mail: shal_singh@yahoo.co.uk
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Chorzy z guzem umiejscowionym w dystalnej części żołądka
- Pacjenci, u których wykonano całkowitą lub częściową resekcję żołądka po badaniu biopsyjnym
- Dostępność kontynuacji na oddziale Radioterapii lub Gastro
- Dostępność próbek tkanek z gastrektomii FFPE wybranych przypadków w histopatologii
Kryteria wyłączenia:
- Chorzy z guzem umiejscowionym w proksymalnej części żołądka
- Pacjenci z dostępną tylko biopsją
- Pacjenci, których obserwacja nie jest dostępna
- Niedostępność bloków tkankowych FFPE
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
---|---|
Pacjenci z gruczolakorakiem żołądka
Do badania zostaną włączeni pacjenci z guzem umiejscowionym w dystalnej części żołądka, którzy przeszli całkowitą lub częściową resekcję żołądka po wykonaniu biopsji z możliwością obserwacji i archiwizacji tkanki FFPE.
|
Badanie sygnatur transkryptomicznych związanych z mikrośrodowiskiem guza odgrywającym istotną rolę w rokowaniu chorych na gruczolakoraka żołądka
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
---|---|---|
Profilowanie transkryptomu gruczolakoraka żołądka
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Uzyskanie danych dotyczących ekspresji genów w tkance nowotworowej i prawidłowej poprzez sekwencjonowanie RNA
|
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Różnicowa analiza ekspresji genów w gruczolakoraku żołądka
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Określenie zróżnicowanej ekspresji genu między guzem a normalną tkanką poprzez bioinformatyczną analizę danych dotyczących ekspresji genów
|
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Wpływ mikrośrodowiska guza na profil ekspresji genów gruczolakoraka żołądka
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Identyfikacja genów związanych z mikrośrodowiskiem guza i ich adnotacja funkcjonalna przy użyciu pakietów bioinformatycznych
|
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Korelacja genów związanych z mikrośrodowiskiem guza z cechami klinicznymi pacjenta
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Aby skorelować różnie wyrażany gen związany z mikrośrodowiskiem guza z wynikami u pacjentów, aby zidentyfikować geny istotnie związane z całkowitym przeżyciem
|
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
---|---|---|
Stratyfikacja ryzyka pacjentów na podstawie korelacji między ekspresją genów a całkowitym przeżyciem
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Aby stratyfikować pacjentów na podstawie sygnatur genów związanych z całkowitym przeżyciem u pacjentów z gruczolakorakiem żołądka
|
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
|
Współpracownicy i badacze
Śledczy
- Główny śledczy: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Ahn B, Chae YS, Kim CH, Lee Y, Lee JH, Kim JY. Tumor microenvironmental factors have prognostic significances in advanced gastric cancer. APMIS. 2018 Oct;126(10):814-821. doi: 10.1111/apm.12889.
- Zhang S, Zeng Z, Liu Y, Huang J, Long J, Wang Y, Peng X, Hu Z, Ouyang Y. Prognostic landscape of tumor-infiltrating immune cells and immune-related genes in the tumor microenvironment of gastric cancer. Aging (Albany NY). 2020 Sep 23;12(18):17958-17975. doi: 10.18632/aging.103519. Epub 2020 Sep 23.
- Qiu XT, Song YC, Liu J, Wang ZM, Niu X, He J. Identification of an immune-related gene-based signature to predict prognosis of patients with gastric cancer. World J Gastrointest Oncol. 2020 Aug 15;12(8):857-876. doi: 10.4251/wjgo.v12.i8.857.
- Ren N, Liang B, Li Y. Identification of prognosis-related genes in the tumor microenvironment of stomach adenocarcinoma by TCGA and GEO datasets. Biosci Rep. 2020 Oct 30;40(10):BSR20200980. doi: 10.1042/BSR20200980.
- Cai WY, Dong ZN, Fu XT, Lin LY, Wang L, Ye GD, Luo QC, Chen YC. Identification of a Tumor Microenvironment-relevant Gene set-based Prognostic Signature and Related Therapy Targets in Gastric Cancer. Theranostics. 2020 Jul 9;10(19):8633-8647. doi: 10.7150/thno.47938. eCollection 2020.
- Li T, Gao X, Han L, Yu J, Li H. Identification of hub genes with prognostic values in gastric cancer by bioinformatics analysis. World J Surg Oncol. 2018 Jun 19;16(1):114. doi: 10.1186/s12957-018-1409-3.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)
Ukończenie studiów (Oczekiwany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 2021-240-PhD-EXP-42
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Badania obserwacyjne
-
Radicle ScienceAktywny, nie rekrutującyFunkcja poznawczaStany Zjednoczone
-
Radicle ScienceAktywny, nie rekrutujący
-
Apple Inc.Stanford UniversityZakończonyMigotanie przedsionków | Zaburzenia rytmu serca | Trzepotanie przedsionkówStany Zjednoczone
-
Radicle ScienceZakończonyDepresja | Ból | Spać | LękStany Zjednoczone
-
University of MichiganZakończony
-
University of MichiganZakończonyTelemedycynaStany Zjednoczone
-
Radicle ScienceZakończony
-
Radicle ScienceAktywny, nie rekrutującyFunkcja poznawczaStany Zjednoczone
-
St. Joseph's Healthcare HamiltonZawieszony
-
Digisight Technologies, Inc.NieznanyRetinopatia cukrzycowa | Zwyrodnienie plamki żółtej związane z wiekiem | MetamorfopsjaStany Zjednoczone