Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Sygnatury transkryptomiczne w gruczolakoraku żołądka (GAC)

8 kwietnia 2022 zaktualizowane przez: raghavendra, Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Badanie sygnatur transkryptomicznych i ich znaczenia w gruczolakoraku żołądka

Gruczolakorak żołądka (GAC), stanowiący główny odsetek wszystkich nowotworów złośliwych żołądka, wiąże się ze słabym całkowitym przeżyciem na poziomie 25-30%, pomimo postępu w strategiach leczenia. Uważa się, że kilka czynników związanych z mikrośrodowiskiem guza (TME) odgrywa ważną rolę w powstawaniu nowotworów i nabytej chemooporności na terapie, które nie są inaczej uwzględnione w kompleksowej klasyfikacji molekularnej GAC podanej przez TCGA i ACRG. W niniejszym badaniu badacze zamierzają przeprowadzić profilowanie transkryptomu tkanki nowotworowej GAC i sąsiedniej prawidłowej tkanki w celu zbadania różnicowej ekspresji genów między tymi dwoma w odniesieniu do TME, co może pomóc w identyfikacji sygnatur genowych, które są klinicznie istotne z wynikiem przeżycia w gruczolakoraku żołądka.

Przegląd badań

Status

Rekrutacyjny

Szczegółowy opis

To badanie dotyczące gruczolakoraka żołądka jest retrospektywne i prospektywne, które zostanie przeprowadzone w SGPGIMS, Lucknow, Indie. Do badania zostaną zakwalifikowani pacjenci poddawani resekcji żołądka na oddziale gastroenterologii chirurgicznej, u których na podstawie biopsji endoskopowej w oddziale patologii rozpoznano GAC. Do retrospektywnej części badania przypadki zostaną wybrane na podstawie wyników badań histologicznych pobranych ze szpitalnego systemu informacyjnego i dokumentacji pacjentów.

W celu pobrania próbek świeże, wycięte chirurgicznie próbki zostaną pobrane w RNAlater i przechowywane w temperaturze -80⁰C. Zarchiwizowane bloczki tkankowe utrwalone w formalinie zatopione w parafinie (FFPE) dla przypadków retrospektywnych zostaną odzyskane i poddane przeglądowi histopatologicznemu. Po potwierdzeniu rozpoznania GAC, tkanki zostaną poddane obróbce w celu uzyskania tkanki guza i prawidłowej do części doświadczalnej.

RNA z guza i normalnego obszaru zostanie wyekstrahowane z bloków FFPE i świeżych próbek tkanek. Całe transkryptomiczne sekwencjonowanie nowej generacji zostanie przeprowadzone po udanej kontroli jakości, przygotowaniu biblioteki i amplifikacji. Dane dotyczące ekspresji genów uzyskane z sekwencjonowania zostaną poddane analizie bioinformatycznej w celu wyjaśnienia różnic w ekspresji genów między guzem a sąsiadującą normalną tkanką w odniesieniu do TME. Geny o znacznie zróżnicowanej ekspresji między guzem a normalnymi obszarami zostaną opisane i zidentyfikowane przy użyciu pakietów bioinformatycznych do adnotacji genów. Za pomocą analizy statystycznej geny ulegające zróżnicowanej ekspresji zostaną skorelowane z cechami klinicznymi pacjenta i wynikiem, aby zidentyfikować geny TME o istotnej wartości prognostycznej.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Oczekiwany)

48

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Kopia zapasowa kontaktu do badania

Lokalizacje studiów

    • Uttar Pradesh
      • Lucknow, Uttar Pradesh, Indie, 226014

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

18 lat do 80 lat (Dorosły, Starszy dorosły)

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie dotyczy

Płeć kwalifikująca się do nauki

Wszystko

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Osoby, u których zdiagnozowano dystalnego gruczolakoraka żołądka w SGPGIMS, zostaną zrekrutowane do tego badania

Opis

Kryteria przyjęcia:

  • Chorzy z guzem umiejscowionym w dystalnej części żołądka
  • Pacjenci, u których wykonano całkowitą lub częściową resekcję żołądka po badaniu biopsyjnym
  • Dostępność kontynuacji na oddziale Radioterapii lub Gastro
  • Dostępność próbek tkanek z gastrektomii FFPE wybranych przypadków w histopatologii

Kryteria wyłączenia:

  • Chorzy z guzem umiejscowionym w proksymalnej części żołądka
  • Pacjenci z dostępną tylko biopsją
  • Pacjenci, których obserwacja nie jest dostępna
  • Niedostępność bloków tkankowych FFPE

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Interwencja / Leczenie
Pacjenci z gruczolakorakiem żołądka
Do badania zostaną włączeni pacjenci z guzem umiejscowionym w dystalnej części żołądka, którzy przeszli całkowitą lub częściową resekcję żołądka po wykonaniu biopsji z możliwością obserwacji i archiwizacji tkanki FFPE.
Badanie sygnatur transkryptomicznych związanych z mikrośrodowiskiem guza odgrywającym istotną rolę w rokowaniu chorych na gruczolakoraka żołądka

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Profilowanie transkryptomu gruczolakoraka żołądka
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
Uzyskanie danych dotyczących ekspresji genów w tkance nowotworowej i prawidłowej poprzez sekwencjonowanie RNA
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
Różnicowa analiza ekspresji genów w gruczolakoraku żołądka
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
Określenie zróżnicowanej ekspresji genu między guzem a normalną tkanką poprzez bioinformatyczną analizę danych dotyczących ekspresji genów
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
Wpływ mikrośrodowiska guza na profil ekspresji genów gruczolakoraka żołądka
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
Identyfikacja genów związanych z mikrośrodowiskiem guza i ich adnotacja funkcjonalna przy użyciu pakietów bioinformatycznych
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
Korelacja genów związanych z mikrośrodowiskiem guza z cechami klinicznymi pacjenta
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
Aby skorelować różnie wyrażany gen związany z mikrośrodowiskiem guza z wynikami u pacjentów, aby zidentyfikować geny istotnie związane z całkowitym przeżyciem
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat

Miary wyników drugorzędnych

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Stratyfikacja ryzyka pacjentów na podstawie korelacji między ekspresją genów a całkowitym przeżyciem
Ramy czasowe: Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat
Aby stratyfikować pacjentów na podstawie sygnatur genów związanych z całkowitym przeżyciem u pacjentów z gruczolakorakiem żołądka
Zakres rekrutacji pacjentów od 6 miesięcy do 5 lat

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Śledczy

  • Główny śledczy: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

6 sierpnia 2021

Zakończenie podstawowe (Oczekiwany)

6 kwietnia 2025

Ukończenie studiów (Oczekiwany)

6 października 2025

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

31 marca 2022

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

31 marca 2022

Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)

8 kwietnia 2022

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)

15 kwietnia 2022

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

8 kwietnia 2022

Ostatnia weryfikacja

1 kwietnia 2022

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

NIE

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

Badania kliniczne na Badania obserwacyjne

3
Subskrybuj