Assinaturas transcriptômicas no adenocarcinoma gástrico (GAC)
8 de abril de 2022 atualizado por: raghavendra, Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences
Explorando as assinaturas transcriptômicas e sua relevância no adenocarcinoma gástrico
O adenocarcinoma gástrico (GAC), responsável pela maior porcentagem de todas as malignidades estomacais, está associado a uma sobrevida global ruim de 25-30%, apesar do avanço nas estratégias de tratamento.
Acredita-se que vários fatores associados ao microambiente tumoral (TME) desempenhem um papel importante na tumorigênese e na quimiorresistência adquirida a terapias que não são abordadas pela classificação molecular abrangente de GAC dada por TCGA e ACRG.
No presente estudo, os investigadores pretendem fazer o perfil do transcriptoma do tecido tumoral GAC e tecido normal adjacente para investigar genes diferencialmente expressos entre os dois em relação ao TME, o que pode ajudar na identificação de assinaturas gênicas clinicamente relevantes com o resultado de sobrevida no adenocarcinoma gástrico.
Visão geral do estudo
Status
Recrutamento
Condições
Intervenção / Tratamento
Descrição detalhada
Este estudo sobre o adenocarcinoma gástrico é retrospectivo e prospectivo e será realizado no SGPGIMS, Lucknow, Índia. Os pacientes submetidos à ressecção gástrica no departamento de gastroenterologia cirúrgica que são diagnosticados com GAC com base na biópsia endoscópica no departamento de patologia serão recrutados para o estudo. Para a parte retrospectiva do estudo, os casos serão selecionados com base nos achados histológicos recuperados do sistema de informações hospitalares e dos prontuários dos pacientes.
Para coleta de amostras, espécimes frescos ressecados cirurgicamente serão coletados em RNAlater e armazenados a -80⁰C. Blocos de tecido arquivados fixados em formalina e embebidos em parafina (FFPE) para casos retrospectivos serão recuperados e revisados histopatologicamente. Após a confirmação do diagnóstico de GAC, os tecidos serão processados para obtenção de tecido tumoral e normal para a parte experimental.
O RNA do tumor e da área normal será extraído de blocos FFPE e espécimes de tecido fresco. Todo o sequenciamento transcriptômico de próxima geração será realizado após verificação de qualidade bem-sucedida, preparação da biblioteca e amplificação. Os dados de expressão gênica obtidos a partir do sequenciamento serão analisados bioinformaticamente para elucidar a expressão gênica diferencial entre tumor e tecido normal adjacente em relação ao TME. Os genes significativamente expressos diferencialmente entre o tumor e as áreas normais serão anotados e identificados usando pacotes de bioinformática para anotação de genes. Usando análise estatística, os genes diferencialmente expressos serão correlacionados com as características clínicas do paciente e resultados para identificar genes TME com valor prognóstico significativo.
Tipo de estudo
Observacional
Inscrição (Antecipado)
48
Contactos e Locais
Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.
Contato de estudo
- Nome: Raghavendra Lingaiah
- Número de telefone: +91-522-2494250
- E-mail: raghulingaiah@gmail.com
Estude backup de contato
- Nome: Shalini Singh
- E-mail: shal_singh@yahoo.co.uk
Locais de estudo
-
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Uttar Pradesh
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Lucknow, Uttar Pradesh, Índia, 226014
- Recrutamento
- Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences
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Contato:
- Raghavendra Lingaiah
- Número de telefone: +91-522-2494250
- E-mail: raghulingaiah@gmail.com
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Contato:
- Shalini Singh
- E-mail: shal_singh@yahoo.co.uk
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Critérios de participação
Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
18 anos a 80 anos (Adulto, Adulto mais velho)
Aceita Voluntários Saudáveis
N/D
Gêneros Elegíveis para o Estudo
Tudo
Método de amostragem
Amostra Não Probabilística
População do estudo
Indivíduos diagnosticados com adenocarcinoma gástrico distal na SGPGIMS serão recrutados para este estudo
Descrição
Critério de inclusão:
- Pacientes com origem de tumor na parte distal do estômago
- Pacientes submetidos a Gastrectomia Total ou Parcial após Exame de Biópsia
- Disponibilidade de acompanhamento no departamento de Radioterapia ou Gastro
- Disponibilidade de tecido de amostra de gastrectomia FFPE de casos selecionados em Histopatologia
Critério de exclusão:
- Pacientes com origem de tumor na parte proximal do estômago
- Pacientes com apenas biópsia disponível
- Pacientes cujo seguimento não está disponível
- Indisponibilidade de blocos de tecido FFPE
Plano de estudo
Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
Intervenção / Tratamento |
|---|---|
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Pacientes com Adenocarcinoma Gástrico
Serão considerados para este estudo pacientes com origem tumoral na parte distal do estômago submetidos a gastrectomia total ou parcial após exame de biópsia com disponibilidade de seguimento e tecido FFPE arquivado.
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Exploração de assinaturas transcriptômicas relacionadas ao microambiente tumoral tendo um papel significativo no prognóstico de pacientes com adenocarcinoma gástrico
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Perfil transcritoma de adenocarcinoma gástrico
Prazo: Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Obter dados de expressão gênica de tecidos cancerosos e normais por meio de sequenciamento de RNA
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Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Análise da expressão gênica diferencial no adenocarcinoma gástrico
Prazo: Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Determinar gene diferencialmente expresso entre tumor e tecido normal por meio de análise bioinformática de dados de expressão gênica
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Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Influência do microambiente tumoral no perfil de expressão gênica do adenocarcinoma gástrico
Prazo: Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Identificar genes relacionados ao microambiente tumoral e sua anotação funcional usando pacotes bioinformáticos
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Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Correlação de genes relacionados ao microambiente tumoral com as características clínicas do paciente
Prazo: Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Correlacionar o gene relacionado ao microambiente do tumor expresso diferencialmente com o resultado em pacientes para identificar genes significativamente relacionados com a sobrevida global
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Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
|---|---|---|
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Estratificação de risco do paciente com base na correlação entre expressão gênica e sobrevida global
Prazo: Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Estratificar pacientes com base em assinaturas gênicas relacionadas à sobrevida global em pacientes com adenocarcinoma gástrico
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Intervalo de 6 meses a 5 anos de recrutamento de pacientes
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Colaboradores e Investigadores
É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.
Investigadores
- Investigador principal: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS
Publicações e links úteis
A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.
Publicações Gerais
- Ahn B, Chae YS, Kim CH, Lee Y, Lee JH, Kim JY. Tumor microenvironmental factors have prognostic significances in advanced gastric cancer. APMIS. 2018 Oct;126(10):814-821. doi: 10.1111/apm.12889.
- Zhang S, Zeng Z, Liu Y, Huang J, Long J, Wang Y, Peng X, Hu Z, Ouyang Y. Prognostic landscape of tumor-infiltrating immune cells and immune-related genes in the tumor microenvironment of gastric cancer. Aging (Albany NY). 2020 Sep 23;12(18):17958-17975. doi: 10.18632/aging.103519. Epub 2020 Sep 23.
- Qiu XT, Song YC, Liu J, Wang ZM, Niu X, He J. Identification of an immune-related gene-based signature to predict prognosis of patients with gastric cancer. World J Gastrointest Oncol. 2020 Aug 15;12(8):857-876. doi: 10.4251/wjgo.v12.i8.857.
- Ren N, Liang B, Li Y. Identification of prognosis-related genes in the tumor microenvironment of stomach adenocarcinoma by TCGA and GEO datasets. Biosci Rep. 2020 Oct 30;40(10):BSR20200980. doi: 10.1042/BSR20200980.
- Cai WY, Dong ZN, Fu XT, Lin LY, Wang L, Ye GD, Luo QC, Chen YC. Identification of a Tumor Microenvironment-relevant Gene set-based Prognostic Signature and Related Therapy Targets in Gastric Cancer. Theranostics. 2020 Jul 9;10(19):8633-8647. doi: 10.7150/thno.47938. eCollection 2020.
- Li T, Gao X, Han L, Yu J, Li H. Identification of hub genes with prognostic values in gastric cancer by bioinformatics analysis. World J Surg Oncol. 2018 Jun 19;16(1):114. doi: 10.1186/s12957-018-1409-3.
Datas de registro do estudo
Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
6 de agosto de 2021
Conclusão Primária (Antecipado)
6 de abril de 2025
Conclusão do estudo (Antecipado)
6 de outubro de 2025
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
31 de março de 2022
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
31 de março de 2022
Primeira postagem (Real)
8 de abril de 2022
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
15 de abril de 2022
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
8 de abril de 2022
Última verificação
1 de abril de 2022
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Palavras-chave
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- 2021-240-PhD-EXP-42
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
NÃO
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Não
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
Não
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