Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Транскриптомные подписи при аденокарциноме желудка (GAC)

8 апреля 2022 г. обновлено: raghavendra, Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Изучение транскриптомных сигнатур и их значимости при аденокарциноме желудка

Аденокарцинома желудка (GAC), составляющая основной процент всех злокачественных новообразований желудка, связана с плохой общей выживаемостью 25-30%, несмотря на прогресс в стратегиях лечения. Считается, что несколько факторов, связанных с микроокружением опухоли (TME), играют важную роль в онкогенезе и приобретенной химиорезистентности к терапии, которые иначе не рассматриваются в комплексной молекулярной классификации GAC, представленной TCGA и ACRG. В настоящем исследовании исследователи намереваются провести профилирование транскриптома опухолевой ткани GAC и прилегающей нормальной ткани, чтобы исследовать дифференциально экспрессируемые гены между ними в отношении TME, что может помочь в идентификации генных сигнатур, которые клинически значимы для выживаемости при аденокарциноме желудка.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Вмешательство/лечение

Подробное описание

Это исследование аденокарциномы желудка является ретроспективным, а также проспективным, которое будет проводиться в SGPGIMS, Лакхнау, Индия. К исследованию будут привлечены пациенты, перенесшие резекцию желудка в отделении хирургической гастроэнтерологии, у которых на основании эндоскопической биопсии в отделении патологии диагностирован ГАК. Для ретроспективной части исследования случаи будут отобраны на основе гистологических данных, полученных из информационной системы больницы и историй болезни.

Для сбора образцов свежие образцы, удаленные хирургическим путем, будут собраны в RNAlater и храниться при температуре -80⁰C. Архивные блоки тканей, залитые в парафин, фиксированные формалином (FFPE), для ретроспективных случаев будут извлечены и изучены гистопатологически. После подтверждения диагноза GAC ткани будут обработаны для получения опухолевых и нормальных тканей для экспериментальной части.

РНК из опухоли и нормальной области будет извлечена из блоков FFPE и свежих образцов тканей. Полное транскриптомное секвенирование следующего поколения будет выполнено после успешной проверки качества, подготовки библиотеки и амплификации. Данные об экспрессии генов, полученные в результате секвенирования, будут подвергнуты биоинформационному анализу для выяснения дифференциальной экспрессии генов между опухолью и соседними нормальными тканями в отношении TME. Значительно дифференциально выраженные гены между опухолевыми и нормальными областями будут аннотированы и идентифицированы с использованием биоинформационных пакетов для аннотации генов. Используя статистический анализ, дифференциально выраженные гены будут коррелировать с клиническими особенностями пациента и исходом, чтобы идентифицировать гены TME со значительной прогностической ценностью.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Ожидаемый)

48

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

  • Имя: Raghavendra Lingaiah
  • Номер телефона: +91-522-2494250
  • Электронная почта: raghulingaiah@gmail.com

Учебное резервное копирование контактов

Места учебы

  • Индия
    • Uttar Pradesh
      • Lucknow, Uttar Pradesh, Индия, 226014
        • Рекрутинг
        • Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences
        • Контакт:
          • Raghavendra Lingaiah
          • Номер телефона: +91-522-2494250
          • Электронная почта: raghulingaiah@gmail.com
        • Контакт:

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

От 18 лет до 80 лет (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Н/Д

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Субъекты с диагнозом дистальная аденокарцинома желудка в SGPGIMS будут набраны для этого исследования.

Описание

Критерии включения:

  • Пациенты с происхождением опухоли в дистальном отделе желудка
  • Пациенты, перенесшие тотальную или частичную гастрэктомию после биопсии
  • Возможность последующего наблюдения в отделении лучевой терапии или желудочно-кишечного тракта
  • Доступность образца ткани FFPE гастрэктомии в отдельных случаях в гистопатологии

Критерий исключения:

  • Пациенты с происхождением опухоли в проксимальном отделе желудка
  • Пациенты, которым доступна только биопсия
  • Пациенты, чье последующее наблюдение недоступно
  • Недоступность тканевых блоков FFPE

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Вмешательство/лечение
Пациенты с аденокарциномой желудка
Для этого исследования будут рассматриваться пациенты с происхождением опухоли в дистальном отделе желудка, перенесшие тотальную или частичную гастрэктомию после биопсии с наличием последующего наблюдения и архивной ткани FFPE.
Диагностический тест: Наблюдательное исследование
Изучение транскриптомных сигнатур, связанных с микроокружением опухоли, играющих важную роль в прогнозе у пациентов с аденокарциномой желудка

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Транскриптомное профилирование аденокарциномы желудка
Временное ограничение: Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет
Для получения данных об экспрессии генов раковой и нормальной ткани с помощью секвенирования РНК.
Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет
Дифференциальный анализ экспрессии генов при аденокарциноме желудка
Временное ограничение: Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет
Для определения дифференциально экспрессируемого гена между опухолью и нормальной тканью посредством биоинформационного анализа данных экспрессии генов.
Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет
Влияние микроокружения опухоли на профиль экспрессии генов аденокарциномы желудка
Временное ограничение: Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет
Идентифицировать гены, связанные с микроокружением опухоли, и их функциональную аннотацию с использованием биоинформационных пакетов.
Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет
Корреляция генов, связанных с микроокружением опухоли, с клиническими особенностями пациента
Временное ограничение: Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет
Сопоставить дифференциально экспрессированный ген, связанный с микроокружением опухоли, с исходом у пациентов, чтобы идентифицировать гены, значительно связанные с общей выживаемостью.
Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет

Вторичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Стратификация риска пациента на основе корреляции между экспрессией генов и общей выживаемостью
Временное ограничение: Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет
Стратифицировать пациентов на основе сигнатур генов, связанных с общей выживаемостью у пациентов с аденокарциномой желудка.
Диапазон набора пациентов от 6 месяцев до 5 лет

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Следователи

  • Главный следователь: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS

Публикации и полезные ссылки

Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.

Общие публикации

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

6 августа 2021 г.

Первичное завершение (Ожидаемый)

6 апреля 2025 г.

Завершение исследования (Ожидаемый)

6 октября 2025 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

31 марта 2022 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

31 марта 2022 г.

Первый опубликованный (Действительный)

8 апреля 2022 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

15 апреля 2022 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

8 апреля 2022 г.

Последняя проверка

1 апреля 2022 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • 2021-240-PhD-EXP-42

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

НЕТ

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться