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위 선암종의 전사 서명 (GAC)

2022년 4월 8일 업데이트: raghavendra, Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

위 선암종에서 Transcriptomic Signatures 및 관련성 탐색

모든 위 악성 종양의 주요 비율을 차지하는 위 선암(GAC)은 치료 전략의 발전에도 불구하고 전체 생존율이 25-30%로 낮습니다. 종양 미세 환경(TME)과 관련된 몇 가지 요인은 종양 형성 및 TCGA 및 ACRG에 의해 제공된 GAC의 포괄적인 분자 분류에 의해 다루어지지 않는 요법에 대한 후천적 화학 저항성에 중요한 역할을 하는 것으로 생각됩니다. 현재 연구에서 조사관은 GAC 종양 조직과 인접한 정상 조직의 전사체 프로파일링을 수행하여 위 선암종의 생존 결과와 임상적으로 관련된 유전자 서명을 식별하는 데 도움이 될 수 있는 TME와 관련하여 둘 사이에서 차등적으로 발현된 유전자를 조사하려고 합니다.

연구 개요

상태

모병

정황

개입 / 치료

상세 설명

위 선암종에 대한 이 연구는 인도 러크나우의 SGPGIMS에서 수행될 전향적일 뿐만 아니라 후향적입니다. 병리과에서 내시경 생검을 통해 GAC로 진단된 외과적 소화기내과에서 위절제술을 받는 환자를 모집한다. 연구의 후향적 부분에서는 병원 정보 시스템 및 환자 기록에서 검색된 조직학적 소견을 기반으로 사례를 선택합니다.

샘플 수집을 위해 외과적으로 절제된 신선한 표본을 RNAlater에서 수집하고 -80⁰C에 보관합니다. 후향적 사례를 위해 보관된 FFPE(포르말린 고정 파라핀 내장) 조직 블록을 검색하고 조직병리학적으로 검토합니다. GAC로 확진된 후 조직을 가공하여 실험용 종양 및 정상 조직을 얻는다.

종양 및 정상 영역의 RNA는 FFPE 블록 및 신선한 조직 표본에서 추출됩니다. 전체 transcriptomic next generation 시퀀싱은 성공적인 품질 검사, 라이브러리 준비 및 증폭 후에 수행됩니다. 시퀀싱에서 얻은 유전자 발현 데이터는 TME와 관련하여 종양과 인접한 정상 조직 사이의 차등 유전자 발현을 밝히기 위해 생물정보학적으로 분석될 것입니다. 종양과 정상 영역 사이에서 현저하게 차등적으로 발현된 유전자는 유전자 주석을 위한 생물정보학 패키지를 사용하여 주석을 달고 식별할 것입니다. 통계적 분석을 사용하여 차별적으로 발현된 유전자는 환자의 임상적 특징 및 결과와 상관관계가 있어 상당한 예후 가치가 있는 TME 유전자를 식별할 것입니다.

연구 유형

관찰

등록 (예상)

48

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 연락처

연구 연락처 백업

연구 장소

  • 인도
    • Uttar Pradesh
      • Lucknow, Uttar Pradesh, 인도, 226014
        • 모병
        • Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences
        • 연락하다:
        • 연락하다:

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

18년 (성인, 고령자)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

해당 없음

연구 대상 성별

모두

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

SGPGIMS에서 원위 위 선암으로 진단된 피험자는 이 연구를 위해 모집됩니다.

설명

포함 기준:

  • 위 원위부에 종양이 있는 환자
  • 생검 검사 후 전체 또는 부분 위절제술을 시행한 환자
  • 방사선 요법 또는 위장관에서 후속 조치 가능
  • 조직 병리학에서 선택된 사례의 FFPE 위 절제술 표본 조직의 가용성

제외 기준:

  • 위 근위부에 종양이 있는 환자
  • 생검만 가능한 환자
  • 추적 관찰이 불가능한 환자
  • FFPE 조직 블록을 사용할 수 없음

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

코호트 및 개입

그룹/코호트
개입 / 치료
위선암 환자
추적 관찰 및 보관된 FFPE 조직의 이용 가능성이 있는 생검 검사 후 전체 또는 부분 위절제술을 받은 위 원위부에 종양이 있는 환자가 이 연구에 고려될 것입니다.
진단 검사: 관찰 연구
위 선암종 환자의 예후에 중요한 역할을 하는 종양 미세 환경과 관련된 transcriptomic 서명 탐색

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
위 선암종의 전사체 프로파일링
기간: 환자 모집 기간 6개월~5년 범위
RNA - sequencing을 통한 암 및 정상 조직의 유전자 발현 데이터 획득
환자 모집 기간 6개월~5년 범위
위 선암종에서의 차등 유전자 발현 분석
기간: 환자 모집 기간 6개월~5년 범위
유전자 발현 데이터의 생물정보학적 분석을 통해 종양과 정상 조직 사이에 차별적으로 발현되는 유전자를 결정
환자 모집 기간 6개월~5년 범위
위 선암의 유전자 발현 프로파일에 대한 종양 미세 환경의 영향
기간: 환자 모집 기간 6개월~5년 범위
생물정보학 패키지를 이용하여 종양미세환경 관련 유전자 및 그 기능적 주석을 확인
환자 모집 기간 6개월~5년 범위
종양 미세환경 관련 유전자와 환자의 임상적 특징의 상관관계
기간: 환자 모집 기간 6개월~5년 범위
차등적으로 발현된 종양 미세환경 관련 유전자와 환자의 결과를 연관시켜 전체 생존과 유의미하게 관련된 유전자를 식별하기 위해
환자 모집 기간 6개월~5년 범위

2차 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
유전자 발현과 전체 생존 사이의 상관관계에 기반한 환자 위험 계층화
기간: 환자 모집 기간 6개월~5년 범위
위 선암종 환자의 전체 생존과 관련된 유전자 서명을 기반으로 환자를 계층화하기 위해
환자 모집 기간 6개월~5년 범위

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

스폰서

Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

수사관

  • 수석 연구원: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS

간행물 및 유용한 링크

연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.

일반 간행물

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2021년 8월 6일

기본 완료 (예상)

2025년 4월 6일

연구 완료 (예상)

2025년 10월 6일

연구 등록 날짜

최초 제출

2022년 3월 31일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2022년 3월 31일

처음 게시됨 (실제)

2022년 4월 8일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2022년 4월 15일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2022년 4월 8일

마지막으로 확인됨

2022년 4월 1일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

키워드

추가 관련 MeSH 약관

기타 연구 ID 번호

  • 2021-240-PhD-EXP-42

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

아니요

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .

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