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Firme trascrittomiche nell'adenocarcinoma gastrico (GAC)

8 aprile 2022 aggiornato da: raghavendra, Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Esplorando le firme trascrittomiche e la loro rilevanza nell'adenocarcinoma gastrico

L'adenocarcinoma gastrico (GAC) che rappresenta la percentuale maggiore di tutte le neoplasie dello stomaco è associato a una scarsa sopravvivenza globale del 25-30% nonostante l'avanzamento delle strategie di trattamento. Si ritiene che diversi fattori associati al microambiente tumorale (TME) svolgano un ruolo importante nella tumorigenesi e nella chemioresistenza acquisita alle terapie che non sono altrimenti affrontate dalla classificazione molecolare completa del GAC fornita da TCGA e ACRG. Nel presente studio i ricercatori intendono eseguire la profilazione del trascrittoma del tessuto tumorale GAC e del tessuto normale adiacente per studiare i geni differenzialmente espressi tra i due in relazione al TME che potrebbero aiutare nell'identificazione delle firme geniche che sono clinicamente rilevanti con l'esito di sopravvivenza nell'adenocarcinoma gastrico.

Panoramica dello studio

Stato

Reclutamento

Condizioni

Intervento / Trattamento

Descrizione dettagliata

Questo studio sull'adenocarcinoma gastrico è retrospettivo e prospettico che sarà condotto presso SGPGIMS, Lucknow, India. Saranno reclutati per lo studio i pazienti sottoposti a resezione gastrica presso il dipartimento di gastroenterologia chirurgica a cui viene diagnosticata GAC ​​sulla base della biopsia endoscopica nel dipartimento di patologia. Per la parte retrospettiva dello studio, i casi saranno selezionati sulla base dei risultati istologici recuperati dal sistema informativo ospedaliero e dalle cartelle cliniche dei pazienti.

Per la raccolta dei campioni, i campioni freschi resecati chirurgicamente saranno raccolti in RNA successivamente e conservati a -80⁰C. I blocchi di tessuto archiviati in formalina fissati in paraffina (FFPE) per casi retrospettivi saranno recuperati e rivisti istopatologicamente. Dopo una diagnosi confermata di GAC, i tessuti saranno processati per ottenere tessuto tumorale e normale per la parte sperimentale.

L'RNA dall'area tumorale e normale sarà estratto da blocchi FFPE e campioni di tessuto fresco. Il sequenziamento dell'intero trascrittomico di nuova generazione verrà eseguito dopo il successo del controllo di qualità, la preparazione della libreria e l'amplificazione. I dati di espressione genica ottenuti dal sequenziamento saranno analizzati bioinformaticamente per chiarire l'espressione genica differenziale tra tumore e tessuto normale adiacente in relazione alla TME. I geni differenzialmente espressi in modo significativo tra le aree tumorali e normali saranno annotati e identificati utilizzando pacchetti bioinformatici per l'annotazione genica. Utilizzando l'analisi statistica, i geni differenzialmente espressi saranno correlati con le caratteristiche cliniche e l'esito del paziente per identificare i geni TME con valore prognostico significativo.

Tipo di studio

Osservativo

Iscrizione (Anticipato)

48

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Backup dei contatti dello studio

Luoghi di studio

  • India
    • Uttar Pradesh
      • Lucknow, Uttar Pradesh, India, 226014

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

Da 18 anni a 80 anni (Adulto, Adulto più anziano)

Accetta volontari sani

N/A

Sessi ammissibili allo studio

Tutto

Metodo di campionamento

Campione non probabilistico

Popolazione di studio

I soggetti con diagnosi di adenocarcinoma gastrico distale presso SGPGIMS saranno reclutati per questo studio

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Pazienti con origine di tumore nella parte distale dello stomaco
  • Pazienti sottoposti a gastrectomia totale o parziale dopo esame bioptico
  • Disponibilità di follow-up nel reparto di Radioterapia o Gastro
  • Disponibilità di tessuto campione di gastrectomia FFPE di casi selezionati in istopatologia

Criteri di esclusione:

  • Pazienti con origine di tumore nella parte prossimale dello stomaco
  • Pazienti con solo biopsia disponibile
  • Pazienti il ​​cui follow-up non è disponibile
  • Indisponibilità di blocchi di tessuto FFPE

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

Coorti e interventi

Gruppo / Coorte
Intervento / Trattamento
Pazienti con adenocarcinoma gastrico
Per questo studio saranno presi in considerazione i pazienti con origine del tumore nella parte distale dello stomaco sottoposti a gastrectomia totale o parziale dopo esame bioptico con disponibilità di follow-up e tessuto FFPE archiviato.
Test diagnostico: Studio osservazionale
Esplorazione delle firme trascrittomiche correlate al microambiente tumorale che hanno un ruolo significativo nella prognosi dei pazienti con adenocarcinoma gastrico

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Profilazione del trascrittoma dell'adenocarcinoma gastrico
Lasso di tempo: Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti
Ottenere dati di espressione genica di tessuto canceroso e normale attraverso il sequenziamento dell'RNA
Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti
Analisi dell'espressione genica differenziale nell'adenocarcinoma gastrico
Lasso di tempo: Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti
Determinare il gene differenzialmente espresso tra tumore e tessuto normale attraverso l'analisi bioinformatica dei dati di espressione genica
Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti
Influenza del microambiente tumorale sul profilo di espressione genica dell'adenocarcinoma gastrico
Lasso di tempo: Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti
Identificare i geni correlati al microambiente tumorale e la loro annotazione funzionale utilizzando pacchetti bioinformatici
Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti
Correlazione dei geni correlati al microambiente tumorale con le caratteristiche cliniche del paziente
Lasso di tempo: Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti
Correlare il gene correlato al microambiente tumorale espresso in modo differenziato con l'esito nei pazienti per identificare i geni significativamente correlati alla sopravvivenza globale
Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Stratificazione del rischio del paziente basata sulla correlazione tra espressione genica e sopravvivenza globale
Lasso di tempo: Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti
Stratificare i pazienti in base alle firme geniche correlate alla sopravvivenza globale nei pazienti con adenocarcinoma gastrico
Intervallo da 6 mesi a 5 anni di reclutamento dei pazienti

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Sponsor

Sanjay Gandhi Postgraduate Institute of Medical Sciences

Investigatori

  • Investigatore principale: Raghavendra Lingaiah, SGPGIMS

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Pubblicazioni generali

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

6 agosto 2021

Completamento primario (Anticipato)

6 aprile 2025

Completamento dello studio (Anticipato)

6 ottobre 2025

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

31 marzo 2022

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

31 marzo 2022

Primo Inserito (Effettivo)

8 aprile 2022

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

15 aprile 2022

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

8 aprile 2022

Ultimo verificato

1 aprile 2022

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Parole chiave

Termini MeSH pertinenti aggiuntivi

Altri numeri di identificazione dello studio

  • 2021-240-PhD-EXP-42

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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