ニューモシスチス・ジロベシにおける耐性関連SNPの検出のためのドロップレットデジタルPCRおよびPCRフリーBIOSセンサー (DDBIOS)

ニューモシスチス ジロベシ (P. jirovecii) は、免疫不全患者における肺感染症またはニューモシスチス肺炎 (PCP) の原因となる日和見病原性真菌です。 現在、その体外培養のためのシステムはありません。 使用される診断方法は主に分子生物学技術に基づいており、特に PCP の予防と治療に広く使用されている分子の標的をコードする遺伝子レベルでの一塩基多型 (SNP) の検出と分析も可能です。 これらの SNP は、治療抵抗性に潜在的に関連するミスセンス変異を表している可能性があります。 これらは、P. jirovecii 感染が発症する前に患者がこれらの治療にさらされたことによって生じる可能性があります。 しかし、これらの変異の有病率に関するデータは、特にフランスでは依然として不足している。 PCR とそれに続く DNA 配列決定に基づいてこれらの変異を検出する方法には、感度の点で限界があります。 これに関連して、病原体の検出と特性評価のための、より高感度で迅速な新しいツールの評価が必要です。

提案された研究の主な目的は、ジヒドロプテロ酸シンターゼ (DHPS)、ジヒドロ葉酸還元酵素 (DHFR)、シトクロム b (CYB)、イノシン-5'-一リン酸デヒドロゲナーゼ (IMPDH) などの治療標的をコードする 4 つの遺伝子における P. jirovecii 変異株を同定することです。 ）したがって、P. jirovecii に感染した患者における潜在的な耐性株の有病率を評価するためです。

二次的な目標は次のとおりです。

• 関連する要因を特定するため（例: 変異型 P. jirovecii 株による治療への曝露）
• 抗ニューモシスチス治療の有効性に対する突然変異の影響を判断するため（例: 感染症の有利な展開と不利な展開)
• ニューモシスチス・ジロベシイの耐性に関連する変異の検出と特性評価のための2つの方法（デジタル液滴PCRとPCRを使用しないバイオセンサー）を評価する