奇形を伴う神経発達障害におけるゲノム変異の同定と優先順位付けのためのトランスクリプトームアプローチ (ATOMICS)
フランスでは300万人が希少疾患に罹患している。 フランス保健当局によると、今日特定されている7,000のさまざまな病気の中で、神経発達障害は、毎年3万5,000人の出生で発見されている主な症状である。 これらの症例の半数では、患者は 5 歳未満であり、分子診断が利用できるのは 50% のみであり、すべての患者の 25% で 5 年を超える診断の迷走が伴います。
ハイスループット DNA シーケンス技術は、新たな原因となる変異を解明するための強力なツールです。 診断率は DNA-seq によって改善されましたが、データ解釈と技術の限界が依然として克服する必要がある 2 つの大きな障害となっています。 ゲノムアプローチだけでは分子診断を見逃すことは、リボ核酸配列決定などのマルチオミックアプローチを統合する必要性を浮き彫りにします。 この配列レベルにより、異常な遺伝子発現、単一対立遺伝子の対立遺伝子発現、または異常な選択的スプライシングの証拠などの新たな洞察が可能になります。 ゲノム配列決定だけでは発見できない変異体の検出も可能になります。
最近、2 つの技術の連携による診断性能の向上が報告されています。 神経筋疾患におけるリボ核酸配列およびゲノム配列決定。 しかし、奇形的特徴に加えて神経発達障害に関して行われた研究はわずかしかありませんでした。 当社は、2022年末までに、以前にエクソーム解析が陰性だった患者に対してゲノム配列決定とリボ核酸配列を同時に実行することにより、診断結果が向上することを実証しました。 さらに 2023 年には、Dekker et al.この研究は、同じ分析スキーマを介して診断収率の向上に光を当てました。
これらの最初の観察に直面して、我々の研究は、ゲノム配列決定とトリオ方式で組み合わせたリボ核酸配列とゲノム配列決定の単独方式の診断への寄与を評価し、神経発達障害を呈する患者の最終診断を特定することを目的としている。発育異常があり、染色体マイクロアレイおよび/またはエクソーム配列解析後に明確な診断が得られない場合。
研究を成功裏に実施するために、最小限のリスクと最小限の制約で検討されたプロトコールで患者を募集し、単独またはトリオ方式でのゲノム配列決定に加えて、線維芽細胞で実行されるリボ核酸配列をトリオゲノム配列と比較する予定です。神経発達障害および発達異常を呈する患者の病因診断を得るという最終目標を念頭に置いてのみ行われます。
調査の概要
研究の種類
入学 (推定)
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前：Estelle COLIN, MD, PhD
- 電話番号：02 41 35 36 37
- メール：estelle.colin@chu-angers.fr
研究場所
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-
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Angers、フランス
- 募集
- University Hospital of Angers
-
コンタクト：
- Estelle Colin
-
Brest、フランス
- 募集
- University Hospital of Brest
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コンタクト：
- Séverine AUDEBERT-BELLANGER
-
Le Mans、フランス
- 募集
- Le Mans Hospital Center
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コンタクト：
- Radka STOEVA
-
Nantes、フランス
- まだ募集していません
- University Hospital of Nantes
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コンタクト：
- Bertrand ISIDOR
-
Rennes、フランス
- 募集
- University Hospital of Rennes
-
コンタクト：
- Sylvie ODENT
-
Tours、フランス
- まだ募集していません
- University Hospital of Tours
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Vannes、フランス
- まだ募集していません
- Vannes Hospital Center
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コンタクト：
- Florence DEMURGER
-
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
説明
包含基準:
- 年齢制限のない、以下によって定義される神経発達障害のある子供または成人。
- 運動および/または言語の習得に関する重度の発達遅延、および/または社会的コミュニケーション障害のある0歳から5歳までの子供、
- 6歳以上で、重度を問わず知的欠陥があり（可能な場合は神経心理学的評価あり）、てんかんおよび/または自閉症、および/または行動上の問題および/または注意欠陥多動性障害などの関連症状を伴う可能性がある。
- 発達異常および/または二型性を伴う。
- 臨床診断の証拠がない場合
- ネガティブな染色体マイクロアレイおよび/またはエクソームシーケンス
- ネガティブ脆弱X症候群
- 皮膚生検が可能、または線維芽細胞培養から抽出された RNA サンプル。ラボセンター内の研究環境で使用可能
- 参加者本人の同意、または未成年の患者または同意できない患者の場合は法定代理人の同意
- フランスの安全保障体制または同等のものに所属する参加者
除外基準:
- 非遺伝的原因による発達異常を伴う神経発達障害、または分子検査が日常診療で利用可能であり、その費用がゲノムおよびRNA配列決定の費用よりも低い、非常に明白な診断を伴う神経発達障害
- 患者または法定代理人の参加意欲の欠如
- 妊娠中または授乳中の女性
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 主な目的：診断
- 割り当て：非ランダム化
- 介入モデル：並列代入
- マスキング：なし（オープンラベル）
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
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他の：RNAシーケンスおよびトリオ全ゲノムシーケンス
各初発症例は、RNA シーケンスおよびトリオ全ゲノムシーケンスを通じて分析されます。
この部門でデータ解釈を担当する生物学者は、あらゆるデータにアクセスできるようになります。
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患者は盲目である必要はない
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他の：ゲノム配列決定トリオのみ
各初発症例は、RNA シーケンスおよびトリオ全ゲノムシーケンスを通じて分析されます。
ただし、この部門では、データ解釈を担当する生物学者は RNA シーケンスの結果を知ることができません。
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患者は盲目である必要はない
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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神経発達障害および発達異常のある患者の病因診断を特定するために、ゲノム配列決定に加えてトリオで行う RNA 配列決定と単独で実行するゲノム配列決定トリオ解析の興味を比較します。
時間枠：12ヶ月
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神経発達障害および発達異常を有する患者の病因診断を、明らかな臨床的症状を伴わずに特定するために、ゲノム配列決定に加えて線維芽細胞に対してトリオで実行されるRNA配列決定と、単独で実行されるゲノム配列決定トリオ解析の興味を比較する。先験的に診断され、染色体マイクロアレイおよび/またはソロまたはトリオエクソームシークエンシング後に特定の結果が得られない場合 クラス 4 またはクラス 5 (米国医科遺伝学会の分類による) 変異が新たに同定され、RNA シーケンシング + ゲノムシーケンシング トリオとゲノムシーケンシング トリオ単独の後に、診断で患者の症状を説明できるようになりました。
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12ヶ月
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。