감비아의 헬리코박터(2부)

이 예비 기술 연구는 서아프리카의 감비아에 거주하는 어린이와 성인에게서 얻은 H. pylori 분리주 간의 유전자형 차이와 유사성을 평가하고 이러한 차이의 정도를 평가하는 첫 번째 데이터를 제공하는 것을 목표로 합니다. 이 프로토콜은 인구 연구에서 H. pylori 격리(이 프로젝트의 첫 번째 부분에서 개발되고 별도의 프로토콜, DMID 프로토콜 06-0053에 설명됨)에 대한 최소 침습 기술의 적용을 설명합니다. 연구 대상은 서아프리카 감비아 거주자입니다. 치료적 비위 삽관이 필요한 2세 미만의 소아 90명과 이들 소아의 건강한 어머니 30명을 대상으로 합니다. 피험자들은 서아프리카 감비아의 Fajara에 있는 Great Britain Research Laboratories 및 Clinical Facility의 Medical Research Council(MRC)에서 연구될 것입니다. 연구자들은 어린 시절 식민지화에서 성인 질병 상태로의 전환이 부분적으로는 감염에 대한 숙주 반응에 의해 주도되는 H. pylori 균주 자체의 유전자형 진화를 포함한 여러 요인에 의해 영향을 받는다고 제안합니다. 연구원들은 감비아 어린이의 H. pylori 계통이 같은 지역 사회에서 만성적으로 식민화된 성인의 계통과 유전적으로 다를 것이라고 가정합니다. 조사관의 소아 및 성인 분리주에 대한 유전적 및 표현형 특성 분석은 이러한 2개 연령 그룹에서 순환하는 변종 간의 근본적인 차이를 테스트할 것이며, 이는 고위험 사회에서 변종 선택 및/또는 게놈 진화의 중요성을 평가하는 데 도움이 될 수 있습니다. 이 연구의 구체적인 목적은 어린이 변종과 가까운 성인 친척의 근친도를 평가하는 것입니다. 연구 절차에는 집중적인 입원 환자 재영양을 받는 어린이의 영유아 수유 목적으로 사용되는 비위관을 통한 위액 흡인, 이러한 흡인물 및 샘플 기증 초대를 수락한 부모로부터 H. pylori 배양이 포함됩니다. 이를 위해 일시적으로 삽입된 비위관을 통한 배양용 위액. 대부분의 유전자형 분석은 임의로 프라이밍된 폴리머라제 연쇄 반응 DNA 핑거프린팅, 제한된(집중된) DNA 시퀀싱, 특히 밀접하게 관련되어 있지만 지문이 동일하지 않은 분리주의 경우 및 메트로니다졸 감수성 테스트를 수반합니다. 소아 및 성인 분리주의 유전적 및 표현형 특성 분석은 이 두 연령 그룹에서 순환하는 균주 간의 근본적인 차이를 테스트하여 고위험 사회에서 균주 선택 및/또는 게놈 진화의 중요성을 평가하는 데 도움이 됩니다. 이 2년 프로젝트 동안 한 번만 과목을 공부합니다. H. pylori가 위 흡인물에서 분리된 경우, 그 아이의 어머니는 H. pylori 배양을 위한 위액 흡인물을 얻기 위해 한 번 비위관을 통과시키는 데 동의하는지 물을 것입니다. 얻은 격리는 DNA 분석 및 유전자형 분석을 받게 됩니다. 이러한 비교 연구에서 다루어야 할 특정 사항에는 동일한 가족 또는 마을 내에서 어린이와 성인으로부터 분리된 균주를 직접 비교하는 것이 포함됩니다. 이것은 자연적으로 획득된 H. pylori 집락화의 초기 발병률이 높은 사회에서 수행되는 첫 번째 연구가 될 것이며, 동일한 가족 또는 마을 환경 내에서 어린이와 성인의 분리주를 직접 비교할 수 있게 하여 다음에 대한 정보를 제공할 것입니다. 가족 내 및 지역 사회 내 감염 전파. 주요 결과 측정은 세균 분리주 간의 관련성 정도입니다. 이것은 RAPD(random amplification of polymorphic DNA) 결과 사이의 시각적 비교, 관심 있는 대립 유전자에 대한 유전자형 비교, 그리고 결정적으로 STAR 프로그램 및 다중 유전자좌 서열 유형을 사용하여 관련성의 계통발생수를 구성하기 위한 하우스키핑 유전자의 시퀀싱에 의해 평가될 것입니다. MLST) 데이터베이스. 인간 피험자에 대한 결과 측정은 없습니다.