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ClinSeq: 대규모 의료 시퀀싱 임상 연구 파일럿 연구

2024년 5월 7일 업데이트: National Human Genome Research Institute (NHGRI)

이 연구는 임상 연구에서 게놈 시퀀싱을 조사합니다. 게놈 시퀀싱은 연구자가 한 사람의 게놈 전체 또는 일부를 분석(또는 시퀀싱)하는 프로세스입니다. 인간 게놈은 수천 개의 유전자를 포함하는 세포의 물질입니다. 질병을 유발하거나 기여하는 유전자 변화는 한 세대에서 다음 세대로 전달될 수 있습니다. 이 연구는 먼저 심장 질환에 초점을 맞춥니다. 나중에 연구자들은 참가자 유전자의 대부분 또는 전부를 시퀀싱하는 최종 목표를 가지고 다른 조건과 유전자를 연구하기를 희망합니다.

45세에서 65세 사이의 비흡연자 참가자가 이 연구에 참여할 수 있습니다. 환자는 약 반나절 동안 지속되는 초기 연구를 위해 NIH 임상 연구 센터에 올 것입니다. 그들은 혈액 샘플을 기증하고 간단한 설문 조사를 완료합니다. 그런 다음 유전 상담사를 만나 게놈 시퀀싱에 대해 자세히 알아볼 것입니다. 연구에 참여하는 사람들은 다음과 같은 절차와 평가를 받게 됩니다.

  • 가족력 및 병력.
  • 키와 혈압 측정.
  • 심전도 및 심초음파를 포함한 비침습적 심장 검사.
  • 약 3온스의 혈액을 채취합니다(5~6큰술). 혈액 샘플의 일부는 연구에 사용되고 다른 일부는 임상 테스트에 사용됩니다.
  • 관상동맥 석회화, 즉 경직성 상태를 측정하는 검사인 다중검출 컴퓨터단층촬영(CT).

각 환자는 임상 실험실 값 및 평가 결과가 담긴 서신을 받게 됩니다. 환자의 의사와 후속 조치에 대한 권장 사항이 있을 것입니다. 이 연구의 위험에는 CT 테스트의 방사선 노출이 포함됩니다. 사용되는 방사선량은 사람이 일반적으로 태양, 우주, 지구의 공기와 토양에서 자연적으로 발견되는 방사성 물질과 같은 천연 소스에서 받는 것과 거의 동일합니다. 또 다른 약간의 위험은 심초음파에 사용될 수 있는 조영제에 대한 반응과 관련이 있습니다. 부작용으로는 두통, 메스꺼움 또는 구토, 따뜻한 느낌, 현기증이 있을 수 있습니다.

환자가 제공한 샘플로 연구원들은 심장병과 관련된 약 400개의 유전자를 시퀀싱하는 것으로 시작할 것입니다. 분석을 완료하는 데 몇 달이 걸립니다. 게놈 시퀀싱은 수행하기 어렵고 연구자들은 시퀀싱하는 유전자와 발견한 유전자 변화에 대해 알아야 할 것이 많습니다. 연구원이 참가자의 건강에 중요한 유전자 변화를 발견하면 해당 참가자에게 연락하여 그러한 결과를 학습할 수 있는 선택권을 제공합니다.

이 연구는 참가자에게 직접적인 이점이 있을 수도 있고 없을 수도 있습니다. 환자는 콜레스테롤, 당뇨병 및 기타 상태에 대한 무료 임상 테스트와 유전자 변화에 대한 정보를 얻을 수 있습니다. 얻은 지식은 연구자들이 유전자 변화와 건강 사이의 관계에 대해 배우면서 미래에 사람들에게 도움이 될 것입니다.

...

연구 개요

상태

모집하지 않고 적극적으로

상세 설명

ClinSeq의 목적은 임상 연구 환경에서 대규모 의료 시퀀싱(LSMS)을 연구하는 것입니다. 그것은 그렇게 하는 과정과 결과에 대해 거의 알려지지 않았던 시기에(대략 2007년) 개발되었습니다. LSMS를 수행하고 개별 결과를 참가자에게 반환함으로써 우리는 임상 환경에서 LSMS 구현에 수반되는 일부 기술, 의료 및 유전 상담 문제를 조사하고자 했습니다. 세 가지 목표가 달성되었으며 다음과 같은 관련 결과가 주로 발표되었습니다.

  • 대규모의 인종적으로 다양한 코호트 모집 및 동의 방법 개발
  • 시퀀스 데이터 생성 및 해석을 위한 기존 알고리즘을 지속적으로 개선
  • 게놈 변이와 특성 및 표현형의 연관성 조사를 포함하여 생의학 연구 문제를 해결하기 위한 리소스로 이 코호트를 구축하고 제공합니다.

그러나 LSMS와 관련하여 아직 배워야 할 것이 많으며, 그 중 많은 부분이 임상 연구 환경에서 LSMS 구현의 사회 행동적 측면에 대한 이해를 개선하려는 원래 목표와 관련이 있습니다. 남은 목표는 다음과 같습니다.

  • 의학적으로 실행 가능한 결과를 받은 후 환자 결과(예: 건강 행동, 의사소통, 개인적 유용성, 정서적)를 이해합니다.
  • 에 대한 더 나은 이해를 촉진하기 위해 고안된 개입의 영향을 조사하기 위해

LSMS에 동의하는 사람들 사이의 유전자 시퀀싱의 정확성.

  • 웹사이트를 통해 부정적인 2차 결과 보고서를 반환한 결과를 조사하고 그러한 보고서를 받은 후 유방암에 대한 잔류 위험에 대한 여성의 이해를 개선하기 위해 개발된 슬라이드의 두 가지 버전을 비교합니다.
  • 당뇨병 및 포도당 대사와 관련된 기타 대사 질환에 대한 유전적 위험 요인을 확인합니다.

연구 유형

관찰

등록 (실제)

1665

연락처 및 위치

이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.

연구 장소

    • Maryland
      • Bethesda, Maryland, 미국, 20892
        • National Institutes of Health Clinical Center
      • Bethesda, Maryland, 미국, 20814
        • Suburban Hospital

참여기준

연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.

자격 기준

공부할 수 있는 나이

6년 (어린이, 성인, 고령자)

건강한 자원 봉사자를 받아들입니다

아니

샘플링 방법

비확률 샘플

연구 인구

그룹 A의 참가자는 해당 지역에 거주하거나 자비로 1년에 최대 1회까지 귀국할 의향이 있는 45-65세(또는 A3의 경우 18-65세)의 나이로 상당한 개인/가족 병력이 없는 한 동맥 질환의 경우 35-65세의 개인도 수용했습니다. 그룹 B의 참가자는 팀에서 연구에 초대했으며 그룹 A1, A2 또는 A3 참가자의 가족 구성원이었습니다.

설명

  • 포함 기준:

그룹 A

그룹 A 모집 및 등록이 완료되었습니다. 대부분의 경우 A1, A2 및 A3 코호트에 동일한 포함 및 제외 기준과 정당성이 적용되었지만 일부 기준에 대해서는 예외가 기록되었습니다. 전반적으로 이러한 기준에는 다음이 포함됩니다.

-기준 #1(A1): 이 코호트 참가자의 25%는 다음의 병력으로 정의되는 관상동맥 질환(CAD)을 알고 있습니다: 심근 경색, 무증상 심근 경색, 스텐트 배치, 재혈관 형성, 50% 이상 동맥 막힘, 칼슘

연령, 성별 및 인종(www.mesa-nhlbi.org/Calcium의 MESA 계산기 사용)을 기준으로 95번째 백분위수보다 높은 점수, 또는 상승된 것과 같은 잠재적으로 CAD 관련 생화학적 표현형의 개인 병력과 함께 CAD의 강한 가족력

지단백질 (a) (Lp(a)).

  • 정당성: CAD는 처음에 연구 대상 표현형이었기 때문에 문서화된 질병을 가진 최소한의 참가자를 포함하는 것이 중요했습니다.

    • 기준 #2(A1 & A2): 이 연구에 적합한 개인은 이전 12개월 동안 규칙적으로 흡연하지 않은 사람으로 정의된 우리의 목적을 위해 등록 시점에 비흡연자여야 합니다(Wilson et al., 1998 ).
  • 정당성: 우리 연구는 원래 CAD의 유전적 토대를 확인하는 것을 목표로 했기 때문에 흡연자는 CAD에 대한 중요하고 알려진 위험 요소이기 때문에 제외했습니다.

    -기준 #3(A1 및 A2): CAD가 없는 개인은 45-65세여야 하고 CAD가 있는 개인은 35-65세여야 합니다.

  • 정당성: 대상 표현형의 발현에 따라 연령대를 선택했습니다. 우리는 관상동맥 석회화(CAC) 측정 범위가 정상에서 질병에 이르는 코호트를 모집하기 위해 이 컷오프의 하한을 선택했으며, 이 연령 미만에서는 비정상적인 CAC가 드문 것으로 나타났습니다(Janowitz, Agatston, Kaplan, & Viamonte). , 1993). 연령 범위의 하한선

CAD 참가자의 경우 심혈관 질환의 특히 심각한 개인 또는 가족력이 있는 개인의 등록을 허용하도록 확장되었습니다. 참가자의 종적 연구를 허용하기 위해 65세의 상한선을 선택했습니다.

-기준 #4(A3): 개인은 18-65세여야 합니다.

  • 정당성: A1 및 A2 코호트와 마찬가지로 참가자의 종적 연구를 위해 65세의 상한선을 선택했습니다. 그러나 A1 및 A2 코호트와 달리 더 낮은 연령 제한인 18세를 선택한 이유는 더 이상 심혈관 질환 표현형에 주로 관심이 없기 때문입니다.

    -기준 #5(모든 코호트): 피험자는 대도시 DC 및 볼티모어 지역에 거주하거나 후속 조치를 위해 정기적으로 CRC를 방문하거나 프로토콜 참여를 위해 필요에 따라 자체 비용으로 NIH를 방문할 의향이 있어야 합니다. (극히 설득력 있는 개인 또는 가족력이 있는 CAD를 가진 일부 참가자를 제외하고 우리는 그들이 달리 참여할 수 없기 때문에 임상 방문을 위해 보장된 교통비, 식사 및 숙박 비용을 부담하기로 동의했습니다).

  • 정당성: 이 기준은 피험자가 보조 연구와 같은 진행 중인 연구 활동에 참여하고 유전자 검사 결과를 받기 위해 다시 돌아오는 것을 꺼리는 것을 최소화하기 위해 고안되었습니다.

    -기준 #6: 등록된 ClinSeq 참가자의 직계 가족은 그룹 B에 속하지 않는 한 자격이 없습니다.

  • 정당성: 이러한 개인은 상염색체 유전자좌에서 평균 50%의 유전자를 공유하므로 일반 질병에 초점을 맞춘 ClinSeq와 같은 연구의 힘을 감소시킬 수 있습니다.

    • 기준 #7: 임상 및 유전형 분석 데이터 수집 및 분석에 직접 관여하는 개인, 여기에는 주임 조사자, 부수사관, 임상 수준에서 피험자와 관련된 ClinSeq 직원(예: 개업 간호사, 유전 상담사 등)이 포함됩니다. .) 및 시퀀스 데이터 생성 및 분석과 관련된 NISC 직원은 자격이 없습니다.
  • 정당성: 이러한 개인의 참여는 이해 상충(COI)을 제시하고 부작용(AE)으로 이어질 수 있습니다.

    -기준 #9: GENE-FORECAST 연구(14-HG_0048)와 같이 게놈 또는 엑솜 시퀀싱을 제공하는 다른 연구에 이미 등록한 개인은 자격이 없습니다.

  • 정당성: 우리가 제공한 결과는 참가자에게 더 이상 필요하지 않습니다. 또한 결과는 참가자에게 더 이상 새롭지 않으므로 결과 반환의 영향을 이해하기 위한 모든 사회 및 행동 연구에 적합하지 않습니다. 이는 프로젝트 참여를 심각하게 제한하기 때문에 이러한 참가자를 제외할 것을 제안합니다.

    -기준 #11: 동의할 수 없거나 동의할 수 없게 될 수 있는 성인은 이 연구에서 제외됩니다.

  • 정당성: 이 연구는 사람들이 동의 결정을 내리는 방법, 태도 및 개인 테스트 결과 사용에 관심이 있기 때문에 이러한 개인은 프로젝트에서 제외됩니다.

다음 참가자는 목표 1A-C 및 2와 관련된 프로젝트에 자격이 있습니다.

  • 목표 1A: 이 프로젝트에 참가할 수 있는 참가자는 18세 이상이어야 하며 지난 6개월 동안 의학적으로 실행 가능한 유전자 결과를 받아야 합니다.

    -- 정당성: 우리는 그들의 경험에 관심이 있기 때문에 결과가 있는 개인만 인터뷰 및 설문 조사를 할 수 있습니다.

  • 목표 1B: 채용 및 데이터 수집이 완료되었습니다. 자격 기준은 다음과 같습니다. (1) 2012-2018년 사이에 ClinSeq 프로젝트에 동의, (2) 기본 설문 조사 완료, (3) 18세 이상.
  • 목표 1C: 채용 및 데이터 수집이 완료되었습니다. 이 프로젝트에 포함할 수 있는 자격은 (1) 엑솜 시퀀스 데이터 분석에서 사용할 수 있는 부정적인 2차 결과 보고서가 있고, (2) 결과 반환의 무작위 통제 시험에 참여하는 데 동의하는 것을 기반으로 합니다.

    • 정당성: 프로젝트가 초기에 이러한 결과의 반환에만 초점을 맞추었기 때문에 부정적인 2차 결과 결과를 가진 참가자만 연구에 포함되었습니다.

목표 2: 채용 및 데이터 수집이 완료되었습니다. 이 그룹에 적합한 참가자는 당뇨병 또는 포도당 대사와 관련된 기타 대사 질환과 관련된 유전자/유전자에서 식별된 관심 변형을 가졌습니다.

-- 정당성: 우리는 특정 유전적 변이가 표현형 결과를 갖는지 이해하는 데 관심이 있으므로 데이터 세트에 피험자의 데이터를 포함하려면 변이가 필요합니다.

그룹 B

그룹 B 모집 및 등록이 마감되었습니다. 그룹 B의 자격은 그룹 A와 다릅니다. 그룹 B 자격이 필요합니다.

-기준 #1: 친척이 그룹 A에 등록되어 있음

-- 정당성: 연구의 그룹 B에 친척을 포함시키는 데에는 두 가지 정당성이 있습니다. 첫 번째는 우리가 알려진 질병 개체에 대한 치료 표준 접근 방식을 시작하기를 원했다는 것입니다. 예를 들어, 가족성 고콜레스테롤혈증이 있는 사람의 친척에 대한 가족 연구를 수행하여 이 생명을 위협하는 장애에 걸릴 위험이 높은 사람을 식별하는 것이 임상적으로 지시됩니다. 두 번째는 우리가

때때로 유전적 변이가 질병 표현형과 연관되어 있는지 확인하는 데 도움이 되는 가족에 대한 추가 유전 데이터가 필요했습니다. 그러한 연관성에 대한 증거가 거의 또는 전혀 없는 경우 변종이 질병을 일으킬 수 있습니다.

-기준 #2: 연구 중인 표현형이 어린이에게 영향을 미치지 않는 한 18세 이상

-- 정당성: 우리는 그러한 유전자 검사가 알려진 이점 없이 이러한 어린이에게 위험을 초래할 수 있다는 우려 때문에 질병이 어린 시절에 증상을 유발하지 않는 한 어린이를 제외했습니다.

제외 기준:

모집 및 등록이 마감되었으므로 제외되지 않습니다.

공부 계획

이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.

연구는 어떻게 설계됩니까?

디자인 세부사항

  • 관찰 모델: 다른
  • 시간 관점: 유망한

코호트 및 개입

그룹/코호트
A1
등록 시 45-65세의 자가 추천 개인, 그 중 25%가 관상 동맥 질환을 앓았습니다.
A2
등록 당시 45-65세로 본인이 아프리카계, 아프리카계 미국인 또는 아프리카계 카리브해인이라고 밝힌 개인
A3
후속 조치를 위해 돌아올 가능성이 있는 것으로 확인된 남녀 ​​피험자를 포함하여 등록 당시 18-65세의 성인
그룹 A1, A2 또는 A3의 가족 구성원

연구는 무엇을 측정합니까?

주요 결과 측정

결과 측정
측정값 설명
기간
모집 및 동의 코호트
기간: 2017년
대규모의 인종적으로 다양한 코호트 모집 및 동의 방법 개발
2017년
코호트를 리소스로 제공
기간: 2026년
게놈 변이와 특성 및 표현형의 연관성 조사를 포함하여 생의학 연구 문제를 해결하기 위한 리소스로 이 코호트를 구축하고 제공합니다.
2026년
서열 데이터 해석을 위한 알고리즘 개선
기간: 2026년
서열 데이터 생성 및 해석을 위한 기존 알고리즘을 지속적으로 개선
2026년
건강행태, 가족의 의사소통 및 이해
기간: 2026년
LSMS 결과가 건강 행동, 가족 의사소통 및 이해에 미치는 영향 결정
2026년
결과 공개의 효율성
기간: 2026년
LSMS 결과 반환을 위한 점점 더 효율적인 모델 시험
2026년

공동 작업자 및 조사자

여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.

수사관

  • 수석 연구원: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)

간행물 및 유용한 링크

연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.

연구 기록 날짜

이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.

연구 주요 날짜

연구 시작 (실제)

2007년 1월 5일

연구 등록 날짜

최초 제출

2006년 12월 9일

QC 기준을 충족하는 최초 제출

2006년 12월 9일

처음 게시됨 (추정된)

2006년 12월 12일

연구 기록 업데이트

마지막 업데이트 게시됨 (실제)

2024년 5월 8일

QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출

2024년 5월 7일

마지막으로 확인됨

2024년 5월 6일

추가 정보

이 연구와 관련된 용어

개별 참가자 데이터(IPD) 계획

개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?

IPD 계획 설명

.임상 데이터에 대한 계층형 액세스로 설계된 유전자형 및 표현형 데이터베이스(dbGaP)에 데이터를 적극적으로 저장하고 있습니다. 즉, 연구 참가자의 요약 임상 ​​데이터에 대한 공개적이고 공개적인 액세스가 있으며 자격을 갖춘 조사자는 개인의 코딩된 임상 결과에 대한 액세스를 신청할 수 있습니다. 이러한 액세스는 승인된 의료 연구원으로 제한되며 재배포 및 보안 정책은 엄격합니다. dbGaP에 기탁된 데이터의 향후 광범위한 사용(특정 장애에 대한 제한된 사용과 반대)이 허용됩니다.@@@@@@Sequence 개별 유전자에 대한 추적은 공개적으로 사용할 수 있습니다(GenBank에 기탁됨). 그러나 이러한 시퀀스 추적은 참가자의 식별 가능한 정보나 해당 참가자의 샘플에서 시퀀싱된 다른 유전자의 시퀀스 추적과 연결되지 않습니다.@@@@@@Coded 게놈 데이터는 Reverse Phenotyping Core 브라우저(18-HG-0129; https://tgac.nhgri.nih.gov/)를 통해 데이터 기여자와 NIH 교내 조사관에게 제공됩니다.

IPD 공유 기간

DbGap의 데이터는 NIH 정책에 따라 저장됩니다. Reverse Phenotyping Core/TGAC 브라우저의 데이터는 프로토콜(18-HG-0129)의 나머지 기간 동안 저장되며 연구가 종료될 때 IRB에 데이터를 보관하거나 파기하라는 제안이 이루어집니다.

IPD 공유 액세스 기준

dbGap은 표현형 기능과 관련된 요약 수준 정보 및 개별 수준 유전자형 및 시퀀스 데이터에 대한 보기 전용 액세스 권한이 있는 제어 액세스 데이터베이스입니다. Reverse Phenotyping Core/TGAC 브라우저를 사용하면 연구원이 특정 유전자형 또는 유전자형 범위를 식별하는 동시에 검색에서 하나 또는 제한된 수의 유전자좌에 대한 집계 데이터만 표시하여 연구 참가자의 개인 정보를 보호할 수 있습니다. 브라우저는 NIH 서버에 있으며 NIH 교내 연구 프로그램의 조사관 또는 시퀀스 데이터를 제공한 외부 협력자만 검색할 수 있습니다.

IPD 공유 지원 정보 유형

  • 연구_프로토콜

약물 및 장치 정보, 연구 문서

미국 FDA 규제 의약품 연구

아니

미국 FDA 규제 기기 제품 연구

아니

이 정보는 변경 없이 clinicaltrials.gov 웹사이트에서 직접 가져온 것입니다. 귀하의 연구 세부 정보를 변경, 제거 또는 업데이트하도록 요청하는 경우 register@clinicaltrials.gov. 문의하십시오. 변경 사항이 clinicaltrials.gov에 구현되는 즉시 저희 웹사이트에도 자동으로 업데이트됩니다. .

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