NSCLC에서 ICI에 대한 효능 및 독성의 바이오마커를 확인하기 위한 단일 세포 접근법
비소세포폐암에서 면역 체크포인트 차단에 대한 효능 및 독성의 바이오마커를 식별하기 위한 단일 세포 접근법
이 전향적 비중재 탐색적 연구의 주요 목표는 면역 체크포인트 봉쇄 노출 전에 단일 세포 해상도에서 진행성 NSCLC의 종양 미세 환경을 특성화하고 결과를 임상 결과와 연관시키는 것입니다. 이 접근법은 ICI 및 (일차) 저항 메커니즘의 작용 메커니즘에 관한 새로운 가설을 생성할 수 있게 합니다. 장기 목표는 이러한 새로운 기계론적 통찰력이 ICI 효능의 더 나은 바이오마커를 개발하기 위해 임상 환경으로 변환되는 것입니다. 중요한 것은 연구자들이 말초 혈액의 면역 구성을 순차적으로 프로파일링할 것이기 때문에 이 연구는 순환하는(비침습적) 바이오마커를 개발할 수 있는 기회를 제공한다는 것입니다.
두 번째 목표는 ICI-폐렴이 발병할 경우 ICI 치료를 받은 암 환자의 기관지폐포 세척액(BAL)의 면역 세포 구성을 특성화하는 것입니다. 이러한 기계적 통찰력은 추정 진단 바이오마커 및 치료 대상으로 직접 이어질 수 있습니다. 혈액 샘플의 단일 세포 프로파일링도 수행되기 때문에 ICI 독성의 순환 바이오마커도 식별할 수 있어 비침습적 진단이 가능합니다.
연구 개요
상세 설명
연구자들은 면역 체크포인트 억제제로 치료를 시작하기 전에 70명의 st.IV NSCLC 환자로부터 종양 생검을 수집할 것입니다. 이러한 생검은 진단 목적으로 의학적으로 요구되는 일상적인 절차 중에 수행되며 다음과 같은 실험 절차를 따릅니다.
첫째, scRNA-seq 및 TCR-seq는 무작위로 분리된 최대 5,000개의 세포에 적용될 것입니다. 또한, 세포 표면 단백질 발현은 전사 정보와 통합될 수 있습니다. Seurat를 포함한 다양한 생물 정보학 파이프라인은 마커 유전자 발현을 통해 알려진 세포 유형, 세포 하위 유형 또는 표현형에 할당되는 다양한 세포 클러스터를 식별하는 데 사용될 것입니다. 예를 들어, 이것은 연구자들이 PD-1/PD-L1 발현 T 세포, 세포독성 T-세포, 면역 억제성 골수 세포 등의 풍부함을 모니터링할 수 있게 할 것입니다. 단일 세포 수준에서 다음 매개변수가 관련됩니다(비포괄적).
- 확립된 면역 세포 유형(예: T 세포(CD4+, CD8+ 및 조절 서브세트), NK 세포, B 세포, MDSC, 대식세포, 호중구, 수지상 세포). 이러한 각 면역 세포 아형에 대한 전사 데이터를 분석하여 특정 표현형 상태를 정의하는 특정 유전자 발현 프로그램의 특성을 규명할 수 있습니다.
- 섬유아세포 및 내피 세포를 포함하여 단일 세포 전사체학에 의해 확인된 모든 간질 세포 아형의 구성.
- 각 세포 유형 및 세포 하위 유형(또는 세포 상태)에 대한 유전자 조절 네트워크가 설정되고 마스터 전사 조절자가 식별됩니다. 개별 T 세포 및 T 세포 서브클러스터는 모두 T 세포 활성화를 나타내는 인터페론 활성화, 높은 증식 및 전사율 및 증가된 그랜자임 발현에 기초하여 분류될 것입니다. 높은 CD8+ T 세포 활동은 높은 면역 체크포인트 발현과 관련이 있기 때문에, T 세포 활동(그랜자임 발현에 기초함)은 아마도 새로운 체크포인트 분자를 나타낼 수 있는 공동 조절 수용체를 식별하기 위해 이들 세포에서 다른 유전자의 발현과 상관관계가 있을 것입니다.
혈액 샘플은 유사한 실험 절차를 거치게 됩니다. 먼저, PBMC는 Ficoll 밀도 구배 원심분리를 사용하여 분리됩니다. CITE-seq와 결합된 단일 세포 전사체 분석은 5000 PBMC에서 수행됩니다. 세포 구성은 종양 생검을 처리하는 데 사용되는 것과 동일한 생물정보학 파이프라인을 사용하여 결정됩니다.
두 번째 목적으로, ICI-폐렴 BAL 유체 및 PBMC의 세포 구성에 대한 면역 프로파일링은 이전에 약술한 바와 같이 scRNA-seq, scTCR-seq 및 CITE-seq를 사용하여 수행될 것입니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Els Wauters
- 전화번호: +3216340942
- 이메일: els.wauters@uzleuven.be
연구 장소
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Leuven, 벨기에, 3000
- 모병
- Universitaire Ziekenhuizen Leuven
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연락하다:
- Els Wauters, MD, PhD
- 전화번호: +32 16 34 09 42
- 이메일: els.wauters@uzleuven.be
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 성인 M/F/X(>= 18세)
- 조직학적 및 임상적으로 확인된 비소세포폐암 진단(IASLC Staging Handbook in Thoracic Oncology v7에 따름)
- 가이드라인에 따라 1차 치료를 받는 환자
- 다른 임상 시험에 포함되지 않음
- 서명된 동의서 양식
제외 기준:
• 이 연구에서 추가 처리에 적합하지 않은 수집된 자료(예: 나쁜 품질). 이 결정은 단일 세포 분석을 전문으로 하는 연구실 기술자 및/또는 생물 정보학자와 상의하여 이루어집니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
|---|---|
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NSCLC st.IV(PD-L1 > 50%)
항 PD-1 단일 요법
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St.IV NSCLC에 대한 치료 표준 치료(드라이버 돌연변이 없음, PD-L1 > 50%)
다른 이름들:
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NSCLC st.IV(PD-L1 < 50%)
병용 항-PD-1 + 화학요법
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St.IV NSCLC에 대한 표준 치료(드라이버 돌연변이 없음, PD-L1 < 50%)
다른 이름들:
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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ICI로 치료된 st.IV NSCLC 환자의 종양 샘플에 존재하는 scRNA-seq에 의해 결정된 면역 세포 비율은 객관적인 반응을 얻거나 객관적인 반응을 얻지 못합니다.
기간: 포함 날짜부터 연구 완료까지, 평균 2년.
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ICI 치료를 시작하기 전에 반응 대 비반응 환자의 종양에 존재하는 면역 세포 아형의 백분율을 확인하고 통계적으로 비교함으로써 i) 어떤 면역 과정이 ICI에 대한 반응 또는 저항성을 유발하는지 이해 ii) 추정되는 분자 바이오마커 식별 iii ) 추정되는 치료 표적 식별
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포함 날짜부터 연구 완료까지, 평균 2년.
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ScRNA-seq에 의해 결정된 면역 세포 비율, ICI 처리된 st.IV NSCLC 환자의 말초혈액에 존재하는 ICI 1주기 전과 후 객관적 반응 달성 여부
기간: 포함 날짜부터 연구 완료까지, 평균 2년.
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반응 대 비반응 환자의 말초 혈액에 존재하는 면역 세포 아형의 백분율을 식별하고 통계적으로 비교함으로써 우리는 i) 어떤 면역 과정이 ICI에 대한 반응 또는 저항성을 유발하는지 이해하는 것을 목표로 합니다. ii) 추정되는 분자 바이오마커를 식별합니다. iii) 추정되는 치료를 식별합니다. 대상
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포함 날짜부터 연구 완료까지, 평균 2년.
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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ICI 유발 폐렴 BAL 액에 존재하는 scRNA-seq에 의해 결정된 면역 세포 비율
기간: 포함 날짜부터 연구 완료까지, 평균 2년.
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ICI-/RT-/TKI-유도성 폐렴 BAL 유체에 존재하는 면역 세포 아형의 백분율을 확인하고 통계적으로 비교함으로써 우리는 i) 어떤 면역 과정이 이러한 부작용을 유발하는지 이해하는 것을 목표로 합니다. ii) 추정되는 분자 바이오마커를 식별합니다. iii) 추정되는 치료법을 식별합니다. 대상
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포함 날짜부터 연구 완료까지, 평균 2년.
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ICI-유도성 폐렴 말초 혈액 단핵 세포에 존재하는, scRNA-seq에 의해 결정된 면역 세포 비율
기간: 포함 날짜부터 연구 완료까지, 평균 2년.
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ICI-/RT-/TKI 유발 폐렴 말초 혈액 단핵 세포에 존재하는 면역 세포 아형의 백분율을 식별하고 통계적으로 비교함으로써 우리는 i) 어떤 면역 과정이 이러한 부작용을 유발하는지 이해 ii) 추정되는 분자 바이오마커 식별 iii) 식별 추정되는 치료 표적
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포함 날짜부터 연구 완료까지, 평균 2년.
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공동 작업자 및 조사자
협력자
수사관
- 수석 연구원: Els Wauters, MD, PhD, University Hospitals - KU Leuven
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- S63531
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
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