혈액 내 순환 종양 마커 분석 4 - ALCINA 4 (ALCINA4)

수술 후 잔여 질환을 감지하는 것은 종양학에서 절대적으로 중요합니다. 이 감지를 통해 잔여 질환의 존재에 따라 수술 후 치료를 개인화할 수 있기 때문입니다.

실험실은 얕은 전체 게놈 시퀀싱에 의한 순환 DNA의 전좌 단편 인식을 기반으로 순환 종양 DNA 검출을 위한 새로운 기술을 개발하고자 합니다. 이것은 독창적인 접근 방식으로, 우리가 아는 한 지금까지 구상된 생물정보학 접근 방식으로 테스트되지 않았으며 국소화된(비전이성) 유방암의 외과적 제거 후 잔여 질병을 감지하는 데 현재 사용되는 기술보다 잠재적으로 더 민감할 수 있습니다.

따라서 분석은 가능한 생식계열 염색체 전좌와 구별되어야 하는 종양 염색체 전좌 검색에 초점을 맞출 것입니다. 따라서 헌법 DNA 수집은 이 코호트에서 계획됩니다.

이 코호트의 목표는 순환하는 종양 DNA의 변이가 화학면역요법 동안 반응과 관련된 마커로서 가질 수 있는 역할을 연구하는 것입니다.

돌연변이 프로파일링 분석(혈액에서 순환하는 종양 DNA를 추적하는 데 사용됨)에는 신선한 생검(이후 냉동 보관)이 필요합니다. 또한 화학면역요법(PD-L1 라벨링, 돌연변이 로드 등)에 대한 반응의 현재 인식된 생물학적 조직 인자를 분석하고 순환하는 종양 DNA 변이와의 가능한 연관성을 식별하는 데 사용될 것입니다.

이러한 돌연변이의 결정은 순환하는 종양 DNA를 모니터링하는 데 필수적이므로 수집될 것이기 때문에 종양에 존재하는 점 돌연변이(체질적 수준에 존재하는 다형성과 구별됨)를 결정하기 위해 헌법 DNA 분석이 필요합니다.

이 코호트의 목적은 예를 들어 순환하는 종양 DNA의 염색체 전좌 검출을 기반으로 하는 새로운 혈장 검사를 개발하는 것입니다.

가설은 이러한 테스트를 통해 삼중음성 유방암 환자의 암의 여러 단계에서 재발 감지, 치료 효능 예측 및 치료 효능 모니터링이 가능하다는 것입니다. 치료 또는 전이 단계에서. 이 두 모집단(신보조 및 전이) 사이의 포함 수는 한 그룹에 대한 과도한 불균형을 피하기 위해 운영 수준에서 모니터링됩니다.

이전 결과를 기반으로 한 이 코호트의 목적은 다음과 같습니다.

1. 단백질 수준에서 종양 조절 T(Tregs)에 대한 표적 유전자의 발현 수준을 정량화하고,
2. Institut Curie에서 치료받은 유방암 또는 난소암 환자의 혈액 및 종양 샘플에 대해 다중 매개변수 FACS 분석을 수행하고 이러한 표적이 질병의 바이오마커로서의 잠재력을 이해합니다.

이 ALCINA-4 코호트 n°4의 맥락에서 유방 및 난소 환자의 경우 혈액 40ml를 수집하고 수술(유방 환자 50명) 또는 치료적으로 필요한 생검(난소 환자 30명)에서 종양 조각을 얻습니다. 이 프로토콜에서는 치료 과정에 속하는 것보다 추가 생검을 수행하지 않습니다. 표준 치료의 일부로 수행되는 생검은 충분한 재료를 사용할 수 있는 경우 사용됩니다.

이 코호트의 목적은 조기 삼중음성유방암(TNBC)에 대한 화학면역요법으로 선행치료를 받은 환자의 혈액에서 수술 전후 순환종양 DNA(ctDNA) 검출율을 알아보는 것이다.

아직 신보조 치료를 시작하지 않은 환자(서브코호트 1)와 이미 신보조 치료를 시작한 환자(서브코호트 2)의 두 하위 그룹이 있습니다.

종양 병변의 생검은 신보강 치료 시작 전에 수행될 것입니다(서브코호트 1에 대해서만). 헌법 DNA, 혈장 및 순환 종양 DNA의 수집은 상이한 시점에서 이 코호트에서 계획된다.

이 탐색적 코호트의 주요 목적은 T-DXd 치료가 필요한 HER2-저 전이성 유방암 환자를 대상으로 T-DXd(Trastuzumab deruxtecan) 치료 전과 치료 중 ctDNA 검출률을 특성화하는 것입니다.

종양 생검은 적어도 30명의 환자에 대해 포함 후 그리고 치료 시작 전에 1주기 1일에 수행될 것입니다. 구성 DNA 수집은 이 코호트에서 서로 다른 시점에서 계획됩니다. T1 및 T2(치료 시작 전)는 액체 바이오마커의 환자 내 재현성을 평가하는 데 중요합니다. T3는 치료에 대한 반응을 조사하고 T4는 저항 메커니즘에 초점을 맞춥니다.

이 코호트의 목적은 보조 유방암에서 CDK4/6 억제제를 투여받은 환자에서 순환 종양 DNA 검출 및 모니터링의 예후 영향을 결정하는 것입니다.

서로 다른 시점(4개 시점)에서 순환하는 바이오마커 연구를 위해 헌법 DNA 및 혈장용 50ml의 혈액을 EDTA 튜브에 수집합니다.

이 코호트의 목적은 무증상 환자에서 전이성 재발을 조기에 발견하기 위해 추적 기간 동안 초기 유방암 환자의 ctDNA 검출 빈도를 추정하는 것입니다.

ctDNA 분석은 표준 치료의 일부로 종양 조직 분석 여부에 관계없이 차세대 염기서열 분석(NGS)을 포함한 다양한 기술을 사용하여 수행됩니다.

40ml의 혈액 샘플을 4가지 시점에서 수집합니다:

• 등록,
• 6개월(+/- 15일),
• 12개월(+/- 15일),
• 포함 후 18개월(+/- 15일).

이 코호트의 목적은 다음과 같습니다.

• 화학면역요법 하에서 순환하는 종양 DNA의 수준과 특성에 대한 데이터를 생성합니다.
• 전신 화학 면역요법 하에서 순환 면역 반응의 진행을 모니터링합니다.

종양 생검은 포함 후 및 치료 시작 전에 수행됩니다.

50ml의 혈액 샘플을 4가지 시점에서 수집합니다:

• 포함 시, 신보강 치료를 시작하기 전
• 신보강 치료의 3주기(C3J1) 시작 시
• 수술 당시(신보조치료 후)
• 모니터링 시작 시점, 즉 수술 후 3개월(+/- 1개월)입니다.

이 코호트의 목적은 다음과 같습니다.

• R0/R1 수술 후 무재발 생존율(RFS) 평가

• 포도막 흑색종 전이 환자의 수술과 관련된 Tebentafusp의 효과를 평가합니다.

  3개의 하위 집단:

• 하위 코호트 1: HLA-A*02:01 양성 환자, R0 수술 및 Tebentafusp에 적격(n=20)
• 하위 코호트 2: HLA-A*02:01 음성 환자, 다음 재발 시 R0 수술 및 면역요법에 적격(n=20)
• 하위 코호트 3: HLA-A*02:01 양성 환자, R0 수술에는 적합하지 않지만 Tebentafusp에는 적합함(n=20).

종양 생검은 수술 중(하위 코호트 n°1 및 2) 또는 포함 후(하위 코호트 n°3) 수행됩니다.

4개 시점의 바이오마커 연구를 위해 혈장 내 구성 DNA 및 순환 DNA를 위해 40ml의 혈액을 EDTA 튜브에 수집합니다.

이 코호트의 목적은 다음과 같습니다:

• CDK4/6 억제제 치료 중 ctDNA의 동역학을 특성화합니다.
• ctDNA와 일반 혈청 마커 간의 연관성을 연구합니다.

• ctDNA와 대사 이미징에서 유래된 마커 간의 연관성을 연구합니다.

  다양한 시점에서 생체 표지자 연구를 위한 체질 DNA 및 혈장 내 순환 DNA를 위해 STRECK 튜브에 40~50ml의 혈액을 채취합니다.

이 코호트의 목적은 유방암에서 확립된 환자 유래 이종이식 모델(PDX)의 분자 분석과 순환 바이오마커를 상관관계 분석하는 것입니다.

포함 시점에 헌법적 DNA를 위해 EDTA 튜브에 10ml의 혈액을 채취합니다.

PDX 확립을 위해 포함 시점에 종양 조직 샘플(PDX용)을 채취합니다.