Análise de Marcadores Tumorais Circulantes no Sangue 4 - ALCINA 4 (ALCINA4)

A detecção de doença residual após a cirurgia é absolutamente crucial em oncologia, pois essa detecção pode permitir a personalização de tratamentos pós-operatórios com base na presença de doença residual.

O laboratório deseja desenvolver uma nova técnica para a detecção de DNA tumoral circulante, baseada no reconhecimento de fragmentos de translocação no DNA circulante por sequenciamento raso do genoma inteiro. Esta é uma abordagem original, que até agora não foi testada com a abordagem de bioinformática prevista e pode ser potencialmente mais sensível do que as técnicas atualmente usadas para detectar doença residual após a remoção cirúrgica de câncer de mama localizado (não metastático).

A análise, portanto, se concentrará na busca de translocações cromossômicas tumorais, que precisarão ser diferenciadas de possíveis translocações cromossômicas germinativas. A coleta de DNA constitucional é, portanto, planejada nesta coorte.

O objetivo desta coorte é estudar o papel que as variações no DNA tumoral circulante podem ter como um marcador associado à resposta durante a quimioimunoterapia.

Uma nova biópsia (posteriormente armazenada congelada) é necessária para a análise de perfil mutacional (que será usada para rastrear o DNA tumoral circulante no sangue). Além disso, será usado para analisar fatores biológicos teciduais atualmente reconhecidos de resposta à quimioimunoterapia (rotulagem de PD-L1, carga mutacional, ...) e para identificar possíveis associações com variações circulantes de DNA tumoral.

A análise do DNA constitucional é necessária para a determinação de mutações pontuais presentes no tumor (a serem diferenciadas de polimorfismos presentes no nível constitucional), pois a determinação dessas mutações é essencial para monitorar o DNA tumoral circulante e, portanto, será coletado.

O objetivo desta coorte é o desenvolvimento de novos testes de plasma, por exemplo, baseados na detecção de translocações cromossômicas de DNA tumoral circulante.

A hipótese é que estes testes permitiriam a detecção de recidiva, a predição da eficácia do tratamento e o monitoramento da eficácia do tratamento em diferentes estágios do câncer em pacientes com câncer de mama triplo negativo, seja na fase não metastática com neoadjuvante planejado tratamento ou na fase metastática. O número de inclusões entre essas 2 populações (neoadjuvante e metastático) será monitorado no nível operacional para evitar um desequilíbrio excessivo em relação a um grupo.

O objetivo desta coorte, com base nos resultados anteriores, é:

1. quantificar o nível de expressão dos genes-alvo no tumor regulador T (Tregs) no nível da proteína,
2. realizar análises FACS multiparamétricas em amostras de sangue e tumor de pacientes tratados no Institut Curie, com câncer de mama ou ovário e entender o potencial desses alvos como biomarcadores da doença.

No contexto desta coorte ALCINA-4 n°4, para pacientes de mama e ovário, serão coletados 40 ml de sangue e fragmentos tumorais obtidos de cirurgia (50 pacientes de mama) ou biópsia necessária terapeuticamente (30 pacientes de ovário). Nenhuma biópsia adicional além das pertencentes ao processo terapêutico será realizada neste protocolo. As biópsias realizadas como parte do tratamento padrão serão usadas se houver material suficiente disponível.

O objetivo desta coorte é determinar a taxa de detecção de DNA tumoral circulante (ctDNA) antes e depois da cirurgia no sangue de pacientes que receberam tratamento neoadjuvante com quimioimunoterapia para câncer de mama triplo negativo (TNBC) inicial.

Haverá dois subgrupos: pacientes que ainda não iniciaram tratamento neoadjuvante (subcoorte 1) e pacientes que já iniciaram tratamento neoadjuvante (subcoorte 2).

A biópsia de uma lesão tumoral será realizada antes do início do tratamento neoadjuvante (somente para a subcoorte 1). A coleta de DNA constitucional, plasma e DNA tumoral circulante são planejados nesta coorte em diferentes momentos.

O principal objetivo desta coorte exploratória é caracterizar a taxa de detecção de ctDNA antes e durante a terapia com T-DXd (Trastuzumab deruxtecan) para pacientes com câncer de mama metastático HER2 baixo, que requerem tratamento com T-DXd.

A biópsia do tumor será realizada após a inclusão e antes do início do tratamento no ciclo 1 dia 1 para pelo menos 30 pacientes. A coleta de DNA constitucional está planejada nesta coorte em diferentes momentos: T1 e T2 (antes do início do tratamento) são críticos para avaliar a reprodutibilidade intrapaciente de biomarcadores líquidos. O T3 investigará a resposta à terapia enquanto o T4 se concentrará nos mecanismos de resistência.

O objetivo desta coorte é determinar o impacto prognóstico da detecção e monitoramento de DNA tumoral circulante em pacientes recebendo um inibidor de CDK4/6 no câncer de mama adjuvante.

Serão coletados 50 ml de sangue em tubos de EDTA para DNA constitucional e plasma para pesquisa de biomarcadores circulantes em diferentes momentos (4 momentos).

O objetivo desta coorte é estimar a incidência de detecção de ctDNA em pacientes com câncer de mama em estágio inicial durante o acompanhamento para detectar recidiva metastática mais cedo em pacientes assintomáticos.

A análise do ctDNA será realizada por meio de diversas técnicas, incluindo sequenciamento de próxima geração (NGS), com ou sem análise de tecido tumoral, como parte do tratamento padrão.

40 ml de amostras de sangue serão coletadas em quatro momentos:

• inscrição,
• 6 meses (+/- 15 dias),
• 12 meses (+/- 15 dias),
• 18 meses (+/- 15 dias) após a inclusão.

O objetivo desta coorte é:

• Gere dados sobre os níveis e a natureza do DNA tumoral circulante sob quimioimunoterapia.
• Monitore a evolução da resposta imune circulante sob quimioimunoterapia sistêmica.

A biópsia do tumor será realizada após a inclusão e antes do início do tratamento.

50 ml de amostras de sangue serão coletadas em quatro momentos:

• Na inclusão, antes de iniciar o tratamento neoadjuvante
• No início do ciclo 3 (C3J1) do tratamento neoadjuvante
• No momento da cirurgia (após tratamento neoadjuvante)
• No início do acompanhamento, ou seja, 3 meses (+/- 1 mês) após a cirurgia.

O objetivo desta coorte é:

• Avalie a sobrevida livre de recorrência (RFS) após cirurgia R0/R1

• Avaliar a eficácia do Tebentafusp associado à cirurgia em pacientes com metástases de melanoma uveal.

  3 subcoortes:

• Subcoorte 1: pacientes HLA-A*02:01 positivos, elegíveis para cirurgia R0 e Tebentafusp (n=20)
• Subcoorte 2: pacientes HLA-A*02:01 negativos, elegíveis para cirurgia R0 e imunoterapia na próxima recaída (n=20)
• Subcoorte 3: pacientes HLA-A*02:01 positivos, não elegíveis para cirurgia R0, mas elegíveis para Tebentafusp (n=20).

A biópsia do tumor será realizada durante a cirurgia (subcoortes n°1 e 2) ou após inclusão (subcoorte n°3).

Serão coletados 40 ml de sangue em tubos de EDTA para DNA constitucional e DNA circulante no plasma para pesquisa de biomarcadores em 4 momentos.

O objetivo desta coorte é:

• Caracterizar a cinética do ADNct durante o tratamento com um inibidor de CDK4/6.
• Estudar as ligações entre o ADNct e marcadores séricos comuns.

• Estudar as ligações entre o ADNct e marcadores derivados de imagiologia metabólica.

  Serão recolhidos 40 a 50 ml de sangue em tubos STRECK para ADN constitucional e ADN circulante no plasma para pesquisa de biomarcadores em diferentes momentos temporais.

O objetivo desta coorte é correlacionar os biomarcadores circulantes com a análise molecular de xenotransplantes derivados de doentes (PDX) estabelecidos a partir de cancros da mama.

10 ml de sangue serão recolhidos em tubos de EDTA para DNA constitucional na inclusão.

Amostras de tecido tumoral (para PDX) serão colhidas na inclusão para estabelecimento de PDX.