Analyse av sirkulerende tumormarkører i blod 4 - ALCINA 4 (ALCINA4)

Å oppdage gjenværende sykdom etter kirurgi er helt avgjørende innen onkologi, da denne påvisningen kan tillate personalisering av postoperative behandlinger basert på tilstedeværelse av gjenværende sykdom.

Laboratoriet ønsker å utvikle en ny teknikk for påvisning av sirkulerende tumor-DNA, basert på gjenkjennelse av translokasjonsfragmenter i sirkulerende DNA ved grunne helgenomsekvensering. Dette er en original tilnærming, som så langt vi vet ikke har blitt testet med den forutsatte bioinformatikk-tilnærmingen og kan potensielt være mer sensitiv enn teknikkene som for tiden brukes for å oppdage gjenværende sykdom etter kirurgisk fjerning av lokalisert (ikke-metastatisk) brystkreft.

Analysen vil derfor fokusere på søket etter tumorkromosomale translokasjoner, som vil måtte differensieres fra mulige kimlinjekromosomale translokasjoner. Det er derfor planlagt innsamling av konstitusjonelt DNA i denne kohorten.

Målet for denne kohorten er å studere rollen som variasjoner i sirkulerende tumor-DNA kan ha som en markør assosiert med respons under kjemoimmunterapi.

En ny biopsi (senere lagret frossen) er nødvendig for mutasjonsprofileringsanalyse (som vil bli brukt til å spore sirkulerende tumor-DNA i blodet). I tillegg vil den bli brukt til å analysere for tiden anerkjente biologiske vevsfaktorer for respons på kjemoimmunterapi (PD-L1-merking, mutasjonsbelastning, ...) og for å identifisere mulige assosiasjoner med sirkulerende tumor-DNA-variasjoner.

Konstitusjonell DNA-analyse er nødvendig for å bestemme punktmutasjoner som er tilstede i svulsten (for å kunne differensieres fra polymorfismer som er tilstede på konstitusjonelt nivå), da bestemmelsen av disse mutasjonene er avgjørende for å overvåke sirkulerende tumor-DNA og vil derfor bli samlet inn.

Målet med denne kohorten er utvikling av nye plasmatester, for eksempel basert på påvisning av kromosomale translokasjoner av sirkulerende tumor-DNA.

Hypotesen er at disse testene vil tillate påvisning av tilbakefall, prediksjon av behandlingseffekt og overvåking av behandlingseffekt ved ulike stadier av kreft hos pasienter med trippelnegativ brystkreft, enten i den ikke-metastatiske fasen med planlagt neo-adjuvans. behandling, eller i metastatisk fase. Antall inklusjoner mellom disse 2 populasjonene (neo-adjuvant og metastatisk) vil bli overvåket på operasjonsnivå for å unngå en overdreven ubalanse mot én gruppe.

Formålet med denne kohorten, basert på de tidligere resultatene, er å:

1. kvantifisere ekspresjonsnivået til målgener på tumor Regulatory T (Tregs) på proteinnivå,
2. utføre multiparametrisk FACS-analyse på blod- og tumorprøver fra pasienter behandlet ved Institut Curie, med bryst- eller eggstokkreft og for å forstå potensialet til disse målene som biomarkører for sykdom.

I sammenheng med denne ALCINA-4-kohorten nr. 4, for bryst- og eggstokkpasienter, vil 40 ml blod samles inn og tumorfragmenter oppnås fra kirurgi (50 brystpasienter) eller terapeutisk nødvendig biopsi (30 eggstokkpasienter). Ingen ytterligere biopsi enn de som hører til den terapeutiske prosessen vil bli utført i denne protokollen. Biopsier utført som en del av standard omsorg vil bli brukt dersom tilstrekkelig materiale er tilgjengelig.

Formålet med denne kohorten er å bestemme deteksjonsraten for sirkulerende tumor-DNA (ctDNA) før og etter operasjon i blodet til pasienter som fikk neoadjuvant behandling med kjemoimmunterapi for tidlig trippel-negativ brystkreft (TNBC).

Det vil være to undergrupper: pasienter som ennå ikke har startet neoadjuvant behandling (subkohort 1) og pasienter som allerede har startet neoadjuvant behandling (subkohort 2).

Biopsi av en tumorlesjon vil bli utført før oppstart av neoadjuvant behandling (kun for subkohort 1). Innsamlingen av konstitusjonelt DNA, plasma og sirkulerende tumor-DNA er planlagt i denne kohorten på forskjellige tidspunkt.

Hovedmålet med denne utforskende kohorten er å karakterisere deteksjonsraten av ctDNA før og under behandling med T-DXd (Trastuzumab deruxtecan) for pasienter med HER2-lavmetastatisk brystkreft, som krever behandling med T-DXd.

Tumorbiopsi vil bli utført etter inklusjon og før behandlingsstart på syklus 1 dag 1 for minst 30 pasienter. Innsamling av konstitusjonelt DNA er planlagt i denne kohorten på forskjellige tidspunkt: T1 og T2 (før behandlingsstart) er kritiske for å evaluere intra-pasient reproduserbarheten til flytende biomarkører. T3 vil undersøke responsen på terapi mens T4 vil fokusere på resistensmekanismer.

Formålet med denne kohorten er å bestemme den prognostiske effekten av sirkulerende tumor-DNA-deteksjon og overvåking hos pasienter som får en CDK4/6-hemmer i adjuvant brystkreft.

50 ml blod vil bli samlet i EDTA-rør for konstitusjonelt DNA og plasma for forskning på sirkulerende biomarkører på ulike tidspunkt (4 tidspunkt).