Analyse van circulerende tumormarkers in bloed 4 - ALCINA 4 (ALCINA4)

Het opsporen van restziekte na een operatie is absoluut cruciaal in de oncologie, aangezien deze detectie de personalisatie van postoperatieve behandelingen mogelijk zou kunnen maken op basis van de aanwezigheid van restziekte.

Het laboratorium wil een nieuwe techniek ontwikkelen voor de detectie van circulerend tumor-DNA, gebaseerd op de herkenning van translocatiefragmenten in circulerend DNA door ondiepe sequentiebepaling van het hele genoom. Dit is een originele aanpak, die voor zover wij weten tot nu toe niet is getest met de beoogde bioinformatica-benadering en mogelijk gevoeliger zou kunnen zijn dan de technieken die momenteel worden gebruikt om resterende ziekte op te sporen na chirurgische verwijdering van gelokaliseerde (niet-gemetastaseerde) borstkanker.

De analyse zal zich daarom concentreren op het zoeken naar chromosomale translocaties van tumoren, die moeten worden onderscheiden van mogelijke chromosomale translocaties van de kiembaan. In dit cohort is daarom de verzameling van constitutioneel DNA gepland.

Het doel van dit cohort is om de rol te bestuderen die variaties in circulerend tumor-DNA zouden kunnen hebben als marker geassocieerd met respons tijdens chemo-immunotherapie.

Een verse biopsie (vervolgens ingevroren bewaard) is vereist voor analyse van mutatieprofielen (die zal worden gebruikt om circulerend tumor-DNA in het bloed te volgen). Bovendien zal het gebruikt worden om momenteel erkende biologische weefselfactoren van respons op chemoimmunotherapie (PD-L1-labeling, mutatiebelasting, ...) te analyseren en om mogelijke associaties met circulerende tumor-DNA-variaties te identificeren.

Constitutionele DNA-analyse is noodzakelijk voor de bepaling van puntmutaties die aanwezig zijn in de tumor (te onderscheiden van polymorfismen aanwezig op constitutioneel niveau), aangezien de bepaling van deze mutaties essentieel is om circulerend tumor-DNA te monitoren en daarom zal worden verzameld.

Het doel van dit cohort is de ontwikkeling van nieuwe plasmatesten, bijvoorbeeld gebaseerd op de detectie van chromosomale translocaties van circulerend tumor-DNA.

De hypothese is dat deze tests het mogelijk zouden maken om recidief op te sporen, de effectiviteit van de behandeling te voorspellen en de effectiviteit van de behandeling te monitoren in verschillende stadia van kanker bij patiënten met triple-negatieve borstkanker, hetzij in de niet-gemetastaseerde fase met geplande neo-adjuvante behandeling, of in de metastatische fase. Het aantal inclusies tussen deze 2 populaties (neo-adjuvans en metastatisch) zal op operationeel niveau worden gecontroleerd om een ​​buitensporige onevenwichtigheid ten opzichte van één groep te vermijden.

Het doel van dit cohort, gebaseerd op de eerdere resultaten, is om:

1. het expressieniveau van doelgenen op tumor Regulatory T (Tregs) op eiwitniveau kwantificeren,
2. multiparametrische FACS-analyse uitvoeren op bloed- en tumormonsters van patiënten die in het Institut Curie zijn behandeld met borst- of eierstokkanker en om het potentieel van deze doelwitten als biomarkers van ziekte te begrijpen.

In het kader van dit ALCINA-4-cohort nr. 4 wordt bij borst- en eierstokpatiënten 40 ml bloed afgenomen en worden tumorfragmenten verkregen via een operatie (50 borstpatiënten) of een therapeutisch vereiste biopsie (30 eierstokpatiënten). In dit protocol worden geen aanvullende biopsie uitgevoerd dan die behorend bij het therapeutische proces. Biopsieën uitgevoerd als onderdeel van de standaardzorg zullen worden gebruikt als er voldoende materiaal beschikbaar is.

Het doel van dit cohort is het bepalen van het detectiepercentage van circulerend tumor-DNA (ctDNA) voor en na de operatie in het bloed van patiënten die een neoadjuvante behandeling met chemo-immunotherapie kregen voor vroege triple-negatieve borstkanker (TNBC).

Er zullen twee subgroepen zijn: patiënten die nog niet zijn begonnen met neoadjuvante behandeling (subcohort 1) en patiënten die al zijn begonnen met neoadjuvante behandeling (subcohort 2).

Biopsie van een tumorlaesie zal worden uitgevoerd vóór aanvang van de neoadjuvante behandeling (alleen voor subcohort 1). De verzameling van constitutioneel DNA, plasma en circulerend tumor-DNA wordt in dit cohort op verschillende tijdstippen gepland.

Het hoofddoel van dit verkennende cohort is het karakteriseren van de detectiegraad van ctDNA vóór en tijdens therapie met T-DXd (Trastuzumab deruxtecan) voor patiënten met HER2-laag gemetastaseerde borstkanker, die behandeling met T-DXd nodig hebben.

Tumorbiopsie zal worden uitgevoerd na inclusie en vóór aanvang van de behandeling op cyclus 1 dag 1 voor ten minste 30 patiënten. De verzameling van constitutioneel DNA is in dit cohort op verschillende tijdstippen gepland: T1 en T2 (voor aanvang van de behandeling) zijn van cruciaal belang om de intra-patiënt reproduceerbaarheid van vloeibare biomarkers te evalueren. T3 zal de respons op therapie onderzoeken, terwijl T4 zich zal richten op resistentiemechanismen.

Het doel van dit cohort is om de prognostische impact te bepalen van detectie en monitoring van circulerend tumor-DNA bij patiënten die een CDK4/6-remmer krijgen bij adjuvante borstkanker.

Er zal 50 ml bloed worden verzameld in EDTA-buisjes voor constitutioneel DNA en plasma voor onderzoek naar circulerende biomarkers op verschillende tijdstippen (4 tijdstippen).

Het doel van dit cohort is het schatten van de incidentie van ctDNA-detectie bij patiënten met borstkanker in een vroeg stadium tijdens de follow-up, om metastatische terugval eerder te detecteren bij asymptomatische patiënten.

ctDNA-analyse zal worden uitgevoerd met behulp van verschillende technieken, waaronder next-generation sequencing (NGS), met of zonder analyse van tumorweefsel, als onderdeel van de standaardzorg.

Er wordt op vier tijdstippen 40 ml bloedmonsters verzameld:

• inschrijving,
• 6 maanden (+/- 15 dagen),
• 12 maanden (+/- 15 dagen),
• 18 maanden (+/- 15 dagen) na opname.

Het doel van dit cohort is om:

• Genereer gegevens over de niveaus en aard van circulerend tumor-DNA onder chemo-immunotherapie.
• Volg de evolutie van de circulerende immuunrespons onder systemische chemo-immunotherapie.

Tumorbiopsie zal worden uitgevoerd na opname en vóór aanvang van de behandeling.

Er wordt op vier tijdstippen 50 ml bloedmonsters verzameld:

• Bij inclusie, vóór aanvang van de neoadjuvante behandeling
• Aan het begin van cyclus 3 (C3J1) van de neoadjuvante behandeling
• Op het moment van de operatie (na neoadjuvante behandeling)
• Bij aanvang van de monitoring, d.w.z. 3 maanden (+/- 1 maand) na de operatie.

Het doel van dit cohort is om:

• Evalueer de recidiefvrije overleving (RFS) na een R0/R1-operatie

• Beoordeel de effectiviteit van Tebentafusp in verband met een operatie bij patiënten met metastasen van uveale melanoom.

  3 subcohorten:

• Subcohort 1: HLA-A*02:01-positieve patiënten, die in aanmerking komen voor R0-chirurgie en Tebentafusp (n=20)
• Subcohort 2: HLA-A*02:01-negatieve patiënten, die in aanmerking komen voor R0-operatie en immunotherapie bij het volgende recidief (n=20)
• Subcohort 3: HLA-A*02:01-positieve patiënten, die niet in aanmerking komen voor een R0-operatie maar wel in aanmerking komen voor Tebentafusp (n=20).

Tumorbiopsie zal worden uitgevoerd tijdens de operatie (subcohorten nr. 1 en 2) of na inclusie (subcohort nr. 3).

Er wordt 40 ml bloed verzameld in EDTA-buisjes voor constitutioneel DNA en circulerend DNA in plasma voor onderzoek naar biomarkers op 4 tijdstippen.

Het doel van deze cohort is:

• De kinetiek van ctDNA tijdens behandeling met een CDK4/6-remmer karakteriseren.
• De verbanden tussen ctDNA en veelvoorkomende serummarkers bestuderen.

• De verbanden tussen ctDNA en markers afkomstig van metabole beeldvorming bestuderen.

  Er zal 40 tot 50 ml bloed worden afgenomen in STRECK-buizen voor constitutioneel DNA en circulerend DNA in plasma voor onderzoek naar biomarkers op verschillende tijdstippen.

Het doel van deze cohort is om de circulerende biomarkers te correleren met moleculaire analyse van patiënt-afgeleide xenografts (PDX) die zijn opgezet uit borstkankers.

10 ml bloed zal worden afgenomen in EDTA-buizen voor constitutioneel DNA bij inclusie.

Tumorweefselmonsters (voor PDX) zullen worden afgenomen bij inclusie voor PDX-oprichting.