감염성 심내막염 환자의 병원체를 식별하기 위한 Metagenomic 혈액 샘플링의 정확성 (AMetIP)
감염성 심내막염은 일반적으로 박테리아가 심장을 공격하여 판막 누출을 유발하고 판막에서 떨어져 나와 중요한 기관으로의 혈액 공급을 차단할 수 있는 박테리아 덩어리를 생성하는 감염입니다.
우리는 이 질병의 치료를 개선하기 위해 매우 열중하고 있으며 환자에게 제공하는 치료법의 영향을 측정하여 어떤 치료법이 가장 효과가 좋고 어떤 치료법이 덜 성공적인지에 대한 명확한 아이디어를 얻고 있습니다.
치료의 핵심 부분은 적절한 표적 항생제와 항진균제를 투여할 수 있도록 원인 유기체를 정확하게 판별하는 것입니다.
정확한 항생제 처방을 위해서는 원인균의 검출과 각 항생제에 대한 민감도가 필요합니다. 그런 다음 항생제 선택은 효과, 독성, 사용 용이성 및 국가 지침을 기반으로 합니다. 현재 박테리아를 식별하는 가장 좋은 기술은 혈액 샘플에서 유기체를 배양하여 식별하는 혈액 배양입니다. 하지만 검체 채취부터 최대 5일이 소요돼 정확한 진단이 늦어지는 결과를 낳는다. 이 때까지 치료에는 더 독성이 강한 일반적인 항생제 요법을 사용해야 합니다.
혈액에서 원인균을 식별하는 새로운 기술이 등장하고 있습니다. Metagenomics를 사용하면 박테리아 DNA의 서열 분석을 통해 감염 유기체를 정확하게 식별할 수 있습니다.
연구 개요
상태
정황
상세 설명
감염성 심내막염(IE)은 박테리아나 곰팡이가 심장 판막에 정착하여 조직을 손상시킬 때 발생합니다. 이 질병은 치명적일 수 있으며 사망, 심부전, 뇌졸중, 신부전 및 기타 합병증을 초래할 수 있습니다. 심내막염의 경우 판막 손상의 경우 약 50%에서 심장 수술이 필요합니다. 조기 항생제 치료는 합병증을 줄이고 예후를 향상시켜 수술의 필요성을 줄여줍니다. 이는 효과적이고 표적화된 항균 요법을 시행하기 위해 원인균을 신속하고 정확하게 파악하는 데 달려 있습니다.
현재 박테리아를 식별하는 가장 좋은 기술은 혈액 배양입니다. 유기체는 혈액에서 배양하여 식별합니다. 그러나 일반적으로 최대 5일이 소요됩니다.
최대 18%의 환자에서 혈액 배양으로 원인균인 혈액 배양 음성 감염성 심내막염(BCNIE)을 식별하지 못합니다. 결과적으로, 환자들은 표적 요법보다 독성이 더 큰 광범위한 항생제로 치료를 받게 되어 합병증 발생률이 높아집니다. 따라서 표준 혈액 배양에 대한 대체 기술이 필요합니다.
임상 메타유전체학(CMg)을 사용하면 혈액 샘플에서 박테리아 DNA의 서열을 분석하여 병원체를 정확하고 신속하게 식별할 수 있습니다. 지금까지 이 기술은 비용이 많이 들고 제한적이었습니다. 새로운 기술은 CMg의 면모를 변화시키고 있으며 잠재적으로 낮은 비용으로 유기체를 신속하게 식별할 수 있게 해줍니다.
Barts Heart Center(BHC)는 세계에서 가장 큰 심장 센터 중 하나이며 매년 150건의 IE 사례를 관리합니다. IE의 사망률은 최근 발표된 EuroENDO 연구에서 17.1%로 여전히 높지만 Barts 심장 센터의 병원 사망률은 ~13%입니다.
Quadram Institute(QI)는 BBSRC(생명공학 및 생물과학 연구 위원회)의 자금 지원을 받는 연구 기관으로 두 개의 Nature 논문을 포함하여 CMg에 대한 특별한 전문 지식을 보유하고 있습니다.
200명의 환자를 대상으로 한 이 연구에서는 혈액 CMg의 정확성을 평가하고 비용 효율성과 함께 샘플링에 가장 적합한 시간을 식별합니다. 환자는 정기적으로 채취한 입원 혈액 샘플과 함께 QI로 보낼 혈액 10mL를 추가로 요청받게 됩니다.
또한 수술이 임상적으로 필요한 경우 절제된 심장 판막 조직 중 일부도 CMg 분석을 위해 전송됩니다. CMg의 결과는 혈액 배양과 비교됩니다. IE 이외의 적응증으로 인해 판막 수술을 받은 환자의 대조군도 모집됩니다.
NHS 내에서 임상 CMg 서비스의 향후 시운전을 지원하기 위해 심내막염 진단 및 치료 경로에서 CMg 사용에 대한 비용 효율성 분석이 개발될 것입니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 장소
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London, 영국, EC1A 7BE
- St Bartholomew's Hospital. West Smithfield
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
샘플은 질병 관리를 위해 BHC 심내막염 MDT 회의에 회부된 임상시험에 참여한 병원의 연속 환자 그룹이 될 것입니다. 매년 약 150건의 사례가 심내막염 MDT에 의뢰되며, 퇴원 시 환자의 17%에서 심내막염 진단을 거부합니다(의뢰 시점에 해당 사례가 많이 선택됨).
이 연구는 실제 환자 그룹에 실행 가능하고 적용 가능하도록 설계되었습니다. 따라서 우리는 임상 심내막염 MDT의 결정에 따라 동의하고 심내막염 가능성이 있거나 확실한 모든 환자를 연구할 것입니다. 실제로, 치료가 완료될 때 심내막염 가능성이 있는 그룹에 남아 있는 숫자는 매우 적지만(<5%) 환자가 처음 의뢰되었을 때는 약 20%가 해당 범주에 속합니다. 질병이 진행됨에 따라 정확한 진단이 빠르게 명확해집니다. 특히 수술 후에는 더욱 그렇습니다.
설명
포함 기준:
- BHC 심내막염 MDT로 언급된 IE 가능성 또는 확인된 환자
- 연령 >18
- 사전 동의를 제공할 수 있고 기꺼이 제공할 의사가 있음
제외 기준:
- MDT에서 심내막염 진단을 "거부"한 환자. 연구에 참여한 후 이러한 일이 발생하면 샘플은 폐기되고 환자에게 통보됩니다.
- 연구 시작 시점에 7일 이상 정맥 내 항생제 치료를 받은 환자.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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혈액에서 CMG의 진단 정확도
기간: 3 년
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이 연구의 주요 목표는 혈액 샘플의 메타 게놈 테스트에서 발견 된 유기체를 IE를 가진 전향 적 순차 환자의 혈액 배양에서 발견 된 유기체와 유기체와 혈액 배양, 외과 적으로 배정 된 밸브 조직 배양 (수술이 수행되는 곳) 및 임상 참조 그룹의 의견을 비교하는 것입니다.
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3 년
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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1. 최적의 채혈 시기
기간: 3 년
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IE에서 나노기공 CMg에 대한 최적의 혈액 샘플링 시기는 알려져 있지 않습니다.
따라서 우리는 실험실에 보관된 첫 번째 사용 가능한 EDTA(Ethylenediaminetetraacetic acid) 저장 샘플을 검사하고 이를 아마도 며칠 후 연구를 위해 특별히 채취한 샘플의 결과와 비교할 것입니다.
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3 년
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3. 메타게놈 기법
기간: 3 년
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우리는 Nanopore 플랫폼에서 16s 혈액 테스트와 숙주 억제라는 두 가지 다른 메타게놈 기술을 비교할 것입니다.
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3 년
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BCNIE 환자의 원인 유기체를 식별하는 데 나노 포어 CMG의 결과를 평가합니다.
기간: 3 년
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식별 된 모든 유기체는 전문가 패널에 의해 세 가지 범주 중 하나로 등급이 매겨집니다.
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3 년
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공동 작업자 및 조사자
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
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