Précision de l'échantillonnage sanguin métagénomique pour identifier l'agent pathogène chez les patients atteints d'endocardite infectieuse (AMetIP)
L'endocardite infectieuse est une infection, généralement une bactérie, qui attaque le cœur et peut provoquer une fuite des valvules et produire une masse bactérienne qui peut se détacher des valvules et bloquer l'apport sanguin aux organes importants.
Nous sommes très désireux d'améliorer le traitement de cette maladie et nous mesurons l'impact des traitements que nous donnons aux patients afin d'avoir une idée très claire de ceux qui fonctionnent le mieux et également de ceux qui réussissent le moins.
Un élément clé du traitement est la détermination précise de l’organisme responsable, ce qui permet d’administrer des médicaments antibiotiques et antifongiques ciblés appropriés.
Des régimes antibiotiques précis nécessitent la détection de l'organisme causal et de sa sensibilité à chaque antibiotique. Le choix des antibiotiques repose alors sur l’efficacité, la toxicité, la facilité d’utilisation et les directives nationales. La meilleure technique actuelle pour identifier les bactéries est l’hémoculture, où les organismes sont identifiés en les cultivant à partir d’échantillons de sang. Cependant, cela prend jusqu'à 5 jours à compter du prélèvement, ce qui entraîne des retards dans l'établissement d'un diagnostic correct. Jusqu’à présent, le traitement nécessite l’utilisation de régimes antibiotiques génériques plus toxiques.
De nouvelles techniques font leur apparition pour identifier les organismes responsables à partir du sang. La métagénomique permet le séquençage de l'ADN bactérien permettant une identification précise de l'organisme infectieux.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
L'endocardite infectieuse (IE) survient lorsque des bactéries ou des champignons se déposent sur les valvules cardiaques et endommagent les tissus. La maladie peut être catastrophique et entraîner la mort, une insuffisance cardiaque, un accident vasculaire cérébral, une insuffisance rénale et d'autres complications. Les lésions valvulaires nécessitent une chirurgie cardiaque dans environ 50 % des cas d'endocardite ; un traitement antibiotique précoce réduit les complications et améliore le pronostic, réduisant ainsi le recours à la chirurgie. Cela dépend d’une détermination rapide et précise de l’organisme causal pour administrer un traitement antimicrobien efficace et ciblé.
La meilleure technique actuelle pour identifier les bactéries est l’hémoculture : les organismes sont identifiés en les cultivant à partir du sang. Cependant, cela prend généralement jusqu'à 5 jours.
Chez jusqu'à 18 % des patients, l'hémoculture ne parvient pas à identifier un organisme causal : l'endocardite infectieuse à hémoculture négative (BCNIE). En conséquence, les patients sont traités avec des antibiotiques à spectre plus large, qui présentent une plus grande toxicité que les schémas thérapeutiques ciblés, ce qui entraîne des taux de complications plus élevés. Des technologies alternatives à l’hémoculture standard sont donc nécessaires.
La métagénomique clinique (CMg) permet le séquençage de l'ADN bactérien à partir d'échantillons de sang, permettant une identification précise et rapide de l'agent pathogène. Jusqu’à présent, cette technologie était coûteuse et limitée. Les nouvelles technologies changent le visage de la CMG et permettront potentiellement d’identifier rapidement les organismes à faible coût.
Le Barts Heart Center (BHC) est l'un des plus grands centres cardiaques au monde, gérant 150 cas d'IE par an. Alors que la mortalité liée à l'IE reste élevée - 17,1 % dans l'étude EuroENDO récemment publiée - la mortalité hospitalière au Barts Heart Center est d'environ 13 %.
Le Quadram Institute (QI) est un institut de recherche financé par le Conseil de recherche en biotechnologie et en sciences biologiques (BBSRC) qui possède une expertise particulière en CMG, notamment deux articles sur Nature.
Cette étude portant sur 200 patients évaluera l'exactitude de la CMg sanguine et identifiera le meilleur moment pour prélever des échantillons ainsi que sa rentabilité. Il sera demandé aux patients 10 ml supplémentaires de sang qui seront envoyés à QI avec un échantillon de sang d'admission régulièrement prélevé.
De plus, si une intervention chirurgicale est cliniquement nécessaire, une partie du tissu valvulaire cardiaque réséqué sera également envoyé pour analyse CMg. Les résultats de la CMg seront comparés à l'hémoculture. Un groupe témoin de patients subissant une chirurgie valvulaire pour des indications non IE sera également recruté.
Pour faciliter la mise en service future d'un service clinique de CMg au sein du NHS, une analyse coût-efficacité de l'utilisation de la CMg dans le diagnostic et le parcours de traitement de l'endocardite sera développée.
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Lieux d'étude
-
-
-
London, Royaume-Uni, EC1A 7BE
- St Bartholomew's Hospital. West Smithfield
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
L'échantillon sera un groupe consécutif de patients des hôpitaux participant à l'essai référés à la réunion BHC Endocarditis MDT pour la prise en charge de leur maladie. Environ 150 cas sont référés chaque année à l'EMD Endocardite et nous rejetons le diagnostic d'endocardite chez 17% des patients au moment de leur sortie (les cas sont hautement sélectionnés au moment de leur référence).
L'étude est conçue pour être réalisable et applicable à un groupe de patients du monde réel. Ainsi, nous étudierons tous les patients qui donnent leur consentement et ont une endocardite possible ou certaine selon la détermination du MDT clinique de l'endocardite. En pratique, au moment où le traitement est terminé, le nombre de personnes restant dans le groupe d'endocardite possible est très faible (<5 %), bien que lorsque le patient est référé pour la première fois, environ 20 % appartiennent à cette catégorie. Au fur et à mesure que la maladie progresse, le diagnostic correct apparaît rapidement, surtout après une intervention chirurgicale.
La description
Critère d'intégration:
- Patients présentant une EI possible ou confirmée référés au PCT pour endocardite BHC
- Âge >18
- Capable et disposé à donner son consentement éclairé
Critère d'exclusion:
- Patients dont le diagnostic d'endocardite est « rejeté » par la PCT. Si cela se produit après l'entrée dans l'étude, les échantillons seront jetés et le patient informé.
- Patients traités avec des antibiotiques intraveineux pendant plus de 7 jours au moment de l'entrée à l'étude.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
Précision diagnostique du CMG dans le sang
Délai: 3 ans
|
L'objectif principal de cette étude est de comparer les organismes trouvés à partir de tests métagénomiques d'échantillons de sang avec des organismes trouvés à partir d'hémoculture à partir d'une série prospective de patients séquentiels avec IE et par rapport à l'hémoculture, à la culture tissulaire de valve reseudée chirurgicale (où la chirurgie est entreprise) et l'opinion d'un groupe de référence clinique en chirurgie
|
3 ans
|
Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
1. Moment optimal du prélèvement sanguin
Délai: 3 années
|
Le moment optimal du prélèvement sanguin pour le nanopore CMg dans l’IE est inconnu.
Ainsi, nous examinerons le premier échantillon disponible d’acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA) conservé dans les laboratoires et le comparerons aux résultats d’un échantillon prélevé spécialement pour l’étude, probablement quelques jours plus tard.
|
3 années
|
|
3. Techniques métagénomiques
Délai: 3 années
|
Nous comparerons deux techniques métagénomiques différentes : les tests sanguins 16s et la suppression de l'hôte sur la plateforme Nanopore.
|
3 années
|
|
Pour évaluer les résultats du Nanopore CMG dans l'identification de l'organisme causal chez les patients atteints de BCNIE
Délai: 3 ans
|
Tout organisme identifié sera classé par un panel d'experts dans l'une des trois catégories:
|
3 ans
|
Collaborateurs et enquêteurs
Parrainer
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Mots clés
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- 280992
Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .