Přesnost metagenomického odběru krve k identifikaci patogenu u pacientů s infekční endokarditidou (AMetIP)
Infekční endokarditida je infekce, obvykle bakterie, která napadá srdce a může způsobit netěsnost chlopní a produkovat bakteriální hmotu, která se může od chlopní oddělit a blokovat přívod krve do důležitých orgánů.
Velmi se snažíme zlepšit léčbu tohoto onemocnění a měříme dopad léčby, kterou pacientům poskytujeme, abychom měli velmi jasnou představu o tom, která léčba funguje nejlépe a která je méně úspěšná.
Klíčovou součástí léčby je přesné určení původce onemocnění, které umožňuje podání vhodné cílené antibiotické a antimykotické medikace.
Přesné antibiotické režimy vyžadují detekci původce a jeho citlivosti na každé antibiotikum. Volba antibiotika je pak založena na účinnosti, toxicitě, snadnosti použití a národních doporučeních. Současnou nejlepší technikou pro identifikaci bakterií je hemokultura, kde se organismy identifikují jejich pěstováním ze vzorků krve. To však trvá až 5 dní od odběru vzorků, což vede ke zpoždění správné diagnózy. Do této doby léčba vyžaduje použití generických, toxičtějších antibiotických režimů.
Objevují se nové techniky k identifikaci původců z krve. Metagenomika umožňuje sekvenování bakteriální DNA umožňující přesnou identifikaci infikujícího organismu.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Infekční endokarditida (IE) nastává, když se bakterie nebo houby usadí na srdečních chlopních a poškodí tkáně. Onemocnění může být katastrofální a může mít za následek smrt, srdeční selhání, mrtvici, selhání ledvin a další komplikace. Chlopenní poškození vyžaduje kardiochirurgický výkon přibližně v 50 % s endokarditidou; včasná léčba antibiotiky snižuje komplikace a zlepšuje prognózu, snižuje potřebu chirurgického zákroku. To závisí na rychlém a přesném určení původce, aby bylo možné podat účinnou a cílenou antimikrobiální terapii.
Současnou nejlepší technikou pro identifikaci bakterií je hemokultura – organismy se identifikují tak, že se vypěstují z krve. To však obvykle trvá až 5 dní.
Až u 18 % pacientů se hemokulturou nepodaří identifikovat vyvolávající organismus – Blood Culture Negative Infective Endocarditis (BCNIE). V důsledku toho jsou pacienti léčeni antibiotiky se širším spektrem, která mají vyšší toxicitu než cílené režimy, což vede k vyššímu výskytu komplikací. Proto jsou zapotřebí alternativní technologie ke standardní hemokultivaci.
Klinická metagenomika (CMg) umožňuje sekvenování bakteriální DNA ze vzorků krve, což umožňuje přesnou a rychlou identifikaci patogenu. Doposud byla tato technologie drahá a omezená. Nová technologie mění tvář CMg a potenciálně umožní rychlou identifikaci organismů s nízkými náklady.
Barts Heart Center (BHC) je jedním z největších srdečních center na světě, které ročně zpracuje 150 případů IE. Zatímco úmrtnost na IE zůstává vysoká – 17,1 % v nedávno zveřejněné studii EuroENDO – v nemocnici v Barts Heart Center je úmrtnost ~13 %.
Quadram Institute (QI) je výzkumný ústav financovaný Radou pro výzkum biotechnologií a biologických věd (BBSRC), který má speciální odborné znalosti v oblasti CMg, včetně dvou článků Nature.
Tato studie na 200 pacientech posoudí přesnost krevního CMg a určí nejvhodnější dobu pro odběr vzorků spolu s její nákladovou efektivitou. Pacienti budou požádáni o 10 ml krve navíc, která bude odeslána na QI spolu s rutinně odebraným vstupním vzorkem krve.
Pokud je navíc klinicky nutný chirurgický zákrok, část resekované tkáně srdeční chlopně bude také odeslána na analýzu CMg Výsledky z CMg budou porovnány s hemokulturou. Bude také přijata kontrolní skupina pacientů podstupujících operaci chlopně pro non-IE indikace.
Pro budoucí zprovoznění klinické služby CMg v rámci NHS bude vypracována analýza nákladové efektivity použití CMg v diagnostice a léčbě endokarditidy.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
London, Spojené království, EC1A 7BE
- St Bartholomew's Hospital. West Smithfield
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Vzorkem bude po sobě jdoucí skupina pacientů z nemocnic ve studii, která bude odeslána na setkání MDT s BHC endokarditidou k léčbě jejich onemocnění. Na endokarditickou MDT je ročně odesláno přibližně 150 případů a v době propuštění odmítáme diagnózu endokarditidy u 17 % pacientů (případy jsou v době odeslání vysoce selektované).
Studie je navržena tak, aby byla proveditelná a použitelná pro skupinu pacientů v reálném světě. Budeme tedy studovat všechny pacienty, kteří dají souhlas a mají možnou nebo jednoznačnou endokarditidu podle stanovení klinické endokarditidy MDT. V praxi je v době, kdy je léčba dokončena, počet zbývajících ve skupině s možnou endokarditidou velmi malý (<5 %), i když při prvním doporučení pacienta je v této kategorii přibližně 20 %. Jak nemoc postupuje v průběhu, správná diagnóza se rychle ukáže - zvláště po operaci.
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Pacienti s možnou nebo potvrzenou IE odkazovali na BHC Endocarditis MDT
- Věk >18
- Schopný a ochotný dát informovaný souhlas
Kritéria vyloučení:
- Pacienti, u kterých MDT „odmítne“ diagnózu endokarditidy. Pokud k tomu dojde po vstupu do studie, vzorky budou vyřazeny a pacient bude informován.
- Pacienti, kteří byli v době vstupu do studie léčeni intravenózními antibiotiky déle než 7 dní.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Diagnostická přesnost CMG v krvi
Časové okno: 3 roky
|
Primárním cílem této studie je porovnat organismy zjištěné z metagenomického testování vzorků krve s organismy nalezenými z krve kultury z prospektivní řady sekvenčních pacientů s IE a porovnáním s kulturou krve, chirurgicky reagovanou tkáňovou kulturu ventilů (kde se provádí chirurgický zákrok) a názor na klinickou referenční skupinu)
|
3 roky
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
1. Optimální načasování odběru krve
Časové okno: 3 roky
|
Optimální načasování odběru krve pro nanopórové CMg u IE není známo.
Budeme tedy zkoumat první dostupný vzorek kyseliny ethylendiamintetraoctové (EDTA) uchovávaný v laboratořích a porovnáme jej s výsledky vzorku odebraného speciálně pro studii, pravděpodobně o několik dní později.
|
3 roky
|
|
3. Metagenomické techniky
Časové okno: 3 roky
|
Porovnáme dvě různé metagenomické techniky - 16s krevní testování a potlačení hostitele na platformě Nanopore.
|
3 roky
|
|
Vyhodnotit výsledky nanopore CMG při identifikaci kauzativního organismu u pacientů s BCNIE
Časové okno: 3 roky
|
Jakýkoli identifikovaný organismus bude hodnocen panelem odborníků do jedné ze tří kategorií:
|
3 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 280992
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .