宏基因组血液采样鉴定感染性心内膜炎患者病原体的准确性 (AMetIP)

当细菌或真菌附着在心脏瓣膜上并损害组织时，就会发生感染性心内膜炎 (IE)。 这种疾病可能是灾难性的，导致死亡、心力衰竭、中风、肾衰竭和其他并发症。 大约 50% 的瓣膜损伤合并心内膜炎时需要进行心脏手术；早期抗生素治疗可减少并发症并改善预后，从而减少手术的需要。 这取决于快速、准确地确定致病微生物，以实施有效且有针对性的抗菌治疗。

目前识别细菌的最佳技术是血培养——通过从血液中培养微生物来识别微生物。 但是，这通常需要长达 5 天的时间。

在高达 18% 的患者中，血培养未能识别出致病微生物 - 血培养阴性感染性心内膜炎 (BCNIE)。 因此，患者接受更广谱的抗生素治疗，这些抗生素的毒性比靶向治疗方案更大，从而导致更高的并发症发生率。 因此需要标准血培养的替代技术。

临床宏基因组学 (CMg) 可对血液样本中的细菌 DNA 进行测序，从而精确、快速地识别病原体。 迄今为止，这项技术既昂贵又有限。 新技术正在改变 CMg 的面貌，并有可能以低成本快速识别生物体。

Barts 心脏中心 (BHC) 是世界上最大的心脏中心之一，每年处理 150 例 IE 病例。 虽然 IE 的死亡率仍然很高（最近发表的 EuroENDO 研究中为 17.1%），但 Barts 心脏中心的医院死亡率约为 13%。

Quadram 研究所 (QI) 是一家生物技术和生物科学研究委员会 (BBSRC) 资助的研究机构，在 CMg 方面拥有特殊专业知识，包括两篇《自然》论文。

这项针对 200 名患者的研究将评估血液 CMg 的准确性，并确定最佳采样时间及其成本效益。 患者将被要求额外提供 10 mL 血液，这些血液将与常规采集的入院血样一起送往 QI。

此外，如果临床上需要手术，一些切除的心脏瓣膜组织也将被送去进行 CMg 分析，CMG 的结果将与血培养结果进行比较。 还将招募因非 IE 适应症而接受瓣膜手术的对照组患者。

为了协助 NHS 内临床 CMg 服务的未来调试，将开发 CMg 在心内膜炎诊断和治疗途径中使用的成本效益分析。