A metagenomikus vérminta pontossága a kórokozó azonosítására fertőző endocarditisben szenvedő betegekben (AMetIP)
A fertőző endokarditisz egy fertőzés, általában baktérium, amely megtámadja a szívet, és a billentyűk szivárgását okozhatja, és baktériumtömeget termel, amely letörhet a billentyűkről, és elzárhatja a fontos szervek vérellátását.
Nagyon szeretnénk javítani ennek a betegségnek a kezelését, és mérjük a betegeknek nyújtott kezelések hatását, hogy nagyon világos elképzelésünk legyen arról, mely kezelések működnek a legjobban, és melyek azok a kezelések, amelyek kevésbé sikeresek.
A kezelés kulcsfontosságú része a kórokozó pontos meghatározása, amely lehetővé teszi a megfelelő célzott antibiotikum és gombaellenes gyógyszer beadását.
A pontos antibiotikum-kezeléshez meg kell határozni a kórokozót és annak érzékenységét az egyes antibiotikumokkal szemben. Az antibiotikum kiválasztása a hatékonyságon, a toxicitáson, a könnyű használaton és a nemzeti irányelveken alapul. A baktériumok azonosításának jelenlegi legjobb módszere a vérkultúra, ahol az élőlényeket vérmintákból történő növesztéssel azonosítják. Ez azonban a mintavételtől számított 5 napig is eltarthat, ami késleltetheti a helyes diagnózis felállítását. Addig a kezeléshez általános, toxikusabb antibiotikum-kezelést kell alkalmazni.
Új technikák jelennek meg a kórokozók vérből történő azonosítására. A metagenomika lehetővé teszi a bakteriális DNS szekvenálását, lehetővé téve a fertőző szervezet pontos azonosítását.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Körülmények
Részletes leírás
A fertőző endokarditisz (IE) akkor fordul elő, amikor baktériumok vagy gombák telepednek meg a szívbillentyűkön és károsítják a szöveteket. A betegség katasztrofális lehet, és halálhoz, szívelégtelenséghez, stroke-hoz, veseelégtelenséghez és egyéb szövődményekhez vezethet. A szívbillentyű-károsodás körülbelül 50%-ban szívműtétet igényel endocarditis esetén; A korai antibiotikus kezelés csökkenti a szövődményeket és javítja a prognózist, csökkentve a műtét szükségességét. Ez a kórokozó gyors és pontos meghatározásától függ a hatékony és célzott antimikrobiális terápia beadása érdekében.
A baktériumok azonosításának jelenlegi legjobb módszere a vérkultúra – az élőlényeket úgy azonosítják, hogy vérből növesztik őket. Ez azonban általában 5 napig tart.
A betegek 18%-ánál a vérkultúra nem képes azonosítani a kórokozót – a vérkultúra negatív fertőző endokarditist (BCNIE). Ennek eredményeként a betegeket szélesebb spektrumú antibiotikumokkal kezelik, amelyek nagyobb toxicitást mutatnak, mint a célzott kezelések, ami magasabb szövődmények arányát eredményezi. Ezért a standard vértenyésztés helyett alternatív technológiákra van szükség.
A klinikai metagenomika (CMg) lehetővé teszi a bakteriális DNS szekvenálását vérmintákból, lehetővé téve a kórokozó pontos, gyors azonosítását. Eddig ez a technológia drága és korlátozott volt. Az új technológia megváltoztatja a CMg arculatát, és potenciálisan lehetővé teszi az organizmusok gyors és alacsony költségű azonosítását.
A Barts Heart Center (BHC) a világ egyik legnagyobb kardiológiai központja, évente 150 IE-esetet kezel. Míg az IE miatti mortalitás továbbra is magas – a közelmúltban közzétett EuroENDO tanulmány szerint 17,1%, addig a Barts Heart Center kórházi mortalitása ~13%.
A Quadram Institute (QI) a Biotechnológiai és Biológiai Tudományok Kutatói Tanácsa (BBSRC) által finanszírozott kutatóintézet különleges szakértelemmel rendelkezik a CMg területén, beleértve két Nature-dokumentumot.
Ez a 200 beteg bevonásával végzett vizsgálat felméri a vér CMg pontosságát, és meghatározza a legjobb időpontot a mintavételhez, valamint annak költséghatékonyságát. A betegektől további 10 ml vért kérnek, amelyet rutinszerűen vett vérmintával együtt a QI-hez küldenek.
Ezen túlmenően, ha klinikailag műtétre van szükség, a reszekált szívbillentyű-szövet egy részét is elküldik CMg-elemzésre. A CMg eredményeit összehasonlítják a vérkultúrával. A nem IE indikációk miatt billentyűműtéten átesett betegek kontrollcsoportját is toborozzák.
Az NHS-en belüli klinikai CMg szolgáltatás jövőbeli üzembe helyezésének elősegítése érdekében költség-hatékonysági elemzést készítenek a CMg endocarditis diagnózisában és kezelésében való használatáról.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Becsült)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi helyek
-
-
-
London, Egyesült Királyság, EC1A 7BE
- St Bartholomew's Hospital. West Smithfield
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
- Felnőtt
- Idősebb felnőtt
Egészséges önkénteseket fogad
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
A mintát a BHC Endocarditis MDT megbeszélésén a betegségük kezelésére hivatkozott vizsgálatban részt vevő kórházakból származó betegek egymást követő csoportja alkotja. Évente hozzávetőleg 150 esetet utalnak be Endocarditis MDT-re, és a betegek 17%-ánál utasítjuk el az endocarditis diagnózisát a hazabocsátás időpontjára (az esetek a beutalás idejére nagyon válogatottak).
A tanulmányt úgy tervezték, hogy megvalósítható és alkalmazható legyen a betegek valós csoportjai számára. Így minden olyan beteget megvizsgálunk, aki beleegyezését adja, és a klinikai Endocarditis MDT meghatározása szerint lehetséges vagy határozott endocarditisben szenved. A gyakorlatban a kezelés befejeztével a lehetséges endocarditis csoportban még nagyon kicsi a szám (<5%), bár a beteg első beutaláskor körülbelül 20%-a tartozik ebbe a kategóriába. A betegség előrehaladtával a helyes diagnózis gyorsan nyilvánvalóvá válik – különösen a műtét után.
Leírás
Bevételi kritériumok:
- A lehetséges vagy megerősített IE-ben szenvedő betegek BHC Endocarditis MDT-re utaltak
- 18 év feletti életkor
- Képes és hajlandó tájékozott beleegyezést adni
Kizárási kritériumok:
- Azok a betegek, akiknél az endocarditis diagnózisát az MDT "elutasította". Ha ez a vizsgálatba való belépés után következik be, a mintákat el kell dobni, és tájékoztatni kell a beteget.
- Azok a betegek, akiket a vizsgálatba való belépés időpontjában több mint 7 napig intravénás antibiotikummal kezeltek.
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
A CMG diagnosztikai pontossága a vérben
Időkeret: 3 év
|
Ennek a tanulmánynak az elsődleges célja, hogy összehasonlítsa a vérminták metagenomikus vizsgálatából származó organizmusokat az IE-vel rendelkező szekvenciális betegek prospektív sorozatából származó vértenyésztésből származó organizmusokkal, és összehasonlítva a vértenyésztéssel, a műtéti állapotú szelepszövet-tenyésztéssel (ahol a műtétet vállalják) és egy klinikai referenciacsoport véleményét.
|
3 év
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
1. A vérvétel optimális időzítése
Időkeret: 3 év
|
A nanopórusos CMg vérmintavételének optimális időzítése IE-ben nem ismert.
Így megvizsgáljuk az első rendelkezésre álló, etilén-diamin-tetraecetsavban (EDTA) tárolt, laboratóriumban őrzött mintát, és összehasonlítjuk egy speciálisan a vizsgálathoz vett minta eredményeivel, valószínűleg néhány nappal később.
|
3 év
|
|
3. Metagenomikai technikák
Időkeret: 3 év
|
Összehasonlítunk két különböző metagenomikus technikát - a 16 másodperces vérvizsgálatot és a gazdaszervezet elnyomását a Nanopore platformon.
|
3 év
|
|
A Nanopore CMG eredményeinek értékelése a BCNIE -ben szenvedő betegek kórokozó szervezetének azonosításában
Időkeret: 3 év
|
Bármely azonosított szervezetet egy szakértői testület osztályoz a három kategória egyikébe:
|
3 év
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Elsődleges befejezés (Becsült)
A tanulmány befejezése (Becsült)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
Kulcsszavak
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- 280992
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .