Precisión del muestreo de sangre metagenómico para identificar patógenos en pacientes con endocarditis infecciosa (AMetIP)
La endocarditis infecciosa es una infección, generalmente una bacteria, que ataca el corazón y puede provocar fugas en las válvulas y producir una masa bacteriana que puede desprenderse de las válvulas y bloquear el suministro de sangre a órganos importantes.
Estamos muy interesados en mejorar el tratamiento de esta enfermedad y estamos midiendo el impacto de los tratamientos que damos a los pacientes para tener una idea muy clara de qué tratamientos funcionan mejor y también cuáles tienen menos éxito.
Una parte clave del tratamiento es la determinación precisa del organismo causante, lo que permite administrar antibióticos y medicamentos antimicóticos específicos.
Los regímenes antibióticos precisos requieren la detección del organismo causante y su sensibilidad a cada antibiótico. La elección de los antibióticos se basa entonces en la eficacia, la toxicidad, la facilidad de uso y las directrices nacionales. La mejor técnica actual para identificar bacterias es el hemocultivo, en el que los organismos se identifican cultivándolos a partir de muestras de sangre. Sin embargo, esto demora hasta 5 días desde el muestreo, lo que genera retrasos en el diagnóstico correcto. Hasta ese momento, el tratamiento requiere el uso de regímenes antibióticos genéricos y más tóxicos.
Están surgiendo nuevas técnicas para identificar los organismos causantes de la sangre. La metagenómica permite la secuenciación del ADN bacteriano permitiendo una identificación precisa del organismo infectante.
Descripción general del estudio
Estado
Condiciones
Descripción detallada
La endocarditis infecciosa (EI) ocurre cuando bacterias u hongos se depositan en las válvulas cardíacas y dañan los tejidos. La enfermedad puede ser catastrófica y provocar muerte, insuficiencia cardíaca, accidente cerebrovascular, insuficiencia renal y otras complicaciones. El daño valvular requiere cirugía cardíaca en aproximadamente el 50% de los casos de endocarditis; El tratamiento temprano con antibióticos reduce las complicaciones y mejora el pronóstico, reduciendo la necesidad de cirugía. Esto depende de una determinación rápida y precisa del organismo causante para administrar una terapia antimicrobiana eficaz y dirigida.
La mejor técnica actual para identificar bacterias es el hemocultivo: los organismos se identifican cultivándolos a partir de sangre. Sin embargo, esto suele tardar hasta 5 días.
Hasta en el 18% de los pacientes, el hemocultivo no logra identificar el organismo causante: la endocarditis infecciosa con hemocultivo negativo (BCNIE). Como resultado, los pacientes son tratados con antibióticos de más amplio espectro que tienen mayor toxicidad que los regímenes específicos, lo que genera mayores tasas de complicaciones. Por tanto, se necesitan tecnologías alternativas al hemocultivo estándar.
La metagenómica clínica (CMg) permite la secuenciación del ADN bacteriano a partir de muestras de sangre, lo que permite una identificación rápida y precisa del patógeno. Hasta ahora, esta tecnología era cara y limitada. La nueva tecnología está cambiando la cara del CMg y potencialmente permitirá identificar organismos rápidamente a bajo costo.
Barts Heart Center (BHC) es uno de los centros cardíacos más grandes del mundo y gestiona 150 casos de EI al año. Mientras que la mortalidad por EI sigue siendo alta (17,1% en el estudio EuroENDO publicado recientemente), la mortalidad hospitalaria en el Barts Heart Center es ~13%.
El Instituto Quadram (QI) es un instituto de investigación financiado por el Consejo de Investigación de Biotecnología y Ciencias Biológicas (BBSRC) que tiene experiencia especial en CMg, incluidos dos artículos de Nature.
Este estudio de 200 pacientes evaluará la precisión de la CMg en sangre e identificará el mejor momento para tomar la muestra junto con su rentabilidad. A los pacientes se les pedirán 10 ml adicionales de sangre que se enviarán a QI junto con una muestra de sangre de admisión tomada de forma rutinaria.
Además, si la cirugía es clínicamente necesaria, parte del tejido de la válvula cardíaca resecada también se enviará para análisis de CMg. Los resultados de CMg se compararán con el hemocultivo. También se reclutará un grupo de control de pacientes sometidos a cirugía valvular por indicaciones distintas de EI.
Para ayudar en la futura puesta en marcha de un servicio clínico de CMg dentro del NHS, se desarrollará un análisis de rentabilidad del uso de CMg en el diagnóstico y la vía de tratamiento de la endocarditis.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Ubicaciones de estudio
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London, Reino Unido, EC1A 7BE
- St Bartholomew's Hospital. West Smithfield
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
La muestra será un grupo consecutivo de pacientes de hospitales en el ensayo remitidos a la reunión BHC Endocarditis MDT para el manejo de su enfermedad. Aproximadamente 150 casos son remitidos al MDT de Endocarditis cada año y rechazamos el diagnóstico de endocarditis en el 17% de los pacientes en el momento del alta (los casos son muy seleccionados en el momento de su derivación).
El estudio está diseñado para ser practicable y aplicable a un grupo de pacientes del mundo real. Así, estudiaremos a todos los pacientes que den su consentimiento y tengan endocarditis posible o definitiva según la determinación del MDT clínico de Endocarditis. En la práctica, cuando se completa el tratamiento, el número que queda en el grupo de posible endocarditis es muy pequeño (<5%), aunque cuando el paciente es remitido por primera vez, aproximadamente el 20% está en esa categoría. A medida que la enfermedad avanza, rápidamente se hace evidente el diagnóstico correcto, especialmente después de la cirugía.
Descripción
Criterios de inclusión:
- Pacientes con EI posible o confirmada remitidos a BHC Endocarditis MDT
- Edad >18
- Capaz y dispuesto a dar consentimiento informado.
Criterio de exclusión:
- Pacientes cuyo diagnóstico de endocarditis es "rechazado" por el MDT. Si esto ocurre después del ingreso al estudio, las muestras se descartarán y se informará al paciente.
- Pacientes que hayan sido tratados con antibióticos intravenosos durante más de 7 días al momento del ingreso al estudio.
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Precisión diagnóstica de CMG en sangre
Periodo de tiempo: 3 años
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El objetivo principal de este estudio es comparar los organismos encontrados a partir de pruebas metagenómicas de muestras de sangre con organismos encontrados en hemocultivos de una serie prospectiva de pacientes secuenciales con IE y comparado con el cultivo de tejido de la válvula de hemocultivo, en comparación con el hemocultivo (donde se realiza la cirugía) y la opinión de un grupo de referencia clínica de un grupo clínico
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3 años
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Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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1. Momento óptimo para la toma de muestras de sangre.
Periodo de tiempo: 3 años
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Se desconoce el momento óptimo para tomar muestras de sangre para CMg de nanoporos en IE.
Por lo tanto, examinaremos la primera muestra almacenada de ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) disponible retenida en los laboratorios y la compararemos con los resultados de una muestra tomada especialmente para el estudio, probablemente unos días después.
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3 años
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3. Técnicas metagenómicas
Periodo de tiempo: 3 años
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Compararemos dos técnicas metagenómicas diferentes: análisis de sangre 16s y supresión del huésped en la plataforma Nanopore.
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3 años
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Evaluar los resultados de CMG de nanoporos en la identificación del organismo causal en pacientes con BCNIE
Periodo de tiempo: 3 años
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Cualquier organismo identificado será calificado por un panel de expertos en una de las tres categorías:
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3 años
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- 280992
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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