Dokładność metagenomicznego pobierania krwi w celu identyfikacji patogenu u pacjentów z infekcyjnym zapaleniem wsierdzia (AMetIP)
Infekcyjne zapalenie wsierdzia to infekcja, zazwyczaj bakteryjna, która atakuje serce i może spowodować nieszczelność zastawek oraz wytworzenie masy bakteryjnej, która może oddzielić się od zastawek i zablokować dopływ krwi do ważnych narządów.
Bardzo zależy nam na udoskonaleniu leczenia tej choroby i mierzymy wpływ terapii, które oferujemy pacjentom, abyśmy mieli jasny obraz tego, które metody leczenia są najskuteczniejsze, a które są mniej skuteczne.
Kluczową częścią leczenia jest dokładne określenie patogenu, co pozwala na podanie odpowiedniego, celowanego leku antybiotykowego i przeciwgrzybiczego.
Dokładne schematy antybiotykoterapii wymagają wykrycia drobnoustroju chorobotwórczego i jego wrażliwości na każdy antybiotyk. Wybór antybiotyku opiera się wówczas na skuteczności, toksyczności, łatwości stosowania i wytycznych krajowych. Obecnie najlepszą techniką identyfikacji bakterii jest posiew krwi, podczas którego organizmy identyfikuje się poprzez hodowanie ich z próbek krwi. Jednakże od pobrania próbki może upłynąć do 5 dni, co powoduje opóźnienia w postawieniu prawidłowej diagnozy. Do tego czasu leczenie wymaga stosowania generycznych, bardziej toksycznych schematów antybiotykowych.
Pojawiają się nowe techniki identyfikacji organizmów sprawczych z krwi. Metagenomika umożliwia sekwencjonowanie DNA bakterii, co pozwala na precyzyjną identyfikację organizmu zakażającego.
Przegląd badań
Status
Warunki
Szczegółowy opis
Infekcyjne zapalenie wsierdzia (IE) występuje, gdy bakterie lub grzyby osadzają się na zastawkach serca i uszkadzają tkanki. Choroba może być katastrofalna i skutkować śmiercią, niewydolnością serca, udarem, niewydolnością nerek i innymi powikłaniami. Uszkodzenie zastawek wymaga operacji kardiochirurgicznej w około 50% przypadków zapalenia wsierdzia; wczesne leczenie antybiotykami zmniejsza ryzyko powikłań i poprawia rokowanie, zmniejszając potrzebę operacji. Zależy to od szybkiego i dokładnego określenia drobnoustroju chorobotwórczego w celu zastosowania skutecznej i ukierunkowanej terapii przeciwdrobnoustrojowej.
Obecnie najlepszą techniką identyfikacji bakterii jest posiew krwi – organizmy identyfikuje się poprzez hodowanie ich z krwi. Zwykle trwa to jednak do 5 dni.
U aż 18% pacjentów posiew krwi nie pozwala na identyfikację drobnoustroju chorobotwórczego – negatywnego infekcyjnego zapalenia wsierdzia (BCNIE). W rezultacie pacjenci są leczeni antybiotykami o szerszym spektrum działania, które mają większą toksyczność niż schematy celowane, co skutkuje większym odsetkiem powikłań. Dlatego potrzebne są technologie alternatywne do standardowych posiewów krwi.
Metagenomika kliniczna (CMg) umożliwia sekwencjonowanie bakteryjnego DNA z próbek krwi, co pozwala na precyzyjną i szybką identyfikację patogenu. Dotychczas technologia ta była droga i ograniczona. Nowa technologia zmienia oblicze CMg i potencjalnie umożliwi szybką identyfikację organizmów przy niskich kosztach.
Barts Heart Center (BHC) to jeden z największych ośrodków kardiologicznych na świecie, w którym rocznie leczy się 150 przypadków IZW. Podczas gdy śmiertelność z powodu IZW pozostaje wysoka – 17,1% w niedawno opublikowanym badaniu EuroENDO – śmiertelność szpitalna w Barts Heart Center wynosi ~13%.
Instytut Quadram (QI) to instytut badawczy finansowany przez Radę ds. Badań nad Biotechnologią i Naukami Biologicznymi (BBSRC), posiadający specjalistyczną wiedzę specjalistyczną w zakresie CMg, obejmującą dwa artykuły w czasopiśmie Nature.
Badanie to z udziałem 200 pacjentów oceni dokładność pomiaru CMg krwi i określi najlepszy czas na pobranie próbki wraz z opłacalnością. Pacjenci zostaną poproszeni o dodatkowe 10 ml krwi, które zostaną przesłane do QI wraz z rutynowo pobieraną próbką krwi przy przyjęciu.
Ponadto, jeśli operacja jest klinicznie konieczna, część usuniętej tkanki zastawki serca zostanie również wysłana do analizy CMg. Wyniki badania CMg zostaną porównane z posiewem krwi. Zrekrutowana zostanie również grupa kontrolna pacjentów poddawanych operacji zastawki ze wskazań innych niż IZW.
Aby ułatwić przyszłe uruchomienie usług klinicznych CMg w ramach NHS, opracowana zostanie analiza opłacalności stosowania CMg w diagnostyce zapalenia wsierdzia i ścieżce leczenia.
Typ studiów
Zapisy (Szacowany)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
London, Zjednoczone Królestwo, EC1A 7BE
- St Bartholomew's Hospital. West Smithfield
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
- Dorosły
- Starszy dorosły
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Próbą będzie kolejna grupa pacjentów ze szpitali objętych badaniem, skierowana na spotkanie BHC Endocarditis MDT w celu leczenia ich choroby. Każdego roku do Centrum Zapalenia Wsierdzia kierowanych jest około 150 przypadków, a rozpoznanie zapalenia wsierdzia odrzucamy u 17% pacjentów do czasu wypisu (przypadki są wysoce selekcjonowane do czasu skierowania).
Badanie zaprojektowano tak, aby było wykonalne i miało zastosowanie w rzeczywistej grupie pacjentów. W związku z tym zbadamy wszystkich pacjentów, którzy wyrażą zgodę i mają możliwe lub określone zapalenie wsierdzia, zgodnie z określeniem klinicznej MDT zapalenia wsierdzia. W praktyce do czasu zakończenia leczenia liczba osób w grupie pacjentów z możliwym zapaleniem wsierdzia jest bardzo mała (<5%), chociaż w momencie pierwszego skierowania pacjenta do tej kategorii należy około 20%. W miarę postępu choroby szybko można postawić prawidłową diagnozę – zwłaszcza po operacji.
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci z możliwym lub potwierdzonym IZW kierowani byli do BHC Endocarditis MDT
- Wiek > 18 lat
- Zdolny i chętny do wyrażenia świadomej zgody
Kryteria wyłączenia:
- Pacjenci, u których rozpoznanie zapalenia wsierdzia zostało „odrzucone” przez MDT. Jeżeli nastąpi to po wejściu do badania, próbki zostaną odrzucone, a pacjent zostanie o tym poinformowany.
- Pacjenci, którzy w chwili włączenia do badania byli leczeni dożylnymi antybiotykami przez ponad 7 dni.
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Dokładność diagnostyczna CMG we krwi
Ramy czasowe: 3 lata
|
Głównym celem tego badania jest porównanie organizmów znalezionych na podstawie badań metagenomicznych próbek krwi z organizmami stwierdzonymi z hodowli krwi z prospektywnej serii sekwencyjnych pacjentów z IE i w porównaniu z hodowlą krwi, hodowlą tkanki zastawkowej (gdzie podejmowana jest operacja) i opinia klinicznej grupy referencyjnej
|
3 lata
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
1. Optymalny czas pobierania krwi
Ramy czasowe: 3 lata
|
Optymalny moment pobierania krwi w celu wykrycia nanoporów CMg w IZW jest nieznany.
W związku z tym zbadamy pierwszą dostępną przechowywaną w laboratoriach próbkę kwasu etylenodiaminotetraoctowego (EDTA) i porównamy ją z wynikami próbki pobranej specjalnie na potrzeby badania, prawdopodobnie kilka dni później.
|
3 lata
|
|
3. Techniki metagenomiczne
Ramy czasowe: 3 lata
|
Porównamy dwie różne techniki metagenomiczne – badanie krwi 16s i supresję żywiciela na platformie Nanopore.
|
3 lata
|
|
Aby ocenić wyniki nanoporu CMG w identyfikacji organizmu sprawczego u pacjentów z BCNIE
Ramy czasowe: 3 lata
|
Każdy zidentyfikowany organizm zostanie oceniony przez panelu ekspertów w jedną z trzech kategorii:
|
3 lata
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe (Szacowany)
Ukończenie studiów (Szacowany)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Rzeczywisty)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 280992
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .