- ICH GCP
- 미국 임상 시험 레지스트리
- 임상시험 NCT06475547
심장외과에서의 염증과 수술후 심방세동
연구 개요
상세 설명
심장 수술 후 수술 후 심방 세동(POAF) 수술 후 심방 세동은 심장 수술 후 흔히 나타나는 합병증으로, 불규칙하고 빠른 심박수가 특징입니다. 이는 질병률 증가, 입원 기간 연장, 의료 비용 증가와 관련이 있습니다. POAF의 병태생리학은 심방 구조 및 전기적 리모델링, 염증 및 자율신경 조절 장애를 포함하여 복잡하고 다인자적입니다.
염증 및 심외막 지방 염증은 POAF 발달에 중요한 역할을 합니다. 수술적 외상 및 심폐 우회술은 전신 염증 반응을 유발하여 사이토카인 및 기타 염증 매개체를 방출합니다. 심장 주위의 내장 지방 저장소인 심외막 지방은 염증성 사이토카인과 아디포카인을 분비하는 활성 내분비 기관입니다. 심외막 지방 두께의 증가는 더 높은 수준의 염증과 연관되어 있으며 심방세동의 발병과 관련되어 있습니다.
RNA 분리 및 시퀀싱 RNA 시퀀싱(RNA-seq)은 여러 가지 효과적인 방식으로 심외막 지방의 유전자 발현을 조사하는 데 사용될 수 있습니다. RNA-seq은 유전자 발현을 프로파일링하여 심외막 지방의 활성 유전자와 그 발현 수준을 식별하고 염증과 대사에 관여하는 주요 유전자를 밝힐 수 있습니다. POAF가 있는 환자와 없는 환자 등 그룹 간 유전자 발현을 비교함으로써 RNA-seq은 심방세동과 관련된 차별적으로 발현된 유전자를 식별할 수 있습니다.
RNA-seq 분석 STAR(Spliced Transcripts Alignment to a Reference) 정렬 장치를 사용하여 RNA 서열 분석 데이터 파일을 hg38 참조 게놈에 정렬하고 유전자의 판독 횟수를 정량화했습니다. 정규화되지 않은 개수가 포함된 결과 데이터 매트릭스는 환자 메타데이터 정보(예: 연령, 성별, BMI, 흡연)와 함께 RStudio에 로드되었습니다. 조직 유형, 환자 연령, 성별 및 BMI를 포함한 다양한 변수에 대한 조정을 사용하여 DESeq2를 사용하여 차등 발현 분석을 수행했습니다.
가설 우리는 POAF가 수술적 외상으로 인한 염증 외에도 심외막 지방의 기존 염증에 의해 영향을 받을 수 있다는 가설을 세웠습니다.
목적:
POAF가 발생한 환자와 선택적 심장 수술 후 그렇지 않은 환자 간의 심외막 지방의 염증성 유전자 발현을 비교합니다.
연구 설계:
처음으로 선택적 심장 수술을 받은 환자를 포함한 전향적 코호트 연구.
참가자들:
포함 기준: 처음으로 선택적 심장 수술을 받은 환자. 제외 기준: 이전에 심장 수술 또는 응급 수술을 받은 환자.
여러 떼:
POAF 그룹: POAF가 발생한 환자. Non-POAF 그룹: POAF가 발생하지 않은 환자.
샘플 수집:
심외막 지방 샘플은 수술 중에 수집됩니다.
RNA 분리 및 서열 분석:
세라믹 비드(Fastprep 24, MPBio)를 사용하여 TRIzol의 지방 조직을 균질화합니다. EconoSpin 컬럼(Epoch)을 사용하여 RNA를 정제합니다. Illumina용 NEBNext Ultra II RNA 라이브러리 준비 키트를 사용하여 RNA 라이브러리를 준비하세요. NovaSeq 6000 플랫폼(Illumina)에서 페어드 엔드 시퀀싱을 수행합니다.
데이터 분석:
STAR 정렬기를 사용하여 RNA-seq 데이터를 hg38 게놈에 정렬합니다. DESeq2를 사용하여 유전자 수를 정량화하고 차등 발현 분석을 수행합니다. 조직 유형, 연령, 성별, BMI 등의 변수를 조정합니다.
결과 측정:
수술 시 POAF 그룹과 Non-POAF 그룹 간의 염증성 유전자 발현 프로파일을 비교합니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Lytfi Krasniqi, MD
- 전화번호: 65412404
- 이메일: Lytfi.Krasniqi@rsyd.dk
연구 장소
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Odense, 덴마크, 5000
- 모병
- Odense University Hospital, Cardiac Surgery Department
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연락하다:
- Lytfi Krasniqi, MD
- 전화번호: 004524638899
- 이메일: Lytfi.Krasniqi@rsyd.dk
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 연령 > 18
- 동의
제외 기준:
- 무능한 개인
- 포함 당시 전반적인 건강 상태가 좋지 않음
- 재수술
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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POAF
수술 후 심방세동이 발생한 환자.
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본 연구는 관찰 연구이며 어떠한 임상적 개입도 포함하지 않습니다.
기본 절차에는 심외막 지방 조직 샘플을 수집하는 것이 포함됩니다.
그런 다음 수집된 샘플을 처리하고 분석하여 두 그룹 간의 염증성 유전자 발현을 비교합니다.
분석에는 심방세동 및 염증과 관련하여 차등적으로 발현되는 유전자를 식별하기 위한 RNA 서열 분석이 포함됩니다.
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비 POAF
수술 후 심방세동이 발생하지 않은 환자.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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유전자의 차등 발현
기간: 샘플은 수술 시 채취됩니다.
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이 연구의 주요 목표는 RNA 서열 분석(RNA-seq) 데이터를 사용하여 차별적으로 발현된(DE) 유전자를 식별하는 것입니다. 사후 시퀀싱에서는 DESeq2에서 제공하는 기본 설정과 통계 방법을 활용하여 실험 조건 간 유전자 발현의 통계적으로 유의미한 차이를 결정합니다. 유전자 신호는 킬로베이스당 표준화된 카운트 또는 백만 개의 매핑된 읽기당 전사체의 킬로베이스당 단편으로 측정됩니다. |
샘플은 수술 시 채취됩니다.
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Lytfi Krasniqi, MD, Odense University Hospital
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Wong CX, Ganesan AN, Selvanayagam JB. Epicardial fat and atrial fibrillation: current evidence, potential mechanisms, clinical implications, and future directions. Eur Heart J. 2017 May 1;38(17):1294-1302. doi: 10.1093/eurheartj/ehw045.
- Dobin A, Davis CA, Schlesinger F, Drenkow J, Zaleski C, Jha S, Batut P, Chaisson M, Gingeras TR. STAR: ultrafast universal RNA-seq aligner. Bioinformatics. 2013 Jan 1;29(1):15-21. doi: 10.1093/bioinformatics/bts635. Epub 2012 Oct 25.
- Love MI, Huber W, Anders S. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2. Genome Biol. 2014;15(12):550. doi: 10.1186/s13059-014-0550-8.
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (추정된)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
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미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
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