Gyulladás és posztoperatív pitvarfibrilláció a szívsebészetben

Posztoperatív pitvarfibrilláció (POAF) szívműtét után A posztoperatív pitvarfibrilláció a szívműtéteket követő gyakori szövődmény, amelyet szabálytalan és gyakran gyors szívverés jellemez. Ez a megnövekedett megbetegedéssel, a hosszabb kórházi tartózkodással és a magasabb egészségügyi költségekkel jár. A POAF patofiziológiája összetett és többtényezős, beleértve a pitvari szerkezeti és elektromos átalakulást, gyulladást és autonóm diszregulációt.

Gyulladás és epikardiális zsír A POAF kialakulásában jelentős szerepet játszik a gyulladás. A sebészeti trauma és a cardiopulmonalis bypass szisztémás gyulladásos választ vált ki, citokineket és más gyulladásos mediátorokat szabadítva fel. Az epikardiális zsír, a szív körüli zsigeri zsírraktár, egy aktív endokrin szerv, amely gyulladást elősegítő citokineket és adipokineket választ ki. A megnövekedett epikardiális zsírvastagság magasabb szintű gyulladással jár, és szerepet játszik a pitvarfibrilláció patogenezisében.

RNS-izolálás és szekvenálás Az RNS-szekvenálás (RNA-seq) számos hatásos módon használható az epikardiális zsír génexpressziójának vizsgálatára. Az RNS-seq képes profilozni a génexpressziót, hogy azonosítsa az epikardiális zsírban lévő aktív géneket és azok expressziós szintjét, feltárva a gyulladásban és az anyagcserében részt vevő kulcsgéneket. A csoportok génexpressziójának összehasonlításával, például POAF-ban szenvedő és nem szenvedő betegek között, az RNS-seq képes azonosítani a pitvarfibrillációhoz kapcsolódó, differenciálisan expresszált géneket.

RNS-seq elemzések Az RNS-szekvenálási adatfájlokat a hg38 referenciagenomhoz igazítottuk a Spliced ​​Transcripts Alignment to a Reference (STAR) illesztőprogram segítségével, és számszerűsítettük a gének leolvasási számát. Az eredményül kapott, nem normalizált számokat tartalmazó adatmátrixot a páciens metaadataival (például életkor, nem, BMI, dohányzás) együtt töltöttük be az RStudióba. Differenciális expressziós elemzéseket végeztünk a DESeq2-vel, a különböző változók, köztük a szövet típusának, a betegek életkorának, a nemének és a BMI-nek a kiigazításával.

Hipotézis Feltételezzük, hogy a POAF-ot a műtéti trauma okozta gyulladáson túlmenően az epicardialis zsírban már meglévő gyulladás is befolyásolhatja.

Célkitűzés:

Összehasonlítani a gyulladásos génexpressziót az epicardialis zsírban azon betegek között, akiknél POAF alakul ki, és akiknél nem az elektív szívműtét után.

Dizájnt tanulni:

Egy prospektív kohorsz vizsgálat, amelybe az első alkalommal elektív szívműtéten átesett betegek is beletartoznak.

Résztvevők:

Bevételi kritériumok: Első alkalommal elektív szívműtéten átesett betegek. Kizárási kritériumok: Korábban szívműtéten vagy sürgősségi műtéten átesett betegek.

Csoportok:

POAF csoport: betegek, akiknél POAF alakul ki. Nem POAF csoport: Olyan betegek, akiknél nem alakul ki POAF.

Minta kollekció:

A műtét ideje alatt epikardiális zsírmintákat vesznek.

RNS izolálás és szekvenálás:

Homogenizálja a zsírszövetet TRIzolban kerámia gyöngyökkel (Fastprep 24, MPBio). Tisztítsa meg az RNS-t EconoSpin oszlopokkal (Epoch). Készítsen RNS-könyvtárakat a NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit for Illumina segítségével. Végezzen páros végű szekvenálást a NovaSeq 6000 platformon (Illumina).

Adatelemzés:

Igazítsa az RNS-seq adatokat a hg38 genomhoz a STAR igazító segítségével. Számszerűsítse a génszámot, és végezzen differenciális expressziós elemzést a DESeq2 segítségével. Korrigálja az olyan változókat, mint a szövettípus, életkor, nem és BMI.

Eredményintézkedések:

Hasonlítsa össze a gyulladásos génexpressziós profilokat a POAF és a nem POAF csoportok között a műtét idején.