Inflammation og postoperativ atrieflimren i hjertekirurgi

Postoperativ atrieflimren (POAF) efter hjertekirurgi Postoperativ atrieflimren er en almindelig komplikation efter hjertekirurgi, karakteriseret ved uregelmæssig og ofte hurtig hjertefrekvens. Det er forbundet med øget sygelighed, forlængede hospitalsophold og højere sundhedsomkostninger. Patofysiologien af ​​POAF er kompleks og multifaktoriel, der involverer atriel strukturel og elektrisk ombygning, inflammation og autonom dysregulering.

Inflammation og epikardiefedtbetændelse spiller en væsentlig rolle i udviklingen af ​​POAF. Kirurgisk traume og kardiopulmonal bypass udløser et systemisk inflammatorisk respons, der frigiver cytokiner og andre inflammatoriske mediatorer. Epikardiefedt, det viscerale fedtdepot omkring hjertet, er et aktivt endokrine organ, der udskiller pro-inflammatoriske cytokiner og adipokiner. Øget epikardiefedttykkelse er forbundet med højere niveauer af inflammation og har været impliceret i patogenesen af ​​atrieflimren.

RNA-isolering og -sekventering RNA-sekventering (RNA-seq) kan bruges til at undersøge genekspression i epikardiefedt på flere virkningsfulde måder. RNA-seq kan profilere genekspression for at identificere aktive gener i epikardiefedt og deres ekspressionsniveauer, hvilket afslører nøglegener involveret i inflammation og metabolisme. Ved at sammenligne genekspression mellem grupper, såsom patienter med og uden POAF, kan RNA-seq identificere differentielt udtrykte gener forbundet med atrieflimren.

RNA-seq-analyser RNA-sekventeringsdatafilerne blev justeret til hg38-referencegenomet under anvendelse af Spliced ​​Transcripts Alignment to a Reference (STAR) aligner, og aflæste tællinger i gener blev kvantificeret. Den resulterende datamatrix med unormaliserede tællinger blev indlæst i RStudio sammen med patientens metadataoplysninger (f.eks. alder, køn, BMI, rygning). Differentielle ekspressionsanalyser blev udført med DESeq2 under anvendelse af justering for forskellige variabler, herunder vævstype, patienters alder, køn og BMI.

Hypotese Vi antager, at POAF kan være påvirket af allerede eksisterende betændelse i epikardiefedt, foruden inflammation forårsaget af kirurgisk traume.

Objektiv:

At sammenligne inflammatorisk genekspression i epikardiefedt mellem patienter, der udvikler POAF, og dem, der ikke gør det efter elektiv hjertekirurgi.

Studere design:

Et prospektivt kohortestudie med patienter, der gennemgår førstegangs elektiv hjertekirurgi.

Deltagere:

Inklusionskriterier: Patienter, der gennemgår førstegangs elektiv hjertekirurgi. Eksklusionskriterier: Patienter med tidligere hjerteoperationer eller akutte operationer.

Grupper:

POAF-gruppe: Patienter, der udvikler POAF. Ikke-POAF-gruppe: Patienter, der ikke udvikler POAF.

Prøvesamling:

Epikardielle fedtprøver vil blive indsamlet i løbet af operationen.

RNA-isolering og sekventering:

Homogeniser fedtvæv i TRIzol ved hjælp af keramiske perler (Fastprep 24, MPBio). Rens RNA ved hjælp af EconoSpin-søjler (Epoch). Forbered RNA-biblioteker med NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit til Illumina. Udfør parret ende-sekventering på NovaSeq 6000-platformen (Illumina).

Dataanalyse:

Juster RNA-seq-data til hg38-genomet ved hjælp af STAR-aligner. Kvantificer gentællinger og udfør differentiel ekspressionsanalyse ved hjælp af DESeq2. Juster for variabler såsom vævstype, alder, køn og BMI.

Resultatmål:

Sammenlign inflammatoriske genekspressionsprofiler mellem POAF- og ikke-POAF-grupper på operationstidspunktet.