Воспаление и послеоперационная фибрилляция предсердий в кардиохирургии

Послеоперационная фибрилляция предсердий (ПОФП) после операции на сердце Послеоперационная фибрилляция предсердий является частым осложнением после операции на сердце и характеризуется нерегулярной и часто учащенной частотой сердечных сокращений. Это связано с ростом заболеваемости, длительным пребыванием в больнице и более высокими расходами на здравоохранение. Патофизиология ПОФП сложна и многофакторна и включает структурное и электрическое ремоделирование предсердий, воспаление и вегетативную дисрегуляцию.

Воспаление и эпикардиальное жировое воспаление играют значительную роль в развитии ПОФП. Хирургическая травма и искусственное кровообращение вызывают системную воспалительную реакцию, высвобождающую цитокины и другие медиаторы воспаления. Эпикардиальный жир, депо висцерального жира вокруг сердца, является активным эндокринным органом, секретирующим провоспалительные цитокины и адипокины. Увеличение толщины эпикардиального жира связано с более высоким уровнем воспаления и участвует в патогенезе фибрилляции предсердий.

Выделение и секвенирование РНК Секвенирование РНК (RNA-seq) можно использовать для исследования экспрессии генов в эпикардиальной жировой ткани несколькими эффективными способами. RNA-seq может профилировать экспрессию генов для идентификации активных генов в эпикардиальной жировой ткани и уровней их экспрессии, выявляя ключевые гены, участвующие в воспалении и метаболизме. Сравнивая экспрессию генов между группами, такими как пациенты с ПОФП и без нее, RNA-seq может идентифицировать дифференциально экспрессируемые гены, связанные с фибрилляцией предсердий.

Анализы РНК-секвенирования Файлы данных секвенирования РНК были сопоставлены с эталонным геномом hg38 с использованием выравнивателя сплайсированных транскриптов по эталону (STAR), и было количественно оценено количество считываний в генах. Полученная матрица данных с ненормализованными значениями была загружена в RStudio вместе с метаданными пациента (например, возраст, пол, ИМТ, курение). Анализ дифференциальной экспрессии проводился с помощью DESeq2 с поправкой на различные переменные, включая тип ткани, возраст пациентов, пол и ИМТ.

Гипотеза Мы предполагаем, что на ПОФП может влиять ранее существовавшее воспаление эпикардиальной жировой ткани, а также воспаление, вызванное хирургической травмой.

Цель:

Сравнить экспрессию воспалительных генов в эпикардиальной жировой клетчатке у пациентов, у которых развилась ПОФП, и у пациентов, у которых этого не произошло после плановой операции на сердце.

Дизайн исследования:

Проспективное когортное исследование, включающее пациентов, впервые перенесших плановую операцию на сердце.

Участники:

Критерии включения: пациенты, впервые перенесшие плановую операцию на сердце. Критерии исключения: пациенты, перенесшие ранее операции на сердце или экстренные операции.

Группы:

Группа ПОФП: пациенты, у которых развивается ПОФП. Группа без ПОФП: пациенты, у которых не развивается ПОФП.

Сбор образцов:

Образцы эпикардиального жира будут собраны во время операции.

Выделение и секвенирование РНК:

Гомогенизируйте жировую ткань в TRIzol с помощью керамических шариков (Fastprep 24, MPBio). Очистите РНК с помощью колонок EconoSpin (Epoch). Подготовьте библиотеки РНК с помощью набора для подготовки библиотеки РНК NEBNext Ultra II для Illumina. Выполните парное секвенирование на платформе NovaSeq 6000 (Illumina).

Анализ данных:

Совместите данные RNA-seq с геномом hg38 с помощью выравнивателя STAR. Оцените количество генов и выполните анализ дифференциальной экспрессии с помощью DESeq2. Скорректируйте такие переменные, как тип ткани, возраст, пол и ИМТ.

Критерии оценки:

Сравните профили экспрессии воспалительных генов между группами ПОФП и без ПОФП во время операции.