Betennelse og postoperativ atrieflimmer i hjertekirurgi

Postoperativ atrieflimmer (POAF) etter hjertekirurgi Postoperativ atrieflimmer er en vanlig komplikasjon etter hjertekirurgi, preget av uregelmessig og ofte rask hjertefrekvens. Det er assosiert med økt sykelighet, lengre sykehusopphold og høyere helsekostnader. Patofysiologien til POAF er kompleks og multifaktoriell, og involverer atriell strukturell og elektrisk ombygging, betennelse og autonom dysregulering.

Betennelse og epikardisk fettbetennelse spiller en betydelig rolle i utviklingen av POAF. Kirurgisk traume og kardiopulmonal bypass utløser en systemisk inflammatorisk respons, og frigjør cytokiner og andre inflammatoriske mediatorer. Epikardielt fett, det viscerale fettdepotet rundt hjertet, er et aktivt endokrine organ som skiller ut pro-inflammatoriske cytokiner og adipokiner. Økt epikardiell fetttykkelse er assosiert med høyere nivåer av betennelse og har vært implisert i patogenesen av atrieflimmer.

RNA-isolering og sekvensering RNA-sekvensering (RNA-seq) kan brukes til å undersøke genuttrykk i epikardielt fett på flere virkningsfulle måter. RNA-seq kan profilere genuttrykk for å identifisere aktive gener i epikardielt fett og deres ekspresjonsnivåer, og avsløre nøkkelgener involvert i betennelse og metabolisme. Ved å sammenligne genuttrykk mellom grupper, som pasienter med og uten POAF, kan RNA-seq identifisere differensielt uttrykte gener assosiert med atrieflimmer.

RNA-seq-analyser RNA-sekvenseringsdatafilene ble justert til hg38-referansegenomet ved å bruke Spliced ​​Transcripts Alignment to a Reference (STAR) aligner, og avlest antall i gener ble kvantifisert. Den resulterende datamatrisen med unormaliserte tellinger ble lastet inn i RStudio sammen med pasientmetadatainformasjon (f.eks. alder, kjønn, BMI, røyking). Differensielle ekspresjonsanalyser ble utført med DESeq2 ved å bruke justering for forskjellige variabler, inkludert type vev, alder på pasienter, kjønn og BMI.

Hypotese Vi antar at POAF kan være påvirket av eksisterende betennelse i epikardielt fett, i tillegg til betennelsen forårsaket av kirurgisk traume.

Objektiv:

Å sammenligne inflammatorisk genuttrykk i epikardielt fett mellom pasienter som utvikler POAF og de som ikke gjør det etter elektiv hjertekirurgi.

Studere design:

En prospektiv kohortstudie inkludert pasienter som gjennomgår førstegangs elektiv hjertekirurgi.

Deltakere:

Inklusjonskriterier: Pasienter som gjennomgår førstegangs elektiv hjertekirurgi. Eksklusjonskriterier: Pasienter med tidligere hjerteoperasjoner eller akuttoperasjoner.

Grupper:

POAF-gruppe: Pasienter som utvikler POAF. Ikke-POAF-gruppe: Pasienter som ikke utvikler POAF.

Prøvesamling:

Epikardielle fettprøver vil bli samlet inn under operasjonen.

RNA-isolering og sekvensering:

Homogeniser fettvev i TRIzol ved hjelp av keramiske perler (Fastprep 24, MPBio). Rens RNA ved hjelp av EconoSpin-kolonner (Epoch). Forbered RNA-biblioteker med NEBNext Ultra II RNA Library Prep Kit for Illumina. Utfør parede sekvenser på NovaSeq 6000-plattformen (Illumina).

Dataanalyse:

Juster RNA-seq-data til hg38-genomet ved å bruke STAR-aligner. Kvantifiser gentellinger og utfør differensiell ekspresjonsanalyse ved hjelp av DESeq2. Juster for variabler som vevstype, alder, kjønn og BMI.

Utfallsmål:

Sammenlign profiler for inflammatoriske genuttrykk mellom POAF- og ikke-POAF-grupper på operasjonstidspunktet.