Inflammation et fibrillation auriculaire postopératoire en chirurgie cardiaque

Fibrillation auriculaire postopératoire (POAF) après une chirurgie cardiaque La fibrillation auriculaire postopératoire est une complication courante après une chirurgie cardiaque, caractérisée par une fréquence cardiaque irrégulière et souvent rapide. Elle est associée à une morbidité accrue, à des séjours hospitaliers prolongés et à des coûts de santé plus élevés. La physiopathologie du POAF est complexe et multifactorielle, impliquant un remodelage structurel et électrique auriculaire, une inflammation et une dérégulation autonome.

Inflammation et inflammation des graisses épicardiques L'inflammation joue un rôle important dans le développement du POAF. Le traumatisme chirurgical et le pontage cardio-pulmonaire déclenchent une réponse inflammatoire systémique, libérant des cytokines et d'autres médiateurs inflammatoires. La graisse épicardique, le dépôt de graisse viscérale autour du cœur, est un organe endocrinien actif sécrétant des cytokines et des adipokines pro-inflammatoires. L’augmentation de l’épaisseur de la graisse épicardique est associée à des niveaux plus élevés d’inflammation et a été impliquée dans la pathogenèse de la fibrillation auriculaire.

Isolement et séquençage de l'ARN Le séquençage de l'ARN (RNA-seq) peut être utilisé pour étudier l'expression des gènes dans la graisse épicardique de plusieurs manières efficaces. L'ARN-seq peut profiler l'expression des gènes pour identifier les gènes actifs dans la graisse épicardique et leurs niveaux d'expression, révélant ainsi les gènes clés impliqués dans l'inflammation et le métabolisme. En comparant l'expression des gènes entre les groupes, tels que les patients avec et sans POAF, RNA-seq peut identifier les gènes différentiellement exprimés associés à la fibrillation auriculaire.

Analyses de séquençage d'ARN Les fichiers de données de séquençage d'ARN ont été alignés sur le génome de référence hg38 à l'aide de l'aligneur Spliced ​​Transcripts Alignment to a Reference (STAR) et le nombre de lectures dans les gènes a été quantifié. La matrice de données résultante avec des décomptes non normalisés a été chargée dans RStudio avec les informations de métadonnées du patient (par exemple, âge, sexe, IMC, tabagisme). Des analyses d'expression différentielle ont été réalisées avec DESeq2 en utilisant un ajustement pour différentes variables, notamment le type de tissu, l'âge des patients, le sexe et l'IMC.

Hypothèse Nous émettons l'hypothèse que le POAF pourrait être influencé par une inflammation préexistante de la graisse épicardique, en plus de l'inflammation causée par un traumatisme chirurgical.

Objectif:

Comparer l'expression des gènes inflammatoires dans la graisse épicardique entre les patients qui développent une POAF et ceux qui ne le font pas après une chirurgie cardiaque élective.

Étudier le design:

Une étude de cohorte prospective incluant des patients subissant une première chirurgie cardiaque élective.

Participants :

Critères d'intégration : Patients subissant une première chirurgie cardiaque élective. Critère d'exclusion : Patients ayant déjà subi des chirurgies cardiaques ou des chirurgies d'urgence.

Groupes:

Groupe POAF : Patients qui développent un POAF. Groupe non-POAF : Patients qui ne développent pas de POAF.

Collecte d'échantillons:

Des échantillons de graisse épicardique seront prélevés pendant la chirurgie.

Isolement et séquençage de l'ARN :

Homogénéiser le tissu adipeux dans TRIzol à l’aide de billes de céramique (Fastprep 24, MPBio). Purifiez l’ARN à l’aide des colonnes EconoSpin (Epoch). Préparez des bibliothèques d’ARN avec le kit de préparation de bibliothèques d’ARN NEBNext Ultra II pour Illumina. Effectuez un séquençage apparié sur la plateforme NovaSeq 6000 (Illumina).

L'analyse des données:

Alignez les données RNA-seq sur le génome hg38 à l’aide de l’aligneur STAR. Quantifiez le nombre de gènes et effectuez une analyse d’expression différentielle à l’aide de DESeq2. Ajustez les variables telles que le type de tissu, l’âge, le sexe et l’IMC.

Mesures des résultats :

Comparez les profils d'expression des gènes inflammatoires entre les groupes POAF et non-POAF au moment de la chirurgie.