Zapalenie i pooperacyjne migotanie przedsionków w kardiochirurgii

Pooperacyjne migotanie przedsionków (POAF) po operacji kardiochirurgicznej Pooperacyjne migotanie przedsionków jest częstym powikłaniem po operacji kardiochirurgicznej, charakteryzującym się nieregularną i często szybką pracą serca. Wiąże się to ze zwiększoną zachorowalnością, dłuższymi pobytami w szpitalu i wyższymi kosztami opieki zdrowotnej. Patofizjologia POAF jest złożona i wieloczynnikowa i obejmuje przebudowę strukturalną i elektryczną przedsionków, zapalenie i rozregulowanie układu autonomicznego.

Zapalenie i zapalenie tkanki tłuszczowej nasierdzia odgrywają znaczącą rolę w rozwoju POAF. Uraz chirurgiczny i bajpas krążeniowo-oddechowy wywołują ogólnoustrojową reakcję zapalną, uwalniając cytokiny i inne mediatory stanu zapalnego. Tłuszcz nasierdziowy, trzewny magazyn tłuszczu wokół serca, jest aktywnym narządem wydzielania wewnętrznego wydzielającym prozapalne cytokiny i adipokiny. Zwiększona grubość tłuszczu nasierdziowego wiąże się z wyższym poziomem stanu zapalnego i jest powiązana z patogenezą migotania przedsionków.

Izolacja i sekwencjonowanie RNA Sekwencjonowanie RNA (seq RNA) można wykorzystać do badania ekspresji genów w tłuszczu nasierdziowym na kilka skutecznych sposobów. Seq RNA może profilować ekspresję genów, aby zidentyfikować aktywne geny w tłuszczu nasierdziowym i poziomy ich ekspresji, ujawniając kluczowe geny zaangażowane w stan zapalny i metabolizm. Porównując ekspresję genów między grupami, takimi jak pacjenci z POAF i bez, sekwencja RNA może zidentyfikować geny o różnej ekspresji związane z migotaniem przedsionków.

Analizy seq RNA Pliki danych sekwencjonowania RNA dopasowano do genomu referencyjnego hg38 przy użyciu narzędzia dopasowującego Spliced ​​Transcripts Alignment to a Reference (STAR) i określono ilościowo odczytane liczby w genach. Otrzymaną macierz danych z nieznormalizowanymi liczbami załadowano do RStudio wraz z informacjami o metadanych pacjenta (np. wiekiem, płcią, BMI, paleniem). Analizy ekspresji różnicowej przeprowadzono za pomocą DESeq2, stosując dostosowanie do różnych zmiennych, w tym rodzaju tkanki, wieku pacjentów, płci i BMI.

Hipoteza Stawiamy hipotezę, że na POAF może wpływać istniejące wcześniej zapalenie tkanki tłuszczowej nasierdzia, oprócz zapalenia spowodowanego urazem chirurgicznym.

Cel:

Porównanie ekspresji genów zapalnych w tkance tłuszczowej nasierdzia u pacjentów, u których rozwinęła się POAF i u pacjentów, u których nie doszło do planowej operacji kardiochirurgicznej.

Projekt badania:

Prospektywne badanie kohortowe obejmujące pacjentów poddawanych po raz pierwszy planowej operacji kardiochirurgicznej.

Uczestnicy:

Kryteria włączenia: Pacjenci poddawani po raz pierwszy planowej operacji kardiochirurgicznej. Kryteria wykluczenia: Pacjenci, którzy przeszli operacje kardiochirurgiczne lub operacje w trybie nagłym.

Grupy:

Grupa POAF: Pacjenci, u których rozwinął się POAF. Grupa nie-POAF: Pacjenci, u których nie rozwinął się POAF.

Kolekcja próbek:

W czasie operacji pobierane będą próbki tłuszczu z nasierdzia.

Izolacja i sekwencjonowanie RNA:

Homogenizować tkankę tłuszczową w TRIzolu przy użyciu kulek ceramicznych (Fastprep 24, MPBio). Oczyścić RNA przy użyciu kolumn EconoSpin (Epoch). Przygotuj biblioteki RNA za pomocą zestawu do przygotowania biblioteki RNA NEBNext Ultra II dla Illumina. Wykonaj sekwencjonowanie sparowanych końców na platformie NovaSeq 6000 (Illumina).

Analiza danych:

Dopasuj dane dotyczące sekwencji RNA do genomu hg38 za pomocą narzędzia STAR. Określ ilościowo liczbę genów i przeprowadź różnicową analizę ekspresji przy użyciu DESeq2. Dostosuj zmienne, takie jak rodzaj tkanki, wiek, płeć i BMI.

Mierniki rezultatu:

Porównaj profile ekspresji genów zapalnych w grupach POAF i bez POAF w czasie operacji.