백혈구 단일 세포 형 유전자 발현/전사 풍부의 직접 분석에 의한 감염에 대한 숙주 반응, 직접 LS-TA
열성 환자의 심사를위한 인터페론 자극 및 기타 바이오 마커 유전자의 말초 혈액 단일 세포 유형 발현 프로파일
열병은 특히 젊은 환자들 사이에서 일반적인 상태이며 다양한 병인에 따라 적절한 치료를 가능하게하기 위해 환자의 초기 심사를 갖는 것이 중요합니다. 대부분의 진단 테스트는 병원체의 검출을 목표로하며 다른 분석은 대부분 혈청 단백질과 관련이 있습니다. 혈액 세포 전 사체는 박테리아 및 바이러스 감염을 분화시키기 위해 탐구되었다.
여기, 우리는 박테리아, 바이러스 및 결핵 인 세 가지 주요 범주의 감염을 구별하기 위해 말초 백혈구 (단핵구 및 육아 세포)의 단일 세포 집단의 유전자 발현 측면에서 숙주 반응을 사용하여 빠른 시험을 개발할 것을 제안한다.
분석은 지정된 단일 세포 유형의 유전자 발현 (예를 들어, 말초 혈액 샘플에서 직접 다양한 백혈구 세포 집단 중 단핵구 및 과립구). 이러한 결과는 숙주 반응의 특성을 나타내며 감염 유형 (바이러스, 박테리아 또는 활성 결핵)을 나타내는 데 사용될 수 있습니다.
연구 개요
상세 설명
Direct LS-TA는 혈액 유전자 발현 분석을위한 비율 기반 바이오 마커 (RBB)이며, 이는 일반적으로 이용 가능한 장비에서 수행 될 수 있습니다 (예 : QPCR 또는 디지털 PCR 기계). 이전의 정의 된 분자 유전자 및 분모 유전자의 TA의 비를 사용하여,이 RBB는 지정된 구성 단일 세포 유형의 유전자 발현을 정량화 할 수있다 (예를 들어 전혈의 세포 혼합 샘플 내부의 단핵구 및 과립구).
Direct LS-TA는 PI [Tang 2017, https://patents.google.com/patent/us9589099b2/]에 의해 개척 된 방법입니다. 예방 접종 후 초기 B 세포 반응의 정량화를 위해 개발되었다 [doi : 10.3390/genes12070971].
최근에,이 방법은 감염 후 숙주 반응 바이오 마커를 개발하여 병원체의 유형 (예 : 바이러스, 박테리아 또는 활성 결핵)을 구별하는 데 사용된다. 분자 및 분모 유전자는 단핵구 및 과립구에 대한 공개 유전자 발현 데이터 세트를 사용하여 확인되었다. 이러한 공개 데이터를 사용하여 진단 성능이 좋았습니다.
따라서, 이들 RBB는 열성 환자의 진단 (심사) 성능을 다른 병원체 병인으로 평가하고 비교하기 위해 이러한 후 향적 샘플에 적용될 것이다.
연구 유형
등록 (실제)
연락처 및 위치
연구 장소
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Hong Kong, 홍콩
- Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준 :
- 박테리아 감염 샘플 : 혈액 배양에서 유기체의 양성 분리 (박테리아 감염 샘플 그룹)
- 임상 진단 활성 TB (결핵 감염 그룹)
제외 기준 :
- 종료 단계 신부전
- 임신
- 장기 항생제 치료가 강력하게 권장되는 감염
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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예방 접종 대조군
이 연구의 기준으로 수집 된 최대 200 개의 성인 샘플은 정량적 PCR 또는 디지털 PCR에 의해 비율 기반 바이오 마커의 기준 범위를 확립하는 데 사용될 것입니다.
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이 후 향적 연구에 대한 개입이 없습니다
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박테리아 감염 샘플
양성 박테리아 혈액 배양이있는 성인 환자의 후 향적 샘플.
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이 후 향적 연구에 대한 개입이 없습니다
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결핵 샘플
활성 결핵 질환이있는 것으로 진단 된 성인 환자의 후 향적 샘플.
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이 후 향적 연구에 대한 개입이 없습니다
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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단핵구에서 바이러스 호스트 반응 직접 LS-TA (유형 I 인터페론 반응)
기간: 1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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직접 LS-TA는 한 쌍의 유전자의 QPCR 또는 DPCR에 의해 쉽게 정량화 될 수있는 일종의 RBB입니다. 바이오 마커는 2 개의 유전자의 비율입니다. 단일 세포 유형 : 단핵구. RBB 수 분자 유전자 : IFI27 또는 IFI44L. RBB 분모 유전자 : PSAP, CTSS 또는 CPVL. 다양한 RBB (예 : IFI27/PSAP 및 IFI44L/PSAP 비율)는 예방 접종 대조군 샘플 및 감염 그룹의 샘플에서 진단 성능의 민감도/특이성 측면에서 비교됩니다. ROC 분석의 AUC는 적절한 경우 수행됩니다. |
1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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육아 세포에서 바이러스 호스트 반응 직접 LS-TA (유형 I 인터페론 반응)
기간: 1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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직접 LS-TA는 한 쌍의 유전자의 QPCR 또는 DPCR에 의해 쉽게 정량화 될 수있는 일종의 RBB입니다. 바이오 마커는 2 개의 유전자의 비율입니다. 단일 세포 유형 : 육아 세포. RBB 분자 유전자 : RSAD2 또는 IFIT1. RBB 분모 유전자 : SAT1 또는 SRGN. 다양한 RBB는 예방 접종 대조군 샘플 및 감염 그룹의 샘플에서 진단 성능의 민감도/특이성 측면에서 비교됩니다. ROC 분석의 AUC는 적절한 경우 수행됩니다. |
1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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박테리아 감염 호스트 반응 단핵구에서 직접 LS-TA (전 염증 반응)
기간: 1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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직접 LS-TA는 한 쌍의 유전자의 QPCR 또는 DPCR에 의해 쉽게 정량화 될 수있는 일종의 RBB입니다. 바이오 마커는 2 개의 유전자의 비율입니다. 단일 세포 유형 : 단핵구. RBB 분수 유전자 : VNN1 또는 NLRC4. RBB 분모 유전자 : PSAP, CTSS 또는 CPVL. 다양한 RBB는 예방 접종 대조군 샘플 및 감염 그룹의 샘플에서 진단 성능의 민감도/특이성 측면에서 비교됩니다. ROC 분석의 AUC는 적절한 경우 수행됩니다. |
1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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박테리아 감염 숙주 반응 과립 세포에서 LS-TA 직접 LS-TA (전 염증 반응)
기간: 1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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직접 LS-TA는 한 쌍의 유전자의 QPCR 또는 DPCR에 의해 쉽게 정량화 될 수있는 일종의 RBB입니다. 바이오 마커는 2 개의 유전자의 비율입니다. 단일 세포 유형 : 육아 세포. RBB 분자 유전자 : Alpl, Arg1 또는 Anoba3. RBB 분모 유전자 : SAT1 또는 SRGN. 다양한 RBB는 예방 접종 대조군 샘플 및 감염 그룹의 샘플에서 진단 성능의 민감도/특이성 측면에서 비교됩니다. ROC 분석의 AUC는 적절한 경우 수행됩니다. |
1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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단핵구에서 활성 TB 호스트 반응 직접 LS-TA (유형 II 인터페론 반응)
기간: 1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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직접 LS-TA는 한 쌍의 유전자의 QPCR 또는 DPCR에 의해 쉽게 정량화 될 수있는 일종의 RBB입니다. 바이오 마커는 2 개의 유전자의 비율입니다. 단일 세포 유형 : 단핵구. RBB 분수 유전자 : WARS1, ATF3 또는 CALHM6. RBB 분모 유전자 : PSAP, CTSS 또는 CPVL. 다양한 RBB는 예방 접종 대조군 샘플 및 감염 그룹의 샘플에서 진단 성능의 민감도/특이성 측면에서 비교됩니다. ROC 분석의 AUC는 적절한 경우 수행됩니다. |
1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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육아 세포에서 활성 TB 호스트 반응 직접 LS-TA (유형 II 인터페론 반응)
기간: 1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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직접 LS-TA는 한 쌍의 유전자의 QPCR 또는 DPCR에 의해 쉽게 정량화 될 수있는 일종의 RBB입니다. 바이오 마커는 2 개의 유전자의 비율입니다. 단일 세포 유형 : 육아 세포. RBB 수 분자 유전자 : ANKRD22, BATF2, CD274, FCGR1A 또는 ETV7. RBB 분모 유전자 : SAT1 또는 SRGN. 다양한 RBB는 예방 접종 대조군 샘플 및 감염 그룹의 샘플에서 진단 성능의 민감도/특이성 측면에서 비교됩니다. ROC 분석의 AUC는 적절한 경우 수행됩니다. |
1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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제어 그룹에서 이러한 직접 LS-TA RBB의 참조 간격 및 중앙값
기간: 1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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각 RBB의 중앙값 및 중앙 95% 범위가 결정됩니다.
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1 일 (입원 후 처음 수집 된 샘플)
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공동 작업자 및 조사자
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
- Huang D, Liu AYN, Leung KS, Tang NLS. Direct Measurement of B Lymphocyte Gene Expression Biomarkers in Peripheral Blood Transcriptomics Enables Early Prediction of Vaccine Seroconversion. Genes (Basel). 2021 Jun 25;12(7):971. doi: 10.3390/genes12070971.
- Huang B, Huang J, Chiang NH, Chen Z, Lui G, Ling L, Kwan MYW, Wong JSC, Mak PQ, Ling JWH, Lam ICS, Ng RWY, Wang X, Gao R, Hui DS, Ma SL, Chan PKS, Tang NLS. Interferon response and profiling of interferon response genes in peripheral blood of vaccine-naive COVID-19 patients. Front Immunol. 2024 Jan 10;14:1315602. doi: 10.3389/fimmu.2023.1315602. eCollection 2023.
- Direct single cell-type gene expression analysis in Whole blood: Novel ratio-based gene expression biomarkers using 2 novel monocyte reference genes (PSAP and CTSS) for monitoring bacterial infection Nelson LS Tang, Tsz-Ki Kwan, Dan Huang, Suk Ling Ma, K.S. Leung bioRxiv 2025.01.27.634977; doi: https://doi.org/10.1101/2025.01.27.634977
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연구 주요 날짜
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기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
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마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- Direct LS-TA retrospective
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
개별 참가자 데이터(IPD)를 공유할 계획입니까?
IPD 계획 설명
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
미국에서 제조되어 미국에서 수출되는 제품
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