Wirtsreaktion auf eine Infektion durch direkte Analyse der Genexpression/Transkription von Leukozyten-Einzelzell-Typen, direkter LS-TA
Peripheres Blut-Typ-Expressionsprofil vom einzelnen Zelltyp von Interferon-stimulierten und anderen Biomarker-Genen für die Triage fieberhafter Patienten
Fiebererkrankung ist eine häufige Erkrankung, insbesondere bei jungen Patienten, und es ist entscheidend, eine frühzeitige Dauer von Patienten nach verschiedenen Aetiologien zu haben, um eine angemessene Behandlung zu ermöglichen. Die meisten diagnostischen Tests richten sich an die Erkennung von Krankheitserregern, während andere Assays hauptsächlich mit Serumproteinen zusammenhängen. Das Blutzellen -Transkriptom wurde untersucht, um bakterielle und virale Infektionen zu differenzieren.
Hier schlagen wir vor, einen schnellen Test unter Verwendung der Wirtsantworten in Bezug auf Genausdrücke von Einzelzellpopulationen peripherer Leukozyten (Monozyten und Granulozyten) zu entwickeln, um drei Hauptkategorien von Infektionen zu unterscheiden, die bakteriell, viral und tuberkulen sind.
Der Assay wird als Direktleukozyten-Transkriptionstyp (Direktls-TA) als Transkript-Häufigkeit (Direktls-TA) bezeichnet, da er die Genexpression eines bestimmten Einzelzelltyps (z. Monozyten und Granulozyten) zwischen verschiedenen Leukozytenzellpopulationen direkt in einer peripheren Blutprobe. Solche Ergebnisse bedeuten die Art der Wirtsreaktion und können verwendet werden, um die Art der Infektion (virale, bakterielle oder aktive Tuberkulose) anzuzeigen.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Direct LS-TA ist ein ratenbasierter Biomarker (RBB) für die Blutgenexpressionsanalyse, die in häufig verfügbaren Ausrüstungen durchgeführt werden kann (z. qPCR oder digitale PCR -Maschinen). Unter Verwendung des Verhältnisses von TA des früheren definierten Zählergens und des Nennergens kann diese RBB die Genexpression des spezifizierten konstitutionellen Einzelzelltyps quantifizieren (z. Monozyten und Granulozyten) in einer Zellmischungsprobe von Vollblut.
Direct LS-TA war eine Methode, die vom PI [Tang 2017, https://patents.google.com/patent/US9589099b2/] geführt wurde. Und es wurde zur Quantifizierung der frühen B -Zell -Reaktion nach der Impfung entwickelt [DOI: 10.3390/Gene12070971].
Kürzlich wird die Methode verwendet, um Biomarker für Wirtsreaktion nach der Infektion zu entwickeln, um die Art der Krankheitserreger (wie virale, bakterielle oder aktive Tuberkulose) zu unterscheiden. Zähler- und Nennergene wurden anhand der Verwendung öffentlicher Genexpressionsdatensätze für Monozyten und Granulozyten identifiziert. Die diagnostische Leistung war mit diesen öffentlichen Daten gut.
Daher werden diese RBBs in diesen retrospektiven Proben angewendet, um ihre diagnostische (Triage) Leistung fieberhafter Patienten in verschiedenen Pathogen -Ätiologien zu bewerten und zu vergleichen.
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Kontakte und Standorte
Studienorte
-
-
-
Hong Kong, Hongkong
- Dept of Chemical Pathology, Chinese University of Hong Kong
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Probe der Bakterieninfektion: positive Isolierung des Organismus in der Blutkultur (Bakterieninfektionsprobengruppe)
- Klinische diagnostizierte aktive TB (Tuberculosis Infektionsgruppe)
Ausschlusskriterien:
- Nierenversagen im Endstadium
- Schwangerschaft
- Infektionen, für die eine langfristige Antibiotika -Behandlung stark empfohlen wird (einschließlich infektiöser Endokarditis, osteoartikulären Infektionen, zerebraler oder lebatischer oder Lungenabszesse, Tuberkulose oder nontuberkulöser Mykobakterieninfektionen)
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
Intervention / Behandlung |
|---|---|
|
Impfkontrollen
Bis zu 200 als Grundlinien dieser Studie gesammelten erwachsenen Proben werden verwendet, um die Referenzbereiche der resotenbasierten Biomarker durch quantitative PCR oder digitale PCR festzulegen.
|
Keine Intervention für diese retrospektive Studie
|
|
Bakterieninfektionsproben
Eine retrospektive Stichprobe erwachsener Patienten mit positiver bakterieller Blutkultur.
|
Keine Intervention für diese retrospektive Studie
|
|
Tuberkulose -Proben
Eine retrospektive Stichprobe erwachsener Patienten, bei denen eine aktive Tuberkulose -Erkrankung diagnostiziert wurde.
|
Keine Intervention für diese retrospektive Studie
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Virale Wirt-Antwort direkte LS-TA in Monozyten (Typ I Interferon-Antwort)
Zeitfenster: 1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Direct LS-TA ist eine Art RBB, die durch qPCR oder DPCR eines Genepaars, des RBB-Zählergens und des RBB-Nennergens leicht quantifiziert werden kann. Der Biomarker ist das Verhältnis der 2 Gene. Einzelzelltyp: Monozyte. RBB -Zähler Gen: IFI27 oder IFI44L. RBB -Nenner -Gen: PSAP, CTSS oder CPVL. Die verschiedenen RBB (z. IFI27/PSAP und IFI44L/PSAP -Verhältnisse) werden in Bezug auf ihre Empfindlichkeit/Spezifität der diagnostischen Leistung in den Impfkontrollproben und -proben aus Infektionsgruppen verglichen. Die AUC der ROC -Analyse wird gegebenenfalls durchgeführt. |
1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
|
Virale Wirt-Reaktion direkter LS-TA in Granulozyten (Interferon-Antwort vom Typ I)
Zeitfenster: 1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Direct LS-TA ist eine Art RBB, die durch qPCR oder DPCR eines Genepaars, des RBB-Zählergens und des RBB-Nennergens leicht quantifiziert werden kann. Der Biomarker ist das Verhältnis der 2 Gene. Einzelzelltyp: Granulozyte. RBB -Zähler Gen: Rsad2 oder ifit1. RBB -Nenner -Gen: SAT1 oder SRGN. Die verschiedenen RBB werden in Bezug auf ihre Empfindlichkeit/Spezifität der diagnostischen Leistung in den Impfkontrollproben und -proben aus Infektionsgruppen verglichen. Die AUC der ROC -Analyse wird gegebenenfalls durchgeführt. |
1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
|
Bakterieninfektion Wirt Reaktion direkter LS-TA in Monozyten (proinflammatorische Reaktion)
Zeitfenster: 1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Direct LS-TA ist eine Art RBB, die durch qPCR oder DPCR eines Genepaars, des RBB-Zählergens und des RBB-Nennergens leicht quantifiziert werden kann. Der Biomarker ist das Verhältnis der 2 Gene. Einzelzelltyp: Monozyte. RBB -Zähler Gen: VNN1 oder NLRC4. RBB -Nenner -Gen: PSAP, CTSS oder CPVL. Die verschiedenen RBBs werden in Bezug auf ihre Empfindlichkeit/Spezifität der diagnostischen Leistung in den Impfkontrollproben und -proben aus Infektionsgruppen verglichen. Die AUC der ROC -Analyse wird gegebenenfalls durchgeführt. |
1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
|
Reaktion der bakteriellen Infektion Wirt Direkte LS-TA in Granulozyten (entzündungshemmende Reaktion)
Zeitfenster: 1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Direct LS-TA ist eine Art RBB, die durch qPCR oder DPCR eines Genepaars, des RBB-Zählergens und des RBB-Nennergens leicht quantifiziert werden kann. Der Biomarker ist das Verhältnis der 2 Gene. Einzelzelltyp: Granulozyte. RBB -Zähler Gen: ALPL, Arg1 oder Anxa3. RBB -Nenner -Gen: SAT1 oder SRGN. Die verschiedenen RBB werden in Bezug auf ihre Empfindlichkeit/Spezifität der diagnostischen Leistung in den Impfkontrollproben und -proben aus Infektionsgruppen verglichen. Die AUC der ROC -Analyse wird gegebenenfalls durchgeführt. |
1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
|
Aktive TB-Host-Antwort direkte LS-TA in Monozyten (Typ II Interferon-Antwort)
Zeitfenster: 1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Direct LS-TA ist eine Art RBB, die durch qPCR oder DPCR eines Genepaars, des RBB-Zählergens und des RBB-Nennergens leicht quantifiziert werden kann. Der Biomarker ist das Verhältnis der 2 Gene. Einzelzelltyp: Monozyte. RBB -Zähler Gen: Wars1, ATF3 oder CALHM6. RBB -Nenner -Gen: PSAP, CTSS oder CPVL. Die verschiedenen RBB werden in Bezug auf ihre Empfindlichkeit/Spezifität der diagnostischen Leistung in den Impfkontrollproben und -proben aus Infektionsgruppen verglichen. Die AUC der ROC -Analyse wird gegebenenfalls durchgeführt. |
1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
|
Aktive TB-Host-Antwort direkte LS-TA in Granulozyten (Typ II Interferon-Antwort)
Zeitfenster: 1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Direct LS-TA ist eine Art RBB, die durch qPCR oder DPCR eines Genepaars, des RBB-Zählergens und des RBB-Nennergens leicht quantifiziert werden kann. Der Biomarker ist das Verhältnis der 2 Gene. Einzelzelltyp: Granulozyte. RBB -Zähler Gen: ANKRD22, BATF2, CD274, FCGR1A oder ETV7. RBB -Nenner -Gen: SAT1 oder SRGN. Die verschiedenen RBB werden in Bezug auf ihre Empfindlichkeit/Spezifität der diagnostischen Leistung in den Impfkontrollproben und -proben aus Infektionsgruppen verglichen. Die AUC der ROC -Analyse wird gegebenenfalls durchgeführt. |
1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Referenzintervalle und Median dieser direkten LS-TA RBB in der Kontrollgruppe
Zeitfenster: 1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Der mittlere Wert und der zentrale 95% -Bereich jedes RBB werden bestimmt.
|
1 Tag (erste gesammelte Probe nach der Aufnahme)
|
Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Huang D, Liu AYN, Leung KS, Tang NLS. Direct Measurement of B Lymphocyte Gene Expression Biomarkers in Peripheral Blood Transcriptomics Enables Early Prediction of Vaccine Seroconversion. Genes (Basel). 2021 Jun 25;12(7):971. doi: 10.3390/genes12070971.
- Huang B, Huang J, Chiang NH, Chen Z, Lui G, Ling L, Kwan MYW, Wong JSC, Mak PQ, Ling JWH, Lam ICS, Ng RWY, Wang X, Gao R, Hui DS, Ma SL, Chan PKS, Tang NLS. Interferon response and profiling of interferon response genes in peripheral blood of vaccine-naive COVID-19 patients. Front Immunol. 2024 Jan 10;14:1315602. doi: 10.3389/fimmu.2023.1315602. eCollection 2023.
- Direct single cell-type gene expression analysis in Whole blood: Novel ratio-based gene expression biomarkers using 2 novel monocyte reference genes (PSAP and CTSS) for monitoring bacterial infection Nelson LS Tang, Tsz-Ki Kwan, Dan Huang, Suk Ling Ma, K.S. Leung bioRxiv 2025.01.27.634977; doi: https://doi.org/10.1101/2025.01.27.634977
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- Direct LS-TA retrospective
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
Beschreibung des IPD-Plans
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird
Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .