Walidacja prognostyki opartej na genomice w ciężkich urazach

Cel szczegółowy: Prospektywna walidacja szybkiego testu genomowego uzyskanego z subpopulacji leukocytów krwi pacjentów z ciężkim urazem w ciągu pierwszych 24 godzin po przyjęciu, który można wykorzystać do rozróżnienia tych pacjentów, którzy będą mieli skomplikowaną trajektorię kliniczną i dlatego byliby dobrymi kandydatami do interwencyjnych terapii immunomodulujących.

Po ciężkim urazie tępym i podczas rekonwalescencji dochodzi do zmian w transkryptomie leukocytów. W związku z tym proponujemy, aby sygnał transkryptomu leukocytów oparty na ekspresji zwalidowanych 63 całkowitych genów leukocytów lub 181 genów PMN można wykorzystać do identyfikacji pacjentów, którzy są narażeni na skomplikowany wynik kliniczny, samodzielnie lub w połączeniu z predyktorami anatomicznymi lub fizjologicznymi. Celem tego badania klinicznego jest sprawdzenie zdolności predykcyjnej tego narzędzia prognostycznego opartego na transkryptomie.

Jest to nieinterwencyjne badanie obserwacyjne z udziałem 200 ciężko rannych pacjentów z tępym urazem i 40 zdrowych ochotników. Kryteria wejścia będą takie same, jakie były stosowane przez ostatnie osiem lat w ramach grantu na klej. Pacjenci z ciężkim tępym urazem, którzy spełniają kryteria włączenia, zostaną poddani szybkiemu badaniu genomu leukocytów przy przyjęciu i następnego ranka (~24 godziny). Dodatkowe próbki krwi zostaną pobrane po 4, 7, 14, 21 i 28 dniach lub tak długo, jak pacjenci przebywają na oddziale urazowym lub chirurgicznym na oddziale intensywnej terapii, do przechowywania.

W ciągu czterech lat włączymy 240 pacjentów z University of Florida i University of Washington w Harborview Medical Center. U pacjentów po urazach próbki krwi będą pobierane przy przyjęciu, w dniach 1, 4, 7, 14, 21 i 28 lub do wypisu z OIOM lub śmierci. W każdym punkcie czasowym zostanie pobranych łącznie od 4 do 5 ml krwi. U zdrowych ochotników zostanie pobrana jednorazowo próbka krwi.

Badanie przesiewowe i zgoda: Pacjenci z urazami zostaną zidentyfikowani przez personel badawczy po przybyciu na izbę przyjęć. Osoba badana lub najbliższy krewny prawny zostanie poproszony o zgodę w ciągu 96 godzin, jeśli pacjent spełni kryteria wstępne. Prosimy o opóźnioną zgodę w tej populacji pacjentów o 96 godzin ze względu na ciężkość urazów, wrażliwy charakter pacjenta w tak wczesnym czasie oraz wyzwanie związane z dotarciem do przedstawicieli prawnych pacjenta. Jeżeli świadoma zgoda nie zostanie uzyskana w ciągu 96 godzin, wszystkie próbki krwi i zebrane dane zostaną odrzucone.

Zdrowi ochotnicy będą identyfikowani z ogólnej populacji za pomocą ulotek reklamowych wywieszonych na odpowiednich uniwersytetach. Ulotki będą zawierały informacje kontaktowe do laboratoriów. Osoby zdrowe zostaną poddane badaniu przesiewowemu pod kątem kryteriów włączenia/wyłączenia po kontakcie. Jeśli jest to stosowne do udziału, podmiot zostanie skonsultowany w celu uzyskania zgody.

Krew zostanie pobrana z istniejącego dostępu lub w razie potrzeby przez nakłucie żyły. Krew zostanie niezwłocznie umieszczona na lodzie i przetransportowana do laboratorium, gdzie zostanie przetworzona na lizaty komórkowe i osocze.

Wszystkie inne istotne dane kliniczne i pomiary hemodynamiczne będą zbierane codziennie podczas hospitalizacji pacjenta.

• Informacje demograficzne.
• Aktualna i przeszła dokumentacja medyczna
• Laboratorium, mikrobiologia i wszystkie inne wyniki badań
• Rentgen, CT, MRI, USG i wszystkie inne wyniki badań obrazowych
• Zapisy dotyczące wszelkich leków otrzymanych podczas przyjęcia
• Zapisy badania fizykalnego podczas przyjęcia
• Zapisy wszystkich parametrów życiowych i monitorowania hemodynamicznego podczas przyjęcia
• Zapisy wszelkich procedur lub interwencji podczas przyjęcia
• Zapisy wszelkich procedur lub interwencji podczas przyjęcia do szpitala
• Stan w miejscu rozładunku i rozładunku

Każdy z dwóch ośrodków klinicznych zachowa odpowiedzialność za gromadzenie i przechowywanie danych klinicznych. Do gromadzenia danych klinicznych zostanie wykorzystany REDCap (Research Electronic Data Capture). Jest to bezpieczna aplikacja internetowa zaprojektowana do obsługi tradycyjnego przechwytywania danych z formularzy opisów przypadków. Lizaty komórkowe uzyskane w University of Washington-Harborview Medical Center zostaną wysłane do University of Florida w celu analizy genomicznej, podczas gdy próbki osocza pobrane w Shands Hospital na University of Florida zostaną wysłane do University of Washington w celu analizy cytokin przez Luminex™ . W odstępach rocznych będą miały miejsce elektroniczne transfery danych z University of Florida do University of Washington zarówno niemożliwych do zidentyfikowania, zakodowanych danych klinicznych, jak i danych dotyczących cytokin i genomu.

Pobrania krwi związane z badaniem będą wykonywane przy łóżku pacjenta w sposób zgodny ze standardem opieki klinicznej lub w naszych laboratoriach dla zdrowych ochotników. Probówki używane do pobierania krwi związanej z badaniem będą oznaczone niepowtarzalnym numerem badania i nie będą zawierały żadnego identyfikatora pacjenta. Klucz łączący unikalny numer pacjenta z osobistymi identyfikatorami pacjentów będzie przechowywany w chronionym hasłem i zaszyfrowanym pliku i będzie dostępny tylko dla PI i zespołu badawczego. Wszystkie zebrane dane kliniczne pacjentów będą przechowywane w szafce, która znajduje się w biurze PI lub zespołu badawczego. Komputer służący do przechowywania danych będzie znajdował się w biurze IP lub personelu badawczego, które jest zawsze zamknięte. Komputer będzie chroniony hasłem i zaszyfrowany.

Oparliśmy naszą ocenę liczby pacjentów na naszym wstępnym zbiorze danych od 1637 osób z ciężkim urazem. W tym badaniu, spośród 1637 pacjentów, 31% lub 507 pacjentów miało czas do wyzdrowienia krótszy niż pięć dni i można było zidentyfikować ich jako mających nieskomplikowany wynik. W przeciwieństwie do tego, 442 pacjentów lub 27% miało powikłane rokowanie, określone przez późną śmierć lub MOF trwające dłużej niż 14 dni. Zakładając podobną częstość powikłań i niepowikłanych pacjentów wśród 200 pacjentów, spodziewalibyśmy się, że 62 z tych pacjentów zostanie wypisanych w ciągu 5 dni bez uszkodzenia narządu, a 54 pacjentów będzie miało przedłużoną niewydolność narządową i / lub późną śmierć. Liczby te mieszczą się w zakresach wymaganych do statystycznej walidacji tych różnych modeli.

Przewidujemy, że nasz ogólny wskaźnik zgody na to badanie obserwacyjne przy minimalnym ryzyku wyniesie 75%, co oznacza, że ​​aby osiągnąć wskaźnik narastania 25 pacjentów urazowych rocznie w każdej instytucji, będziemy musieli mieć 34 pacjentów rocznie spełniających kryteria wstępne. Nie spodziewamy się żadnych trudności w gromadzeniu tych 200 osób w ciągu czterech lat w uczestniczących witrynach. Oba są ośrodkami urazowymi poziomu 1, które mają nadmiar zdolności do ukończenia proponowanych badań.

W tym protokole jedyną interwencją specyficzną dla badania będzie pobranie krwi. Ryzyko związane z pobieraniem krwi z żyły obejmuje dyskomfort w miejscu nakłucia; możliwe zasinienie i obrzęk wokół miejsca nakłucia; rzadko infekcja; i, niezbyt często, omdlenie po zabiegu. Naruszenie prywatności zostanie zanegowane przy użyciu kodowania dla wszystkich zebranych danych i okazów.

Uczestnictwo w zajęciach nie przynosi bezpośrednich korzyści studiowanym przedmiotom. Badania te mogą przynieść korzyści społeczeństwu w przyszłości. To badanie może pewnego dnia zaowocować nowymi testami lub metodami leczenia, albo może pomóc w zapobieganiu chorobom lub ich leczeniu. Nie istnieje żaden konflikt interesów w przypadku PI ani badacza pomocniczego.