Profilowanie molekularne w próbkach tkanek od pacjentów z rakiem, którzy wyjątkowo reagują na leczenie
Badanie pilotażowe osób reagujących wyjątkowo: profilowanie molekularne nowotworów u pacjentów z rakiem, którzy reagują wyjątkowo
Przegląd badań
Status
Status
Warunki
Warunki
Interwencja / Leczenie
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
CELE NAJWAŻNIEJSZE:
I. Identyfikacja wskaźników molekularnych w tkankach nowotworowych od pacjentów, którzy wykazali się wyjątkową odpowiedzią na badania kliniczne lub standardowe leczenie systemowe z wykorzystaniem całego egzomu i/lub ukierunkowanego głębokiego sekwencjonowania, a także potencjalnie innych metod sekwencjonowania i innych metod charakteryzacji molekularnej (jeśli istnieje odpowiednia tkanka).
II. Zbadanie powiązań między zidentyfikowanymi wskaźnikami molekularnymi a domniemanym mechanizmem działania leczenia otrzymanego przez pacjenta.
III. Aby przetestować wykonalność zidentyfikowania „wyjątkowo reagujących”, uzyskania odpowiedniego guza i prawidłowej tkanki oraz danych klinicznych oraz przeprowadzenia całego egzomu i/lub ukierunkowanego głębokiego sekwencjonowania na tych próbkach.
ZARYS:
Wcześniej pobrane próbki tkanek są analizowane za pomocą sekwencjonowania całego egzomu i/lub ukierunkowanego sekwencjonowania nowej generacji (NGS) w teście głębokiego sekwencjonowania. Przypadki, dla których dostępne są wystarczające ilości kwasu nukleinowego, zostaną poddane dodatkowym analizom, w tym sekwencjonowaniu całego genomu, sekwencjonowaniu informacyjnego kwasu rybonukleinowego (RNA) (mRNA), sekwencjonowaniu mikro (miRNA), analizie metylacji promotora i analizie polimorfizmu pojedynczego nukleotydu (SNP).
Typ studiów
Typ studiów
Zapisy (Rzeczywisty)
Zapisy
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
California
-
Duarte, California, Stany Zjednoczone, 91010
- City of Hope Comprehensive Cancer Center
-
Fresno, California, Stany Zjednoczone, 93720
- Kaiser Permanente-Fresno
-
Oakland, California, Stany Zjednoczone, 94611
- Kaiser Permanente-Oakland
-
Richmond, California, Stany Zjednoczone, 94801
- Kaiser Permanente-Richmond
-
San Francisco, California, Stany Zjednoczone, 94158
- UCSF Medical Center-Mission Bay
-
Santa Clara, California, Stany Zjednoczone, 95051
- Kaiser Permanente Medical Center - Santa Clara
-
Santa Rosa, California, Stany Zjednoczone, 95403
- Kaiser Permanente-Santa Rosa
-
Stockton, California, Stany Zjednoczone, 95210
- Kaiser Permanente-Stockton
-
Walnut Creek, California, Stany Zjednoczone, 94596
- Kaiser Permanente-Walnut Creek
-
-
Colorado
-
Aurora, Colorado, Stany Zjednoczone, 80045
- UCHealth University of Colorado Hospital
-
Fort Collins, Colorado, Stany Zjednoczone, 80524
- Poudre Valley Hospital
-
-
Connecticut
-
Greenwich, Connecticut, Stany Zjednoczone, 06830
- Greenwich Hospital
-
-
Delaware
-
Newark, Delaware, Stany Zjednoczone, 19713
- Helen F Graham Cancer Center
-
Newark, Delaware, Stany Zjednoczone, 19713
- Medical Oncology Hematology Consultants PA
-
-
District of Columbia
-
Washington D.C., District of Columbia, Stany Zjednoczone, 20016
- Sibley Memorial Hospital
-
-
Georgia
-
Atlanta, Georgia, Stany Zjednoczone, 30322
- Emory University Hospital/Winship Cancer Institute
-
Columbus, Georgia, Stany Zjednoczone, 31904
- John B Amos Cancer Center
-
Valdosta, Georgia, Stany Zjednoczone, 31602
- South Georgia Medical Center/Pearlman Cancer Center
-
-
Idaho
-
Boise, Idaho, Stany Zjednoczone, 83706
- Saint Alphonsus Cancer Care Center-Boise
-
-
Illinois
-
Chicago, Illinois, Stany Zjednoczone, 60631
- Presence Resurrection Medical Center
-
Chicago, Illinois, Stany Zjednoczone, 60612
- Rush MD Anderson Cancer Center
-
Decatur, Illinois, Stany Zjednoczone, 62526
- Decatur Memorial Hospital
-
Decatur, Illinois, Stany Zjednoczone, 62526
- Cancer Care Specialists of Illinois - Decatur
-
Evanston, Illinois, Stany Zjednoczone, 60201
- NorthShore University HealthSystem-Evanston Hospital
-
Peoria, Illinois, Stany Zjednoczone, 61615
- Illinois CancerCare-Peoria
-
Springfield, Illinois, Stany Zjednoczone, 62702
- Springfield Clinic
-
-
Iowa
-
Cedar Rapids, Iowa, Stany Zjednoczone, 52402
- Physicians' Clinic of Iowa PC
-
-
Maine
-
York Village, Maine, Stany Zjednoczone, 03909
- York Hospital
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Stany Zjednoczone, 20892
- NCI - Center for Cancer Research
-
Bethesda, Maryland, Stany Zjednoczone, 20892
- National Cancer Institute Developmental Therapeutics Clinic
-
-
Michigan
-
Ann Arbor, Michigan, Stany Zjednoczone, 48109
- University of Michigan Rogel Cancer Center
-
Ann Arbor, Michigan, Stany Zjednoczone, 48106
- Trinity Health Saint Joseph Mercy Hospital Ann Arbor
-
Brighton, Michigan, Stany Zjednoczone, 48114
- Trinity Health Medical Center - Brighton
-
Detroit, Michigan, Stany Zjednoczone, 48201
- Wayne State University/Karmanos Cancer Institute
-
Grand Rapids, Michigan, Stany Zjednoczone, 49503
- Corewell Health Grand Rapids Hospitals - Butterworth Hospital
-
Marquette, Michigan, Stany Zjednoczone, 49855
- UP Health System Marquette
-
Marquette, Michigan, Stany Zjednoczone, 49855
- UP Health System Hematology Oncology Marquette
-
Southfield, Michigan, Stany Zjednoczone, 48075
- Henry Ford Health Providence Southfield Hospital
-
-
Missouri
-
Cape Girardeau, Missouri, Stany Zjednoczone, 63703
- Saint Francis Medical Center
-
Springfield, Missouri, Stany Zjednoczone, 65807
- CoxHealth South Hospital
-
Springfield, Missouri, Stany Zjednoczone, 65804
- Mercy Hospital Springfield
-
St Louis, Missouri, Stany Zjednoczone, 63110
- Washington University School of Medicine
-
St Louis, Missouri, Stany Zjednoczone, 63131
- Missouri Baptist Medical Center
-
St Louis, Missouri, Stany Zjednoczone, 63141
- Mercy Hospital Saint Louis
-
-
Montana
-
Great Falls, Montana, Stany Zjednoczone, 59405
- Benefis Sletten Cancer Institute
-
-
New Hampshire
-
Portsmouth, New Hampshire, Stany Zjednoczone, 03802
- Portsmouth Regional Hospital
-
-
New Mexico
-
Albuquerque, New Mexico, Stany Zjednoczone, 87106
- University of New Mexico Cancer Center
-
-
New York
-
Rochester, New York, Stany Zjednoczone, 14642
- University of Rochester
-
-
North Carolina
-
Durham, North Carolina, Stany Zjednoczone, 27710
- Duke University Medical Center
-
Winston-Salem, North Carolina, Stany Zjednoczone, 27157
- Wake Forest University Health Sciences
-
-
North Dakota
-
Fargo, North Dakota, Stany Zjednoczone, 58122
- Sanford Roger Maris Cancer Center
-
-
Ohio
-
Columbus, Ohio, Stany Zjednoczone, 43214
- Riverside Methodist Hospital
-
-
Oklahoma
-
Lawton, Oklahoma, Stany Zjednoczone, 73505
- Cancer Centers of Southwest Oklahoma Research
-
Oklahoma City, Oklahoma, Stany Zjednoczone, 73104
- University of Oklahoma Health Sciences Center
-
-
Oregon
-
Portland, Oregon, Stany Zjednoczone, 97227
- Kaiser Permanente Northwest
-
-
Pennsylvania
-
Phoenixville, Pennsylvania, Stany Zjednoczone, 19460
- Reading Hospital McGlinn Cancer Institute at Phoenixville
-
West Chester, Pennsylvania, Stany Zjednoczone, 19380
- Chester County Hospital
-
West Reading, Pennsylvania, Stany Zjednoczone, 19611
- Reading Hospital
-
-
South Carolina
-
Greenville, South Carolina, Stany Zjednoczone, 29605
- Prisma Health Cancer Institute - Faris
-
Greenville, South Carolina, Stany Zjednoczone, 29605
- Prisma Health Cancer Institute - Butternut
-
Seneca, South Carolina, Stany Zjednoczone, 29672
- Prisma Health Cancer Institute - Seneca
-
-
South Dakota
-
Sioux Falls, South Dakota, Stany Zjednoczone, 57117-5134
- Sanford USD Medical Center - Sioux Falls
-
Sioux Falls, South Dakota, Stany Zjednoczone, 57104
- Sanford Cancer Center Oncology Clinic
-
-
Tennessee
-
Kingsport, Tennessee, Stany Zjednoczone, 37660
- Wellmont Holston Valley Hospital and Medical Center
-
-
Texas
-
Houston, Texas, Stany Zjednoczone, 77030
- Baylor College of Medicine/Dan L Duncan Comprehensive Cancer Center
-
Houston, Texas, Stany Zjednoczone, 77030
- Ben Taub General Hospital
-
San Antonio, Texas, Stany Zjednoczone, 78229
- University of Texas Health Science Center at San Antonio
-
-
Utah
-
Salt Lake City, Utah, Stany Zjednoczone, 84112
- Huntsman Cancer Institute/University of Utah
-
-
Virginia
-
Charlottesville, Virginia, Stany Zjednoczone, 22908
- University of Virginia Cancer Center
-
-
West Virginia
-
Martinsburg, West Virginia, Stany Zjednoczone, 25401
- WVUH-Berkely Medical Center
-
-
Wisconsin
-
Madison, Wisconsin, Stany Zjednoczone, 53792
- University of Wisconsin Carbone Cancer Center - University Hospital
-
Summit, Wisconsin, Stany Zjednoczone, 53066
- Aurora Medical Center in Summit
-
Waukesha, Wisconsin, Stany Zjednoczone, 53188
- UW Cancer Center at ProHealth Care
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Metoda próbkowania
Badana populacja
Opis
Kryteria przyjęcia:
Udokumentowana wyjątkowa odpowiedź, zdefiniowana jako pacjenci spełniający następujące kryteria:
- Całkowita odpowiedź na schemat, w którym spodziewana jest całkowita odpowiedź u < 10% podobnie leczonych pacjentów
- Częściowa odpowiedź (PR) > 6 miesięcy w schemacie, w którym oczekuje się PR > 6 miesięcy u < 10% pacjentów z podobną chorobą leczonych tym samym lub podobnym schematem
Pełna odpowiedź (CR) lub PR o nietypowym czasie trwania, tak że wewnętrzna komisja rewizyjna uznaje to za wyjątkową odpowiedź; przykłady poniżej:
- PR o czasie trwania > 3 x mediana oczekiwanego czasu trwania PR (w przypadkach, gdy spodziewany jest PR u > 10% pacjentów z tą samą chorobą leczonych tym samym schematem)
- CR lub czas trwania > 3 x mediana oczekiwanego czasu trwania CR (w przypadkach, gdy CR można zaobserwować u > 10% pacjentów z tą samą chorobą leczonych tym samym schematem)
- Obserwowany czas trwania CR (lub PR) jest dłuższy niż oczekiwano u 90% pacjentów z tą samą chorobą leczonych tym samym schematem
- Uwaga: nie jest wymagane włączenie pacjenta do badania klinicznego w przypadku zaobserwowania wyjątkowej odpowiedzi
- Sprawozdania ze skanów radiologicznych lub innych dowodów dokumentujących odpowiedź zostaną przedłożone do przeglądu; przypadki, w których nie można ocenić odpowiedzi (np. leczenie adjuwantowe) nie będą się kwalifikować, ponieważ wyniku nie można przypisać konkretnemu leczeniu
- Musi być dostępna historia leczenia, dotycząca wcześniejszego leczenia oraz leku, na który wystąpiła wyjątkowa odpowiedź
- Pacjent musi spełniać kryteria zgody; wymaga to: (i) aktualnej zgody osoby udzielającej pomocy w trybie wyjątkowym (ER) żyjącego uczestnika, który nie został utracony z obserwacji, (ii) uprzedniej zgody na przyszłe badania uczestnika, o którym nie wiadomo, że nie żyje, ale utracono go z obserwacji, lub ( iii) jeśli pacjent nie żyje i nie odmówił udziału w badaniu w momencie pobierania tkanki, która miałaby być wykorzystana w tym badaniu, wówczas zgoda nie jest wymagana
- Dostępna próbka guza spełniająca wymagania badania
Wymagane próbki guza MUSZĄ istnieć i być w stanie je przedłożyć; badacze, którzy chcą przekazać próbki, nie mogą zawrzeć umów, które zakazywałyby swobodnego korzystania z danych z takich próbek; National Cancer Institute (NCI) przekaże śledczym pismo do współpracownika zmieniające ich obecną umowę, aby umożliwić przedłożenie sprawy
- Wymagana jest tkanka nowotworowa sprzed podania leku, na którą wystąpiła wyjątkowa odpowiedź; najlepiej byłoby, gdyby ta próbka została pobrana tuż przed leczeniem, ale należy wziąć pod uwagę inne wcześniejsze tkanki; tkanka może być świeżo mrożona lub utrwalona w formalinie i zatopiona w parafinie
- Ilość tkanki guza musi wynosić co najmniej biopsję rdzeniową i spełniać minimalne wymagania dotyczące próbek
- Zalecane: normalna próbka tkanki: (opcjonalnie): krew lub inne źródło próbki do sekwencjonowania linii zarodkowej
- Próbki guza i dane kliniczne przesłane do bazy danych osób reagujących wyjątkowo w bazie danych w genotypach i fenotypach (dbGaP) będą musiały mieć odpowiednie umowy umożliwiające przesłanie; baza danych osób reagujących wyjątkowo może akceptować dane kliniczne i próbki z przypadków zapisanych do badania klinicznego sponsorowanego przez Program Oceny Terapii Raka (CTEP) oraz przypadków, które nie zostały włączone do żadnego badania klinicznego; jeśli odpowiedź wystąpiła w badaniu, które nie było sponsorowane przez CTEP, istnieją umowy między ośrodkiem zgłaszającym a firmą farmaceutyczną; jeśli istniejące umowy nie zezwalają na przedłożenie próbek i danych klinicznych, NCI przekaże badaczom pismo zezwalające na wykorzystanie tkanki do badania osób reagujących wyjątkowo, jeśli zostanie podpisane przez odpowiedniego współpracownika; pismo modyfikuje istniejącą umowę w celu uwzględnienia języka opcji CTEP dotyczącej własności intelektualnej (IP), który umożliwiłby zgłoszenie sprawy do bazy danych osób odpowiadających w wyjątkowych przypadkach; jeżeli dotychczasowa umowa nie może zostać zmieniona, a pismo nie może zostać podpisane, proponowana sprawa nie zostanie przyjęta; Uwaga: jak stwierdzono powyżej, pacjent nie musi być zapisany do badania klinicznego, aby kwalifikować się do badania osób reagujących wyjątkowo
Kryteria wyłączenia:
- Odpowiedź pacjenta nie spełniała kryteriów wyjątkowej odpowiedzi
- Oczekuje się, że schemat leczenia pacjenta doprowadzi do CR lub trwałego PR u > 10% pacjentów
- Czas trwania odpowiedzi pacjenta nie jest > 3 x oczekiwana mediana czasu trwania odpowiedzi
- Odpowiedź niemożliwa do oceny lub niemożliwa do przypisania leczeniu systemowemu (np. leczenie uzupełniające)
- Pacjent odmówił zgody na wykorzystanie tkanki do działań badawczych objętych badaniem osób reagujących nadzwyczajnie
- Próbka guza pobrana przed wystąpieniem wyjątkowej odpowiedzi jest niedostępna lub nie spełnia wskaźników jakości
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
- Modele obserwacyjne: Kontrola przypadków
- Perspektywy czasowe: Z mocą wsteczną
Liczba grup / kohort
Kohorty i interwencje
Grupa / KohortaGrupa / Kohorta |
Interwencja / LeczenieInterwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Pomocnicze korelacje (profilowanie molekularne)
Wcześniej pobrane próbki tkanek są analizowane za pomocą sekwencjonowania całego egzomu i/lub ukierunkowanego głębokiego sekwencjonowania w teście NGS.
Przypadki, dla których dostępne są wystarczające ilości kwasu nukleinowego, zostaną poddane dodatkowym analizom, w tym sekwencjonowaniu całego genomu, sekwencjonowaniu mRNA, sekwencjonowaniu miRNA, analizie metylacji promotora i analizie SNP.
|
Poddaj się sekwencjonowaniu i analizie SNP
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Cechy molekularne w próbkach tkanek od pacjentów, którzy wykazali się wyjątkową odpowiedzią
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Cechy molekularne guzów u pacjentów będą rozpoznawalne jako odrębne od guza w porównaniu z (i) próbkami z normalnej tkanki tego samego pacjenta i (ii) bazami danych zawierającymi podobne dane dla prawidłowych i innych typów nowotworów.
|
Linia bazowa
|
|
Domniemane mechanizmy działania terapii, które otrzymali pacjenci, gdy doświadczyli wyjątkowych reakcji
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Zbadane zostaną powiązania między zidentyfikowanymi cechami molekularnymi a domniemanymi mechanizmami działania terapii, które otrzymali pacjenci, gdy doświadczyli wyjątkowych odpowiedzi.
Analizy statystyczne będą miały przede wszystkim charakter opisowy.
|
Linia bazowa
|
|
Liczba przypadków zidentyfikowanych jako potencjalnie wyjątkowe osoby reagujące
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Analizy statystyczne będą miały przede wszystkim charakter opisowy.
|
Linia bazowa
|
|
Odsetek zidentyfikowanych potencjalnych przypadków, które potwierdzono jako wyjątkowe osoby reagujące
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Analizy statystyczne będą miały przede wszystkim charakter opisowy.
|
Linia bazowa
|
|
Odsetek potwierdzonych pacjentów z wyjątkową odpowiedzią, w przypadku których pobrano odpowiednią tkankę za odpowiednią świadomą zgodą
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Analizy statystyczne będą miały przede wszystkim charakter opisowy.
|
Linia bazowa
|
|
Procent nabytych przypadków z tkanką, dla której pomyślnie uzyskano przynajmniej minimalną charakterystykę molekularną
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Analizy statystyczne będą miały przede wszystkim charakter opisowy.
|
Linia bazowa
|
|
Odsetek przypadków scharakteryzowanych molekularnie, dla których raport Charakterystyki Molekularnej zidentyfikował (bez odniesienia do leku otrzymanego przez pacjenta) co najmniej jedną cechę uznaną za potencjalnie istotną terapeutycznie
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Obiecujące odkrycia zostaną podsumowane dla grupy przypadków, dla których pomyślnie uzyskano minimalną charakterystykę molekularną.
W każdym takim przypadku dane molekularne zostaną poddane przeglądowi przez panel ekspertów („Panel”) w celu zidentyfikowania interesujących cech.
Wszystkim oszacowanym proporcjom towarzyszyć będą dokładne 95% przedziały ufności.
|
Linia bazowa
|
|
Odsetek przypadków z >= 1 cechą w raporcie Charakterystyki Molekularnej, które uznano za mające potencjalne znaczenie terapeutyczne dla określonej klasy leków, które pacjent faktycznie otrzymał, gdy wystąpiła wyjątkowa odpowiedź
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Obiecujące odkrycia zostaną podsumowane dla grupy przypadków, dla których pomyślnie uzyskano minimalną charakterystykę molekularną.
W każdym takim przypadku panel dokona przeglądu danych molekularnych w celu zidentyfikowania interesujących cech.
Wszystkim oszacowanym proporcjom towarzyszyć będą dokładne 95% przedziały ufności.
|
Linia bazowa
|
|
Odsetek przypadków z >= 1 cechą korelującą z mechanizmem działania konkretnego grantu, na który wystąpiła wyjątkowa odpowiedź, którą stwierdzono po dalszej analizie danych profilu molekularnego pod kątem odpowiednich nieprawidłowości molekularnych
Ramy czasowe: Linia bazowa
|
Obiecujące odkrycia zostaną podsumowane dla grupy przypadków, dla których pomyślnie uzyskano minimalną charakterystykę molekularną.
W każdym takim przypadku panel dokona przeglądu danych molekularnych w celu zidentyfikowania interesujących cech.
Wszystkim oszacowanym proporcjom towarzyszyć będą dokładne 95% przedziały ufności.
|
Linia bazowa
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Sponsor
Śledczy
Śledczy
- Główny śledczy: S. P Ivy, National Cancer Institute (NCI)
Publikacje i pomocne linki
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
Rozpoczęcie studiów
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
Zakończenie podstawowe
Ukończenie studiów (Szacowany)
Ukończenie studiów
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (Szacowany)
Pierwszy wysłany
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Rzeczywisty)
Ostatnia wysłana aktualizacja
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
Inne numery identyfikacyjne badania
- NCI-2014-01585 (Identyfikator rejestru: CTRP (Clinical Trial Reporting Program))
- UM1CA186704 (Grant/umowa NIH USA)
- 9671 (Inny identyfikator: CTEP)
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .