Związek wcześniej zweryfikowanych polimorfizmów genów z AMD w populacji tureckiej (AMD-SNP)

Zwyrodnienie plamki żółtej związane z wiekiem (AMD) pozostaje najważniejszą przyczyną poważnego upośledzenia wzroku osób starszych w krajach rozwiniętych. Jest to jedna z najlepiej scharakteryzowanych chorób o złożonej charakterystyce. W patogenezie odgrywa rolę wiele czynników genetycznych i środowiskowych. Wiele różnych szlaków biologicznych i powiązanych polimorfizmów genów jest silnie zaangażowanych w jego etiologię. Zbadano wiele lokalizacji chromosomów, aby ustalić genetyczne czynniki ryzyka odpowiedzialne za rozwój AMD. Większość wariantów genetycznych, które zostały uznane za związane z AMD przynajmniej w jednym badaniu, nie została zweryfikowana w kolejnych badaniach. Jednak w ostatnich latach polimorfizmy pojedynczych nukleotydów związane z układem dopełniacza, a także chromosomem 10q26 zostały silnie wywołane, aby predysponować jednostki do podatności na AMD. Polimorfizmy te zostały zweryfikowane w kolejnych badaniach. Jednak wyniki z różnych regionów geograficznych świata mogą przedstawiać rozbieżności w zależności od populacji etnicznej. Wspomniane testy genetyczne zostały wprowadzone komercyjnie w celu określenia ryzyka progresji do zaawansowanego stadium AMD, a stopień ryzyka można określić na podstawie wyników badań genetycznych wraz z czynnikami środowiskowymi w USA.

Zwyrodnienie plamki żółtej związane z wiekiem składa się z postaci suchej i mokrej. Chociaż postać mokra jest odpowiedzialna za poważną utratę wzroku spowodowaną AMD, postać sucha może z upływem czasu przejść do postaci mokrej. Ryzyko wystąpienia AMD wzrasta wraz z wiekiem i powoduje bardzo poważną utratę widzenia centralnego; w konsekwencji znacznie obniża jakość życia populacji starczej. Dostępne leczenie AMD jest drogie i pociąga za sobą obciążenia ekonomiczne. Wczesne rozpoznanie choroby ma korzystny wpływ na rokowanie pozabiegowe. Chociaż podstawą leczenia jest przede wszystkim zachowanie dotychczasowej ostrości wzroku, to w ostatnich latach możliwe jest uzyskanie poprawy ostrości wzroku za pomocą środków hamujących angiogenezę. Jednak pełnej odpowiedzi na leczenie nie uzyskuje się u około jednej piątej pacjentów. W pozostałej grupie uzyskuje się odmienne odpowiedzi na leczenie. Przyczyną różnic w leczeniu mogą być różne podgrupy morfologiczne i/lub różnorodność wariantów genetycznych wysiękowej postaci AMD. . W tej chwili nie wiemy, czy polimorfizmy genów związane z AMD ustalone w niektórych populacjach zachodnich są również związane z AMD w naszej populacji lub czy ta zależność ma podobne ryzyko lub działanie ochronne dla AMD. Warianty genów najczęściej badane w odniesieniu do AMD to CFH (rs1061170 i rs1410996), LOC387715/ARMS-2 (A69S /rs10490924), HTRA-1 (rs11200638), C3 (R102G/rs2230199), C2 E318D (rs9332739) i CFB R32Q (rs641153). Opublikowane niedawno wstępne badanie przeprowadzone przez nasz zespół w jednym ośrodku i na niewielkiej liczbie pacjentów wykazało, że polimorfizmy genów CFH i LOC387715 wiążą się z ryzykiem późnego AMD i zasugerowało konieczność przeprowadzenia dalszych badań na większej populacji w celu zdobyć konkretne informacje o naszej populacji. Z drugiej strony, po raz pierwszy w naszej populacji przebadanych zostanie całe osiem locus genetycznych związanych z AMD. We wprowadzonych projektach zbadano pokrewieństwo ośmiu różnych polimorfizmów genów (CFH rs1061170 i rs1410996, LOC387715 / ARMS2 gen rs10490924, C2 gen rs9332739, CFB gen rs641153, CFI rs10033900 , HTRA-1 gen rs11200638, C3 r s2230199) będą badane w 2800 roku pacjentów z pośrednią i późną postacią AMD wysokiego ryzyka oraz 2200 osób z grupy kontrolnej dobranej pod względem wieku. Próbki krwi z żył ramiennych badanych będą pobierane w 5 ośrodkach zdrowia składających się z Centrum Okulistycznego Bursa Retina i Szpitali Uniwersytetu Afyon Kocatepe, Uniwersytetu Dokuz Eylul, Uniwersytetu Konya i Uniwersytetu Uludag w okresie 32 miesięcy. Po pobraniu próbek żylnych polimorfizmy zostaną genotypowane za pomocą systemów genotypowania „PCR w czasie rzeczywistym” i „pirosekwencjonowania” w laboratorium genetycznym Afyon Kocatepe University Medical School. W ciągu ostatnich 3 miesięcy trwania projektu, po zakończeniu genotypowania wszystkich próbek, dokonana zostanie kliniczna i statystyczna ocena danych z badania oraz przygotowanie raportu końcowego. . Jako główny wynik, efekty ochronne lub stopień ryzyka rozwoju późnej AMD dla każdego polimorfizmu genetycznego zostaną obliczone za pomocą analizy statystycznej następującej po genotypowaniu. Przeprowadzone zostaną analizy podrzędne w celu zbadania wszelkich związków między polimorfizmem genetycznym a reakcją na leczenie. Przeprowadzone zostaną analizy podrzędne w celu określenia możliwych różnic w wariantach genetycznych między późną suchą i wysiękową postacią AMD, a także między podtypami morfologicznymi wysiękowej postaci AMD. Badanie główne i badania dodatkowe opracowane na podstawie analiz cząstkowych przy użyciu dalszej metodologii zostaną przedłożone do publikacji jako odrębne badania. Oczekiwane wyniki badania mogą mieć wpływ na postępowanie i obserwację pacjentów z AMD. Ponieważ AMD jest chorobą wieloczynnikową o etiologii i poza cechami genotypowymi czynnik ryzyka jest kontrolowany przez środowisko, możliwe może być wczesne rozpoznanie i częsta obserwacja, oprócz zalecenia unikania modyfikowalnych czynników ryzyka u pacjentów z wczesną postacią AMD, którzy są genetycznie zaburzeni. wysokie ryzyko rozwoju późnego AMD zgodnie z ustaleniami uzyskanymi z wyników naszych badań. Na podstawie genotypowania możliwe będzie również ustalenie pacjentów z wysiękową postacią AMD, którzy są oporni lub wrażliwi na leczenie. Zostanie ustalone, czy wykonywanie badań genetycznych u pacjentów, którzy są kandydatami do późnej postaci AMD w najbliższej przyszłości, jest istotne i znaczące dla naszej populacji. Ocenione przez nas wyniki wraz z literaturą znacząco przyczynią się do lepszego zrozumienia patogenezy AMD oraz wczesnej diagnozy i lepszej klasyfikacji lub wyboru leczenia.