Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Отношения митохондрий и микробиоты

25 июня 2019 г. обновлено: Newcastle University

Можно ли объединить метагеномные и метаданные с использованием методов биоинформатики и вычислительной биологии для персонализации лечения пациентов.

Нарушения моторики желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) у пациентов с митохондриальными заболеваниями выявляются все чаще и часто включают дисфагию, боль в животе, вздутие живота, избыточный бактериальный рост, запоры и, в тяжелых случаях, хирургическое вмешательство. Хотя предполагаемые патологические механизмы, лежащие в основе развития нарушения моторики ЖКТ, остаются разнообразными, потенциальные механизмы включают митохондриальную дисфункцию гладкой мускулатуры желудочно-кишечного тракта и висцеральную миопатию. Кроме того, бактерии в желудочно-кишечном тракте, называемые «кишечной микробиотой», также были определены как ключевой фактор нарушения моторики ЖКТ.

Цель: Целью этого исследования является оценка роли, которую микробиота кишечника играет в клиническом выражении заболевания у пациентов с митохондриальным заболеванием.

Цели: Это технико-экономическое обоснование для оценки:

  1. Как тяжесть клинического заболевания влияет на микробиоту кишечника у митохондриальных пациентов по сравнению со здоровым контролем.
  2. Как улучшить диагностические и терапевтические подходы к митохондриальным заболеваниям.

Методы: это экспериментальное исследование, являющееся частью биобанка митохондриальных исследований Ньюкасла. Образцы стула будут собираться у пациентов с митохондриальной энцефаломиопатией, лактоацидозом и инсультоподобными эпизодами (MELAS), носителей фенотипа мутации m.3243 A>G (N = 20) из Центра митохондриальных исследований Совета медицинских исследований Соединенного Королевства (MRC). Когорта пациентов с заболеванием (RES/0211/7552, самая большая когорта митохондриальных пациентов в мире) и митохондриальная клиника, возраст и пол соответствовали здоровому контролю (N = 20). ДНК будет извлечена из образцов стула, и будет секвенирован ген 16S рРНК (область V4). Эти данные будут проанализированы с использованием конвейеров биоинформатики и вычислительной биологии.

Долгосрочная цель: получить новую информацию о том, как микробиота кишечника влияет на клиническое проявление заболевания. Затем эту информацию можно использовать для построения прогностической модели, предназначенной для оптимизации диагностики и терапевтического лечения. Этот метод также имеет потенциал для использования в качестве модели старения и заболеваний, связанных с неправильной работой митохондрий, таких как диабет, рак и болезнь Паркинсона. Это исследование может снизить расходы NHS и улучшить уход за пациентами и качество их жизни.

Обзор исследования

Статус

Завершенный

Подробное описание

Актуальность темы Митохондриальные заболевания представляют собой важную группу наследственных нейрометаболических нарушений, которые неизменно демонстрируют полиорганное поражение, неуклонно прогрессируют и приводят к значительной заболеваемости и смертности. Они могут проявляться в виде дискретных клинических синдромов, таких как митохондриальная энцефаломиопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды (MELAS), хроническая и прогрессирующая наружная офтальмоплегия (CPEO), а также глухота и диабет по материнской линии (MIDD), или, чаще, с широким перекрывающимся спектром клинических признаков, включая гипертрофическую кардиомиопатию и нарушение моторики желудочно-кишечного тракта. Симптомы, возникающие из-за нарушения моторики желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) у пациентов с митохондриальным заболеванием, все чаще распознаются и часто включают дисфагию, боль в животе, вздутие живота, избыточный бактериальный рост, запор и, в тяжелых случаях, псевдонепроходимость кишечника, имитирующую острую хирургическую брюшную полость. Высокая частота этого была недавно подтверждена, когда мы обследовали 86 митохондриальных пациентов на предмет желудочно-кишечных симптомов. Шестьдесят пять процентов пациентов испытывали симптомы нарушения моторики ЖКТ, включая запоры, раннее чувство насыщения, боль в животе и вздутие живота (готовится к публикации). Хотя предполагаемые патологические механизмы, лежащие в основе развития нарушения моторики ЖКТ, остаются разнообразными, потенциальные механизмы включают митохондриальную дисфункцию гладкой мускулатуры желудочно-кишечного тракта и висцеральную миопатию. Кроме того, бактерии в желудочно-кишечном тракте, называемые «кишечной микробиотой», также были определены как ключевой фактор нарушения моторики ЖКТ.

Обоснование На сегодняшний день существует мало эффективных методов лечения пациентов с митохондриальными заболеваниями, а те, которые доступны, носят преимущественно поддерживающий характер без доказанной эффективности лечения и плохого понимания связей между кишечной микробиотой, митохондриальными заболеваниями, нарушением моторики ЖКТ и здоровьем пациентов и качеством лечения. жизнь. Лечение включает различные антибиотики и слабительные, которые являются общими, а не специфическими для заболевания. Долгосрочные эффекты лекарств неизвестны, и их влияние на желудочно-кишечный тракт и микробиоту кишечника при митохондриальных заболеваниях в настоящее время неизвестно. Крайне важно оптимизировать поддерживающие терапевтические стратегии и разработать новые методы для улучшения клинического ведения. Хотя достижения в области технологий в настоящее время предоставляют больше биологической информации, чем когда-либо прежде, сложность и объем генерируемых данных превышают возможности анализа, интерпретации и перевода этой информации обратно в клиническое управление, что подчеркивает необходимость увеличения клинических аналитических возможностей. Использование биоинформатики и вычислительной биологии для объединения метагеномных данных, относящихся к микробиоте кишечника, и метаданных (характеристики пациента; фенотип/генотип) является одним из подходов к выявлению и прогнозированию того, какие факторы, такие как лекарства, фенотип и генотип, вызывают дисбиоз кишечной микробиоты.

Выяснение сложности и работы кишечной микробиоты при митохондриальных заболеваниях обеспечивает уникальный подход и более глубокое понимание биологии в целом, чего в настоящее время не хватает при первичных митохондриальных заболеваниях. Это исследование внесет свой вклад в изучение микробиома кишечника и даст новое представление о сложных взаимодействиях микроб: микроб и микробиота-хозяин. Новые идеи, полученные здесь, послужат основой для интервенционных исследований, направленных на манипулирование микробиомом кишечника и облегчение бремени болезни у пациентов с митохондриальными заболеваниями и, возможно, заболеваниями, связанными с митохондриальной дисфункцией, такими как ожирение, диабет и нейродегенеративные расстройства, такие как слабоумие и болезнь Паркинсона. болезнь.

Цели

Рабочая гипотеза состоит в том, что у пациентов с митохондриальным заболеванием наблюдается нарушение моторики ЖКТ, а микробиота кишечника усиливает клиническую тяжесть заболевания. Это исследование направлено на предоставление новой информации, касающейся:

  1. Как тяжесть клинического заболевания влияет на микробиоту кишечника у митохондриальных пациентов по сравнению со здоровым контролем.
  2. Как можно улучшить диагностические и терапевтические подходы к митохондриальным заболеваниям.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Действительный)

40

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Места учебы

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

14 лет и старше (Взрослый, Пожилой взрослый)

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Полы, имеющие право на обучение

Все

Метод выборки

Невероятностная выборка

Исследуемая популяция

Митохондриальные заболевания представляют собой важную группу наследственных нейрометаболических нарушений, которые неизменно демонстрируют полиорганное поражение, неуклонно прогрессируют и приводят к значительной заболеваемости и смертности. Они могут проявляться в виде дискретных клинических синдромов, таких как митохондриальная энцефаломиопатия, лактоацидоз и инсультоподобные эпизоды (MELAS), хроническая и прогрессирующая наружная офтальмоплегия (CPEO), а также глухота и диабет по материнской линии (MIDD), или, чаще, с широким перекрывающимся спектром клинических признаков, включая гипертрофическую кардиомиопатию и нарушение моторики желудочно-кишечного тракта (Gorman et al., 2016; Taylor & Turnbull, 2005).

Описание

Критерии включения:

Митохондриальные пациенты

  • Мужчины и женщины старше 18 лет на момент скрининга
  • У пациентов должно быть доказано генетическое заболевание (подтвержденное оценкой гетероплазмии в образцах крови и мочи) мутации m.3243 A>G.
  • Способность предоставить информированное согласие перед любой деятельностью, связанной с исследованием.
  • Способность и готовность придерживаться протокола, включая все встречи.
  • Умение читать и общаться на английском языке.

Здоровый контроль

  • Мужчины и женщины старше 18 лет на момент скрининга
  • Способность предоставить информированное согласие перед любой деятельностью, связанной с исследованием.
  • Способность и готовность придерживаться протокола, включая все встречи.
  • Умение читать и общаться на английском языке.

Критерий исключения:

  • Предыдущая история противопоказанных состояний, включая инсульт, поражение (я) головного мозга или опухоль.
  • Аномальные клинические результаты, установленные врачом.
  • Пациент, не способный дать информированное согласие.
  • Нежелание пациента соблюдать протокол, включая все назначения.
  • Языковые барьеры, мешающие пациентам читать и разговаривать на английском языке.

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

  • Наблюдательные модели: Когорта
  • Временные перспективы: Поперечный разрез

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Пациенты с митохондриальными заболеваниями
  • Мужчины и женщины старше 18 лет на момент скрининга
  • У пациентов должно быть доказано генетическое заболевание (подтвержденное оценкой гетероплазмии в образцах крови и мочи) мутации m.3243 A>G.
  • Способность предоставить информированное согласие перед любой деятельностью, связанной с исследованием.
  • Способность и готовность придерживаться протокола, включая все встречи.
  • Умение читать и общаться на английском языке.
Группа здорового контроля
  • Мужчины и женщины старше 18 лет на момент скрининга
  • Способность предоставить информированное согласие перед любой деятельностью, связанной с исследованием.
  • Способность и готовность придерживаться протокола, включая все встречи.
  • Умение читать и общаться на английском языке.

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Ген 16S рРНК
Временное ограничение: 6 месяцев
ДНК будет извлечена из образцов стула, и будет секвенирован ген 16S рРНК (область V4).
6 месяцев

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

Следователи

  • Главный следователь: Grainne Gorman, MD, Consultant Neurologist and Clinical Senior Lecturer

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

11 апреля 2017 г.

Первичное завершение (Действительный)

2 февраля 2019 г.

Завершение исследования (Действительный)

2 февраля 2019 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

7 июля 2017 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

7 июля 2017 г.

Первый опубликованный (Действительный)

11 июля 2017 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

26 июня 2019 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

25 июня 2019 г.

Последняя проверка

1 июня 2019 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • Version 1

Планирование данных отдельных участников (IPD)

Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?

Нет

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться