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Relation mitochondriale et microbiote

25 juin 2019 mis à jour par: Newcastle University

La métagénomique et les métadonnées peuvent-elles être combinées à l'aide de méthodes de bioinformatique et de biologie computationnelle pour personnaliser le traitement des patients.

La dysmotilité gastro-intestinale (GI) chez les patients atteints d'une maladie mitochondriale est de plus en plus reconnue et comprend souvent une dysphagie, des douleurs abdominales, une distension abdominale, une prolifération bactérienne, une constipation et, dans les cas graves, une intervention chirurgicale. Bien que les mécanismes pathologiques proposés sous-jacents au développement de la dysmotilité gastro-intestinale restent divers, les mécanismes potentiels incluent le dysfonctionnement mitochondrial du muscle lisse dans le tractus gastro-intestinal et la myopathie viscérale. De plus, les bactéries présentes dans le tractus gastro-intestinal, appelées «microbiote intestinal», ont également été identifiées comme un contributeur clé à la dysmotilité gastro-intestinale.

Objectif : Le but de cette étude est d'évaluer le rôle du microbiote intestinal sur l'expression clinique de la maladie chez les patients atteints d'une maladie mitochondriale.

Objectifs : Il s'agit d'une étude de faisabilité pour évaluer :

  1. Quel est l'impact de la gravité clinique de la maladie sur le microbiote intestinal chez les patients mitochondriaux par rapport aux témoins sains.
  2. Comment améliorer les approches diagnostiques et thérapeutiques des maladies mitochondriales.

Méthodes : Il s'agit d'une étude pilote faisant partie de la Newcastle Mitochondrial Research Biobank. Des échantillons de selles seront prélevés chez des patients atteints d'une encéphalomyopathie mitochondriale, d'acidose lactique et d'épisodes de type AVC (MELAS) porteurs de la mutation m.3243 A> G (N = 20) du Centre pour la mitochondrie du United Kingdom Medical Research Council (MRC). Disease Patient Cohort (RES/0211/7552, la plus grande cohorte de patients mitochondriaux au monde) et la clinique mitochondriale et les témoins sains appariés selon l'âge et le sexe (N = 20). L'ADN sera extrait des échantillons de selles et le gène de l'ARNr 16S (région V4) sera séquencé. Ces données seront analysées à l'aide de pipelines bioinformatiques et de biologie computationnelle.

Objectif à long terme : Générer de nouvelles informations sur l'impact du microbiote intestinal sur l'expression clinique de la maladie. Ces informations pourraient ensuite être utilisées pour construire un modèle prédictif destiné à optimiser le diagnostic et les traitements thérapeutiques. Cette méthode peut également être utilisée comme modèle pour le vieillissement et les maladies associées aux mitochondries qui ne fonctionnent pas correctement, telles que le diabète, le cancer et la maladie de Parkinson. Cette recherche a le potentiel de réduire les coûts pour le NHS et d'améliorer les soins aux patients et leur qualité de vie.

Aperçu de l'étude

Statut

Complété

Les conditions

Description détaillée

Contexte Les maladies mitochondriales sont un groupe important de troubles neurométaboliques héréditaires qui présentent invariablement une atteinte de plusieurs organes, sont inexorablement évolutifs et entraînent une morbidité et une mortalité importantes. Ils peuvent se manifester sous la forme de syndromes cliniques discrets tels que l'encéphalomyopathie mitochondriale, l'acidose lactique et les épisodes ressemblant à des accidents vasculaires cérébraux (MELAS), l'ophtalmoplégie externe chronique et progressive (CPEO) et la surdité et le diabète héréditaires maternels (MIDD), ou plus communément avec un large spectre qui se chevauchent. des caractéristiques cliniques, y compris la cardiomyopathie hypertrophique et la dysmotilité gastro-intestinale (GI). Les symptômes résultant d'une dysmotilité gastro-intestinale (GI) chez les patients atteints d'une maladie mitochondriale sont de plus en plus reconnus et comprennent souvent une dysphagie, des douleurs abdominales, une distension abdominale, une prolifération bactérienne, une constipation et, dans les cas graves, une pseudo-obstruction intestinale imitant un abdomen chirurgical aigu. L'incidence élevée de cela a été récemment confirmée lorsque nous avons interrogé 86 patients mitochondriaux sur les symptômes gastro-intestinaux. Soixante-cinq pour cent des patients ont présenté des symptômes de dysmotilité gastro-intestinale, notamment constipation, satiété précoce, douleurs abdominales et distension abdominale (en préparation pour publication). Bien que les mécanismes pathologiques proposés sous-jacents au développement de la dysmotilité gastro-intestinale restent divers, les mécanismes potentiels incluent le dysfonctionnement mitochondrial du muscle lisse dans le tractus gastro-intestinal et la myopathie viscérale. De plus, les bactéries présentes dans le tractus gastro-intestinal, appelées «microbiote intestinal», ont également été identifiées comme un contributeur clé à la dysmotilité gastro-intestinale.

Justification À ce jour, il existe peu de traitements efficaces pour les patients atteints de maladie mitochondriale et ceux disponibles sont principalement de nature de soutien sans efficacité de traitement prouvée et une mauvaise compréhension des liens entre le microbiote intestinal, la maladie mitochondriale, la dysmotilité gastro-intestinale et la santé et la qualité du patient. vie. Les traitements comprennent divers antibiotiques et laxatifs qui sont génériques et non spécifiques à une maladie. Les effets à long terme des médicaments sont inconnus et leur impact sur le tractus gastro-intestinal et le microbiote intestinal dans les troubles mitochondriaux est actuellement inconnu. Il est essentiel d'optimiser les stratégies thérapeutiques de soutien et de concevoir de nouvelles modalités pour améliorer la prise en charge clinique. Bien que les progrès technologiques fournissent désormais plus d'informations biologiques que jamais auparavant, la complexité et le volume des données générées dépassent la capacité d'analyser, d'interpréter et de traduire ces informations dans la gestion clinique, soulignant la nécessité d'augmenter les capacités analytiques cliniques. L'utilisation de la bioinformatique et de la biologie computationnelle pour combiner les données métagénomiques relatives au microbiote intestinal et les métadonnées (caractéristiques du patient ; phénotype/génotype) est une approche pour identifier et prédire quels facteurs, tels que les médicaments, le phénotype et le génotype, induisent une dysbiose du microbiote intestinal.

Élucider la complexité et le fonctionnement du microbiote intestinal dans les maladies mitochondriales fournit une approche unique et une compréhension plus approfondie de la biologie en général, qui fait actuellement défaut dans les troubles mitochondriaux primaires. Cette recherche contribuera au domaine du microbiome intestinal et fournira un nouvel aperçu des interactions complexes microbe:microbe et microbiote-hôte. Les nouvelles connaissances générées ici fourniront la base d'études interventionnelles visant à manipuler le microbiome intestinal et à soulager le fardeau de la maladie chez les patients atteints de maladies mitochondriales et potentiellement de maladies associées à un dysfonctionnement mitochondrial, telles que l'obésité, le diabète et les troubles neurodégénératifs tels que la démence et la maladie de Parkinson. maladie.

Objectifs

L'hypothèse de travail est que les patients atteints de maladie mitochondriale présentent une dysmotilité gastro-intestinale et que le microbiote intestinal accentue la gravité clinique de la maladie. Cette étude vise à fournir de nouvelles informations concernant :

  1. Quel est l'impact de la gravité clinique de la maladie sur le microbiote intestinal chez les patients mitochondriaux par rapport aux témoins sains.
  2. Comment les approches diagnostiques et thérapeutiques des maladies mitochondriales peuvent être améliorées.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Réel)

40

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

    • Tyne And Wear
      • Newcastle upon Tyne, Tyne And Wear, Royaume-Uni, NE2 4HH
        • Grainne Gorman

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

16 ans et plus (Adulte, Adulte plus âgé)

Accepte les volontaires sains

Non

Sexes éligibles pour l'étude

Tout

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Les maladies mitochondriales sont un groupe important de troubles neurométaboliques héréditaires qui présentent invariablement une atteinte de plusieurs organes, sont inexorablement évolutifs et entraînent une morbidité et une mortalité importantes. Ils peuvent se manifester sous la forme de syndromes cliniques discrets tels que l'encéphalomyopathie mitochondriale, l'acidose lactique et les épisodes ressemblant à des accidents vasculaires cérébraux (MELAS), l'ophtalmoplégie externe chronique et progressive (CPEO) et la surdité et le diabète héréditaires maternels (MIDD), ou plus communément avec un large spectre qui se chevauchent. des caractéristiques cliniques, y compris la cardiomyopathie hypertrophique et la dysmotilité gastro-intestinale (GI) (Gorman et al., 2016 ; Taylor et Turnbull, 2005).

La description

Critère d'intégration:

Patients mitochondriaux

  • Hommes et femmes de plus de 18 ans au moment du dépistage
  • Les patients doivent avoir une maladie génétique prouvée (confirmée par l'évaluation de l'hétéroplasmie dans des échantillons de sang et d'urine) de la mutation m.3243 A>G.
  • Capacité à fournir un consentement éclairé pris avant toute activité liée à l'étude.
  • Capacité et volonté de respecter le protocole, y compris tous les rendez-vous.
  • Capacité à lire et converser en anglais.

Contrôles sains

  • Hommes et femmes de plus de 18 ans au moment du dépistage
  • Capacité à fournir un consentement éclairé pris avant toute activité liée à l'étude.
  • Capacité et volonté de respecter le protocole, y compris tous les rendez-vous.
  • Capacité à lire et converser en anglais.

Critère d'exclusion:

  • Antécédents de conditions contre-indiquées, y compris accident vasculaire cérébral, lésion(s) cérébrale(s) ou tumeur.
  • Résultats cliniques anormaux déterminés par le médecin.
  • Patient incapable de fournir un consentement éclairé.
  • Refus du patient de respecter le protocole, y compris tous les rendez-vous.
  • Barrières linguistiques empêchant les patients de lire et de converser en anglais.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

  • Modèles d'observation: Cohorte
  • Perspectives temporelles: Transversale

Cohortes et interventions

Groupe / Cohorte
Patients atteints de maladies mitochondriales
  • Hommes et femmes de plus de 18 ans au moment du dépistage
  • Les patients doivent avoir une maladie génétique prouvée (confirmée par l'évaluation de l'hétéroplasmie dans des échantillons de sang et d'urine) de la mutation m.3243 A>G.
  • Capacité à fournir un consentement éclairé pris avant toute activité liée à l'étude.
  • Capacité et volonté de respecter le protocole, y compris tous les rendez-vous.
  • Capacité à lire et converser en anglais.
Groupe témoin sain
  • Hommes et femmes de plus de 18 ans au moment du dépistage
  • Capacité à fournir un consentement éclairé pris avant toute activité liée à l'étude.
  • Capacité et volonté de respecter le protocole, y compris tous les rendez-vous.
  • Capacité à lire et converser en anglais.

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Description de la mesure
Délai
Gène ARNr 16S
Délai: 6 mois
L'ADN sera extrait des échantillons de selles et le gène de l'ARNr 16S (région V4) sera séquencé.
6 mois

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Grainne Gorman, MD, Consultant Neurologist and Clinical Senior Lecturer

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

11 avril 2017

Achèvement primaire (Réel)

2 février 2019

Achèvement de l'étude (Réel)

2 février 2019

Dates d'inscription aux études

Première soumission

7 juillet 2017

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

7 juillet 2017

Première publication (Réel)

11 juillet 2017

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

26 juin 2019

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

25 juin 2019

Dernière vérification

1 juin 2019

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Termes MeSH pertinents supplémentaires

Autres numéros d'identification d'étude

  • Version 1

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

Non

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

Essais cliniques sur Maladies mitochondriales

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