Профиль микроРНК при раке шейки матки на ранней стадии

Рак шейки матки (РШМ) является одним из наиболее распространенных видов рака у женщин из стран с развивающейся экономикой; в Мексике СС занимает второе место по уровню заболеваемости и смертности. Несколько исследований продемонстрировали, что наиболее важным прогностическим фактором является метастазирование в лимфатические узлы у пациенток с РШМ на ранней стадии перед радикальной гистерэктомией (РГ) с двусторонней тазовой лимфаденэктомией (БПЛ), при которой положительные метастазы в лимфатические узлы снижают общую выживаемость (ОВ) с 80% до 53% через 5 лет.

МикроРНК (миРНК) представляют собой одноцепочечные РНК, состоящие примерно из 21-23 нуклеотидов. miRNAs регулируют экспрессию генов посредством ингибирования посттранскрипционных событий и, в некоторых случаях, индуцируют деградацию своей целевой матричной РНК. При раке микроРНК могут функционировать как онкогены и/или как гены-супрессоры опухолей в зависимости от функции их генов-мишеней.

Фиксированные в формалине залитые парафином (FFPE) блоки тканей от пациентов с РХ, диагностированных в период с января 2006 г. по декабрь 2013 г. в отделении онкологической гинекологии Национального института рака (Мехико), были проанализированы с целью отбора пациентов с подтвержденным гистопатологическим диагнозом стадии IB1 или IIA1 CC, обработанные RH и BPL. Тотальную РНК экстрагировали из 5 (10 мкм) срезов выбранных тканей. Для клинического корреляционного анализа образцы были разделены на 2 группы: 1 с положительной патологией скрытых метастазов в лимфатических узлах и 1 без патологии метастазов в лимфатических узлах. В обеих группах пациенты были сопоставимы по возрасту, размеру опухоли и наличию лимфоваскулярной инвазии.

Идентификацию глобальных профилей miRNA проводили с использованием массива GeneChip miRNA 3.0 (Affymetrix, Cat. 902018) в соответствии с инструкциями производителя. микроматрицу гибридизовали и промывали с помощью Affymetrix Fluidics Station 450 и сканировали с помощью Affymetrix GeneChip Scanner 3000. После обработки изображений необработанные данные были обработаны. Для получения профиля микроРНК обработанные образцы были разделены на 2 группы: образцы с метастазами в лимфатические узлы и образцы без метастазов в лимфатические узлы. Дифференциально экспрессируемые микроРНК идентифицировали с использованием порогового значения p <0,01 и кратности изменения (FC) 1,5. miRNAs, отвечающие этим критериям, были классифицированы как сверхэкспрессированные или недостаточно экспрессированные.