Применение метилированных маркеров в ранней диагностике и мониторинге минимальной остаточной болезни (MRD) рака легких

Рак легких имеет самую высокую глобальную заболеваемость и смертность среди всех злокачественных новообразований. Как страна с высокой заболеваемостью, Китай сообщил о примерно 1,0606 миллиона новых случаев и 733 300 смертей в 2022 году, что составляет 22,0% и 28,5% от всех злокачественных опухолей соответственно. Хотя ранняя хирургия является основным лечебным подходом, риск послеоперационного рецидива значителен, с 5-летними показателями рецидива 19% для стадии IA, 30% для стадии IB и 48,6% для стадии II НМРЛ. 3-летний показатель рецидива для пациентов стадии III достигает 52%. Критически важно, что даже когда визуализация подтверждает «состояние без опухоли» (резекция R0), скрытое минимальное остаточное заболевание (МОЗ) часто приводит к рецидиву.

Текущее обнаружение МОЗ в основном анализирует мутации в циркулирующей опухолевой ДНК (цтДНК). Однако высокая межпациентная мутационная гетерогенность создает проблемы для разработки компактных, широко эффективных панелей обнаружения. Подход «информированный опухолью», который разрабатывает пациент-специфические панели, ограничен своей зависимостью от образцов опухолевой ткани. Напротив, биомаркеры метилирования ДНК для анализа МОЗ не требуют предварительного знания опухоле-специфических мутаций. Их чувствительность не зависит от бремени высокочастотных мутаций, изменения происходят на ранних стадиях опухолеобразования, и они демонстрируют тканевую и тип-раковую специфичность. Кроме того, метилирование ДНК показывает согласованность во многочисленных геномных регионах, позволяя обнаружение через множественные CpG-сайты.

«Экспертный консенсус по тестированию и клиническому применению биомаркеров метилирования опухолевой ДНК (апрель 2024)» утверждает, что вариации уровней метилирования ДНК тесно связаны с прогнозом опухоли и могут использоваться для оценки МОЗ и мониторинга рецидива. Растущие доказательства поддерживают это: исследование 2023 года в BMC Medicine с участием 195 пациентов с НМРЛ показало, что индивидуализированный мониторинг МОЗ на основе метилирования сигнализировал о рецидиве раньше, чем мониторинг на основе мутаций. Исследование 2023 года в JAMA Oncology продемонстрировало, что обнаружение метилирования цтДНК пяти генов могло предсказать рецидив колоректального рака до 20 месяцев раньше, чем визуализация, со значительно более высоким риском рецидива у пациентов, положительных по цтДНК через месяц после операции (HR=17,5). Другое проспективное исследование (NCT00958737) с участием 805 пациентов с колоректальным раком подтвердило значительно более высокую 2-летнюю выживаемость без заболевания в группе с отрицательным метилированием цтДНК (82% против 64%).

Это исследование направлено на изучение роли уровней метилирования генов SHOX2 и PTGER4 в плазме в мониторинге МОЗ и оценке эффективности у пациентов с НМРЛ после операции. В исследование будут включены пациенты с гистопатологически/клинически диагностированным НМРЛ стадии I-IV, подвергающиеся хирургической резекции. Периферическая кровь будет собрана в несколько временных точек: до лечения и после лечения через 3 дня, 1 месяц, 3 месяца, 6 месяцев, 9 месяцев, 12 месяцев, 18 месяцев, 24 месяца и при рецидиве для анализа метилирования цтДНК.

Статистические анализы будут включать: оценку корреляции между уровнями метилирования и радиологическими показателями с использованием коэффициентов Пирсона или Спирмена; оценку прогностической силы для рецидива с использованием кривых рабочих характеристик приемника (ROC); стратификацию пациентов на группы высокого и низкого риска на основе результатов метилирования; построение кривых безрецидивной выживаемости с использованием метода Каплана-Мейера и сравнение групп с помощью лог-рангового теста; оценку независимой прогностической ценности метилирования SHOX2 и PTGER4 для риска рецидива с использованием многомерного регрессионного анализа Кокса, с поправкой на смешивающие факторы, такие как возраст, пол и стадия опухоли; наконец, оценку индивидуализированной терапевтической эффективности на основе времени позитивности цтДНК, выживаемости без заболевания (ВБЗ) и общей выживаемости (ОВ). Цель состоит в том, чтобы предоставить научную основу для прогнозирования риска рецидива и руководства решениями по лечению.