Aplikace metylačních markerů při včasné detekci a monitorování MRD u karcinomu plic

Rakovina plic má nejvyšší celosvětovou incidenci a mortalitu mezi všemi maligními nádory. Jako země s vysokým výskytem nahlásila Čína v roce 2022 přibližně 1,0606 milionu nových případů a 733 300 úmrtí, což představuje 22,0 % a 28,5 % všech maligních nádorů. Zatímco časná chirurgie je primárním léčebným přístupem, riziko pooperační recidivy je značné, s 5letými mírami recidivy 19 % pro stadium IA, 30 % pro stadium IB a 48,6 % pro stadium II NSCLC. 3letá míra recidivy pro pacienty ve stadiu III je až 52 %. Klíčové je, že i když zobrazovací metody potvrdí „stav bez nádoru“ (R0 resekce), skryté minimální reziduální onemocnění (MRD) často vede k recidivě.

Stávající detekce MRD primárně analyzuje mutace v cirkulující tumorové DNA (ctDNA). Vysoká interindividuální mutační heterogenita však představuje výzvy pro navrhování kompaktních, široce účinných detekčních panelů. Přístup Tumor-informed, který navrhuje pacientům specifické panely, je omezen svou závislostí na vzorcích tumorové tkáně. Naopak, biomarkery metylace DNA pro analýzu MRD nevyžadují předchozí znalost tumor-specifických mutací. Jejich citlivost je nezávislá na vysokém mutačním zatížení, změny nastávají brzy v tumorigenezi a vykazují tkáňovou a typovou specifičnost rakoviny. Navíc metylace DNA vykazuje konzistenci napříč četnými genomickými oblastmi, což umožňuje detekci prostřednictvím více CpG míst.

„Expertní konsenzus o testování biomarkerů metylace tumorové DNA a klinické aplikaci (duben 2024)“ uvádí, že variace v úrovních metylace DNA jsou úzce spojeny s prognózou tumoru a mohou být použity pro hodnocení MRD a monitorování recidivy. Rostoucí důkazy to podporují: Studie z roku 2023 v BMC Medicine na 195 pacientech s NSCLC zjistila, že individualizované monitorování MRD založené na metylaci signalizovalo recidivu dříve než monitorování založené na mutacích. Studie z roku 2023 v JAMA Oncology prokázala, že detekce metylace ctDNA pěti genů může předpovědět recidivu kolorektálního karcinomu až o 20 měsíců dříve než zobrazovací metody, s významně vyšším rizikem recidivy u pacientů pozitivních na ctDNA jeden měsíc po operaci (HR=17,5). Další prospektivní studie (NCT00958737) na 805 pacientech s kolorektálním karcinem potvrdila významně vyšší 2letou míru bez onemocnění ve skupině negativní na metylaci ctDNA (82 % vs 64 %).

Tato studie si klade za cíl prozkoumat roli hladin metylace genů SHOX2 a PTGER4 v plazmě při monitorování MRD a hodnocení účinnosti u pacientů s NSCLC po operaci. Studie zahrne pacienty s histopatologicky/klinicky diagnostikovaným NSCLC stadia I-IV podstupující chirurgickou resekci. Periferní krev bude odebírána ve více časových bodech: před léčbou a po léčbě ve 3 dnech, 1 měsíci, 3 měsících, 6 měsících, 9 měsících, 12 měsících, 18 měsících, 24 měsících a při recidivě pro analýzu metylace ctDNA.

Statistické analýzy budou zahrnovat: Posouzení korelace mezi hladinami metylace a radiologickými metriky pomocí Pearsonova nebo Spearmanova koeficientu; Vyhodnocení prediktivní síly pro recidivu pomocí křivek ROC (Receiver Operating Characteristic); Stratifikaci pacientů do skupin s vysokým a nízkým rizikem na základě výsledků metylace; Vykreslení křivek bez recidivy pomocí Kaplan-Meierovy metody a porovnání skupin pomocí Log-rank testu; Posouzení nezávislé prediktivní hodnoty metylace SHOX2 a PTGER4 pro riziko recidivy pomocí multivariační Coxovy regresní analýzy, s úpravou na rušivé faktory jako věk, pohlaví a stadium tumoru; Nakonec hodnocení individualizované terapeutické účinnosti na základě načasování pozitivity ctDNA, bezpříznakového přežití (DFS) a celkového přežití (OS). Cílem je poskytnout vědecký základ pro predikci rizika recidivy a vedení léčebných rozhodnutí.