Denna sida har översatts automatiskt och översättningens korrekthet kan inte garanteras. Vänligen se engelsk version för en källtext.

Optimization of Collection Methods for Studies of the Human Microbiota

27 oktober 2020 uppdaterad av: National Cancer Institute (NCI)

Background:

The human microbiota is the bacteria and other microbes found in and on the human body. Scientists study the microbiota because it is related to many health conditions. The way samples are collected and handled can greatly affect microbiota study findings. Researchers want to learn more about how collection methods affect these studies.

Objectives:

To compare different oral and fecal collection methods. To test the effect of new methods to get DNA out of these samples.

Eligibility:

Adults ages 18 and older who are National Cancer Institute employees and have not taken antibiotics in the past 3 months

Design:

Participants will discuss the study with researchers.

Participants will give an oral or fecal sample or both.

For the oral sample, participants will be told what not to do beforehand. This includes chewing gum and smoking. Participants will spit saliva into a tube. Then they will get mouthwash in a vial. They will swish and gargle the mouthwash for 30 seconds then spit it back in the vial.

Participants giving a fecal sample will get a collection kit. They can collect the sample at home or elsewhere. Participants will have a bowel movement into the collection container. They will smear some of it on a card with a stick and put the rest in 2 tubes. They will mix the feces with the solution in the tubes. Participants will write the date and time of collection on the instructions and return the sample within 24 hours.

Participants providing both samples could have 3 study visits: 1 to give an oral sample, 1 to get the fecal sample collection kit, and 1 to return that sample.

Studieöversikt

Status

Indragen

Detaljerad beskrivning

The human microbiome (i.e., the collection of microbial genes found in and on the human body) has been observed to be associated with numerous health conditions, but current methodological studies suggest that collection method, laboratory handling, bioinformatic processing of the data, and other factors can greatly affect microbiome study findings. In cohort studies, samples should be collected using validated methods that can be analyzed using multiple technologies, however these technologies and methods are regularly changing and being modified. Therefore, we need to test multiple collection methods for new technologies or test new collection methods to assess the comparability of the results. We will evaluate the effect of several collection methods for oral and/or fecal samples from 100 individuals who work at the NCI on microbial characteristics. Once the samples are collected, we will create aliquots and store the samples for further processing. We will then test the effect of new DNA extraction methods, sequencing technologies, and bioinformatics pipelines using these samples. Any remaining aliquots will remain in the -80 degrees Celsius freezer for other future studies. This study will be essential to understand the impact of collection methods for oral and fecal samples for future epidemiologic studies.

Studietyp

Observationell

Kontakter och platser

Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.

Studieorter

    • Maryland
      • Rockville, Maryland, Förenta staterna, 20850
        • NIH NCI Shady Grove

Deltagandekriterier

Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.

Urvalskriterier

Åldrar som är berättigade till studier

18 år till 100 år (Vuxen, Äldre vuxen)

Tar emot friska volontärer

Ja

Kön som är behöriga för studier

Allt

Testmetod

Icke-sannolikhetsprov

Studera befolkning

We plan to recruit 100 adults who work at the NCI, either in Shady Grove or in the Advanced Technology Center (ATC), who are willing to provide oral and/or fecal samples. We will include any participant that is at least 18 years of age or older who is employed at NCI and has not taken antibiotics anytime in the past 3 months since antibiotic use has been shown to disrupt the microbiota.

Beskrivning

  • ELIGIBILITY CRITERIA:
  • Adults who work at the NCI, either in Shady Grove or in the Advanced Technology Center (ATC)
  • Willing to provide oral and/or fecal samples.
  • At least 18 years of age or older
  • Not taken antibiotics anytime in the past 3 months

Studieplan

Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.

Hur är studien utformad?

Designdetaljer

Kohorter och interventioner

Grupp / Kohort
General Individuals
Any adult working at the NCI who has not used antibiotics in the past 3 months.

Vad mäter studien?

Primära resultatmått

Resultatmått
Åtgärdsbeskrivning
Tidsram
Oral and/or fecal microbiota
Tidsram: 1 month
relative abundance and phylogenetic diversity of their oral and/or fecal microbiota
1 month

Samarbetspartners och utredare

Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.

Utredare

  • Huvudutredare: Emily J Vogtmann, Ph.D., National Cancer Institute (NCI)

Studieavstämningsdatum

Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.

Studera stora datum

Studiestart (Faktisk)

1 november 2018

Primärt slutförande (Faktisk)

27 oktober 2020

Avslutad studie (Faktisk)

27 oktober 2020

Studieregistreringsdatum

Först inskickad

3 november 2018

Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna

3 november 2018

Första postat (Faktisk)

6 november 2018

Uppdateringar av studier

Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)

28 oktober 2020

Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna

27 oktober 2020

Senast verifierad

1 oktober 2020

Mer information

Termer relaterade till denna studie

Andra studie-ID-nummer

  • 999919013
  • 19-C-N013

Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .

3
Prenumerera