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Optimization of Collection Methods for Studies of the Human Microbiota

27 de octubre de 2020 actualizado por: National Cancer Institute (NCI)

Background:

The human microbiota is the bacteria and other microbes found in and on the human body. Scientists study the microbiota because it is related to many health conditions. The way samples are collected and handled can greatly affect microbiota study findings. Researchers want to learn more about how collection methods affect these studies.

Objectives:

To compare different oral and fecal collection methods. To test the effect of new methods to get DNA out of these samples.

Eligibility:

Adults ages 18 and older who are National Cancer Institute employees and have not taken antibiotics in the past 3 months

Design:

Participants will discuss the study with researchers.

Participants will give an oral or fecal sample or both.

For the oral sample, participants will be told what not to do beforehand. This includes chewing gum and smoking. Participants will spit saliva into a tube. Then they will get mouthwash in a vial. They will swish and gargle the mouthwash for 30 seconds then spit it back in the vial.

Participants giving a fecal sample will get a collection kit. They can collect the sample at home or elsewhere. Participants will have a bowel movement into the collection container. They will smear some of it on a card with a stick and put the rest in 2 tubes. They will mix the feces with the solution in the tubes. Participants will write the date and time of collection on the instructions and return the sample within 24 hours.

Participants providing both samples could have 3 study visits: 1 to give an oral sample, 1 to get the fecal sample collection kit, and 1 to return that sample.

Descripción general del estudio

Estado

Retirado

Descripción detallada

The human microbiome (i.e., the collection of microbial genes found in and on the human body) has been observed to be associated with numerous health conditions, but current methodological studies suggest that collection method, laboratory handling, bioinformatic processing of the data, and other factors can greatly affect microbiome study findings. In cohort studies, samples should be collected using validated methods that can be analyzed using multiple technologies, however these technologies and methods are regularly changing and being modified. Therefore, we need to test multiple collection methods for new technologies or test new collection methods to assess the comparability of the results. We will evaluate the effect of several collection methods for oral and/or fecal samples from 100 individuals who work at the NCI on microbial characteristics. Once the samples are collected, we will create aliquots and store the samples for further processing. We will then test the effect of new DNA extraction methods, sequencing technologies, and bioinformatics pipelines using these samples. Any remaining aliquots will remain in the -80 degrees Celsius freezer for other future studies. This study will be essential to understand the impact of collection methods for oral and fecal samples for future epidemiologic studies.

Tipo de estudio

De observación

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

    • Maryland
      • Rockville, Maryland, Estados Unidos, 20850
        • NIH NCI Shady Grove

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

18 años a 100 años (Adulto, Adulto Mayor)

Acepta Voluntarios Saludables

Géneros elegibles para el estudio

Todos

Método de muestreo

Muestra no probabilística

Población de estudio

We plan to recruit 100 adults who work at the NCI, either in Shady Grove or in the Advanced Technology Center (ATC), who are willing to provide oral and/or fecal samples. We will include any participant that is at least 18 years of age or older who is employed at NCI and has not taken antibiotics anytime in the past 3 months since antibiotic use has been shown to disrupt the microbiota.

Descripción

  • ELIGIBILITY CRITERIA:
  • Adults who work at the NCI, either in Shady Grove or in the Advanced Technology Center (ATC)
  • Willing to provide oral and/or fecal samples.
  • At least 18 years of age or older
  • Not taken antibiotics anytime in the past 3 months

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

Cohortes e Intervenciones

Grupo / Cohorte
General Individuals
Any adult working at the NCI who has not used antibiotics in the past 3 months.

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Oral and/or fecal microbiota
Periodo de tiempo: 1 month
relative abundance and phylogenetic diversity of their oral and/or fecal microbiota
1 month

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Investigadores

  • Investigador principal: Emily J Vogtmann, Ph.D., National Cancer Institute (NCI)

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

1 de noviembre de 2018

Finalización primaria (Actual)

27 de octubre de 2020

Finalización del estudio (Actual)

27 de octubre de 2020

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

3 de noviembre de 2018

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

3 de noviembre de 2018

Publicado por primera vez (Actual)

6 de noviembre de 2018

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

28 de octubre de 2020

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

27 de octubre de 2020

Última verificación

1 de octubre de 2020

Más información

Términos relacionados con este estudio

Otros números de identificación del estudio

  • 999919013
  • 19-C-N013

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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