苯氧甲基青霉素、阿莫西林和阿莫西林-克拉维酸对肠道菌群的影响 (EPAAC)

背景：该项目背后的基本原理是不同的抗生素对肠道微生物群有不同的影响，这具有临床意义。 为了研究不同抗生素治疗期间的相对附带损害，需要进行随机试验。 需要在 1 年期间重复采样以捕获长期干扰和恢复微生物群的时间。 为了轻松检查抗生素的作用，健康志愿者是这项研究的理想选择，因为他们的微生物群在纳入时很可能是正常的。 他们在随访期间遇到影响肠道细菌组成的其他因素的风险也很低。

目的：本研究的目的是确定：(1) 抗生素治疗前后 1 年内肠道微生物群的组成以及耐药菌和耐药基因的流行情况，以及 (2) 抗生素治疗后微生物群的差异；苯氧甲基青霉素、阿莫西林和阿莫西林克拉维酸分别与未治疗相比。

方法：该研究是在乌普萨拉大学医院传染病科进行的。 总共将招募 120 名健康志愿者参加该研究。 他们随机接受苯氧甲基青霉素、阿莫西林或阿莫西林克拉维酸治疗 5 天，或不接受抗生素治疗。 受试者在八个不同的时间点提交粪便样本；研究开始时（治疗前）、治疗结束后立即、一周和 1、3、6、12 和 24 个月。 在研究过程中，受试者将总共提供 8 个粪便样本。 将收集和分析总共 960 个粪便样本。

每个受试者将在每个时间点提交两个粪便样本。 一份样本将被冷冻在 DNA-shield 中，并送到 Scilifelab 进行肠道微生物群分析和宏基因组测序，以检测抗生素耐药基因。另一份粪便样本将被送到微生物学部门，通过表型方法（培养组学）进行分析，以检测耐药性基因和耐药菌。

统计数据：数据和统计数据的汇编主要是描述性的。 我们将在抗生素治疗前后立即分析受试者的肠道微生物群和耐药基因的流行情况，然后在1周、1、3、6、完成治疗后 12 和 24 个月。 多样性将使用宏基因组学（shotgun）进行分析，并用作变量来比较不同抗生素对肠道微生物群的附带损害程度，并比较同一个体抗生素治疗前后的肠道微生物群。 粪便样本 1 中肠道微生物群的多样性将构成基线。 将根据结果对治疗组和性别在肠道菌群、耐药性和副作用方面的差异进行有针对性的统计计算，这些结果无法提前预测。

终点和结果：主要终点是肠道微生物群的多样性和组成、多重耐药革兰氏阴性菌在筛查培养物中的流行率以及抗生素治疗前后 2 年内粪便中抗生素耐药基因的流行率。

该结果可用作针对肺部感染（肺炎）抗生素选择的基础，这些抗生素对破坏肠道微生物群和导致耐药性的风险最小。