先天性巨结肠遗传学研究
2023年11月28日 更新者：NYU Langone Health
先天性巨结肠的遗传分析
先天性巨结肠症是一种由不同长度的肠道缺乏神经细胞引起的遗传病。
本研究将调查该疾病的复杂遗传基础，其中涉及多种相互作用的遗传因素。
研究概览
详细说明
先天性巨结肠 (HSCR) 是由于胃肠道中神经（神经节）细胞缺失而导致的出生缺陷。 先天性巨结肠的人口发病率为 1/5000 活产，并且最常作为孤立病症发生。 然而，大约 30% 的 HSCR 病例与其他出生缺陷有关，例如唐氏综合症、耳聋、色素沉着不足和先天性中枢性通气不足综合征。 先天性巨结肠是一种具有常染色体显性遗传、常染色体隐性遗传和多基因遗传模式的遗传病。
二十五年多来，Aravinda Chakravarti 博士的实验室一直在研究先天性巨结肠 (HSCR) 的遗传学。 这项研究的目的是通过全基因组作图和测序研究来识别携带致病 HSCR 突变的基因，并更好地了解家族中 HSCR 的复杂遗传。 具体而言，该研究旨在确定任何人类基因突变导致家族性和孤立性 HSCR 的频率。 此外，该研究将收集临床信息并调查可能的基因型-表型相关性。
使用标记和测序的分子分析，以及对这些数据的统计分析，将用于识别假定的 HSCR 疾病基因可能位于的人类染色体区域。 此外，将在个体患者及其家庭成员中评估已知和/或疑似 HSCR 基因的 DNA 序列，以寻找可能影响疾病表现和治疗结果的致病 HSCR 易感性变异和变异。 表型信息将包括与先天性巨结肠相关的病理学、手术和其他临床结果。 这项研究有望让人们更好地了解 HSCR 的遗传学，并进一步改进诊断、治疗和遗传咨询。
这项研究要求志愿者：
- 完成医疗/家族史问卷
- 提供对一些医疗记录的访问
- 提交患有先天性巨结肠症的个人及其父母（如果有）的血液样本
研究类型
观察性的
注册 (估计的)
3000
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息，以及有关进行该研究的地点的信息。
学习联系方式
- 姓名：Jenna Pucel, MS
- 电话号码：212-263-8069
- 邮箱：jenna.pucel@nyulangone.org
学习地点
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New York
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New York、New York、美国、10016
- 招聘中
- New York University School of Medicine
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接触：
- Monica Erazo, MS
- 电话号码：212-263-8069
- 邮箱：Monica.Erazo@nyulangone.org
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首席研究员：
- Aravinda Chakravarti, PhD
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人，称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
1周 至 100年 (孩子、成人、年长者)
接受健康志愿者
是的
取样方法
非概率样本
研究人群
研究人群包括先天性巨结肠患者及其家庭成员。
描述
纳入标准：
- 患有先天性巨结肠症的人及其一级亲属（任何疾病段长，有或没有其他先天性异常或健康问题，家庭中单个或多个受影响的个体）
排除标准：
- 无法或不愿提供样本进行基因研究
- 无法理解和提供知情同意的个人、父母或监护人
学习计划
本节提供研究计划的详细信息，包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的？
设计细节
- 观测模型：以家庭为基础
- 时间观点：预期
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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患有先天性巨结肠症的家庭
先天性巨结肠症患者及其受影响和未受影响的亲属。
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要求所有研究参与者提供血液、唾液或 DNA 样本。
血液或唾液样本用于分离所有参与者的 DNA。
血液样本也用于在一些参与者中建立细胞系。
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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与先天性巨结肠相关的常见遗传变异的发现和表征
大体时间：入组后 1 年内分离 DNA
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将使用单核苷酸多态性 (SNP) 阵列评估常见遗传变异的全基因组分析
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入组后 1 年内分离 DNA
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与先天性巨结肠相关的拷贝数变异的发现和表征
大体时间：入组后 1 年内分离 DNA
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将使用下一代测序数据和高分辨率微阵列检测拷贝数变异，从而检测整个基因组中的拷贝数变异
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入组后 1 年内分离 DNA
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与先天性巨结肠相关的罕见遗传变异的发现和表征
大体时间：入组后 1 年内分离 DNA
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外显子组测序将用于检测基因组中所有基因的罕见变异
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入组后 1 年内分离 DNA
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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遗传变异与先天性巨结肠移行区位置的相关性
大体时间：入组后最多 1 年获得基线病理学数据
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病理记录和手术记录将用于确定过渡区
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入组后最多 1 年获得基线病理学数据
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遗传变异与先天性巨结肠小肠结肠炎风险的相关性
大体时间：基线临床数据在入组后最多 1 年获得
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基线临床数据在入组后最多 1 年获得
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与已知染色体疾病同时发生的先天性巨结肠症的特征
大体时间：基线临床数据在入组后最多 1 年获得
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基线临床数据在入组后最多 1 年获得
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与已知单基因综合征同时发生的先天性巨结肠症的特征
大体时间：基线临床数据在入组后最多 1 年获得
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基线临床数据在入组后最多 1 年获得
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与其他先天性异常同时发生但诊断不明的先天性巨结肠症的特征
大体时间：基线临床数据在入组后最多 1 年获得
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基线临床数据在入组后最多 1 年获得
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遗传变异与先天性巨结肠症重复穿刺手术需求的相关性
大体时间：基线临床数据在入组后 1 年内获取，随访数据在入组后 100 年内获取
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评估导致最终重复拉通手术的并发症
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基线临床数据在入组后 1 年内获取，随访数据在入组后 100 年内获取
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拉通手术后基因变异与大便控制困难的相关性
大体时间：基线临床数据在入组后 1 年内获取，随访数据在入组后 100 年内获取
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基线临床数据在入组后 1 年内获取，随访数据在入组后 100 年内获取
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直通手术后遗传变异与慢性便秘的相关性
大体时间：基线临床数据在入组后 1 年内获取，随访数据在入组后 100 年内获取
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基线临床数据在入组后 1 年内获取，随访数据在入组后 100 年内获取
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 首席研究员：Aravinda Chakravarti, PhD、NYU Langone Health
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Badner JA, Sieber WK, Garver KL, Chakravarti A. A genetic study of Hirschsprung disease. Am J Hum Genet. 1990 Mar;46(3):568-80.
- Emison ES, McCallion AS, Kashuk CS, Bush RT, Grice E, Lin S, Portnoy ME, Cutler DJ, Green ED, Chakravarti A. A common sex-dependent mutation in a RET enhancer underlies Hirschsprung disease risk. Nature. 2005 Apr 14;434(7035):857-63. doi: 10.1038/nature03467.
- Gabriel SB, Salomon R, Pelet A, Angrist M, Amiel J, Fornage M, Attie-Bitach T, Olson JM, Hofstra R, Buys C, Steffann J, Munnich A, Lyonnet S, Chakravarti A. Segregation at three loci explains familial and population risk in Hirschsprung disease. Nat Genet. 2002 May;31(1):89-93. doi: 10.1038/ng868. Epub 2002 Apr 15.
- Arnold S, Pelet A, Amiel J, Borrego S, Hofstra R, Tam P, Ceccherini I, Lyonnet S, Sherman S, Chakravarti A. Interaction between a chromosome 10 RET enhancer and chromosome 21 in the Down syndrome-Hirschsprung disease association. Hum Mutat. 2009 May;30(5):771-5. doi: 10.1002/humu.20944.
- Emison ES, Garcia-Barcelo M, Grice EA, Lantieri F, Amiel J, Burzynski G, Fernandez RM, Hao L, Kashuk C, West K, Miao X, Tam PK, Griseri P, Ceccherini I, Pelet A, Jannot AS, de Pontual L, Henrion-Caude A, Lyonnet S, Verheij JB, Hofstra RM, Antinolo G, Borrego S, McCallion AS, Chakravarti A. Differential contributions of rare and common, coding and noncoding Ret mutations to multifactorial Hirschsprung disease liability. Am J Hum Genet. 2010 Jul 9;87(1):60-74. doi: 10.1016/j.ajhg.2010.06.007.
- Kapoor A, Jiang Q, Chatterjee S, Chakraborty P, Sosa MX, Berrios C, Chakravarti A. Population variation in total genetic risk of Hirschsprung disease from common RET, SEMA3 and NRG1 susceptibility polymorphisms. Hum Mol Genet. 2015 May 15;24(10):2997-3003. doi: 10.1093/hmg/ddv051. Epub 2015 Feb 9.
- Chatterjee S, Kapoor A, Akiyama JA, Auer DR, Lee D, Gabriel S, Berrios C, Pennacchio LA, Chakravarti A. Enhancer Variants Synergistically Drive Dysfunction of a Gene Regulatory Network In Hirschsprung Disease. Cell. 2016 Oct 6;167(2):355-368.e10. doi: 10.1016/j.cell.2016.09.005. Epub 2016 Sep 29.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查，以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2001年1月1日
初级完成 (估计的)
2028年12月1日
研究完成 (估计的)
2028年12月1日
研究注册日期
首次提交
2007年5月24日
首先提交符合 QC 标准的
2007年5月24日
首次发布 (估计的)
2007年5月25日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2023年11月29日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2023年11月28日
最后验证
2023年11月1日
更多信息
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