食管癌组织库 (ESBX)

前瞻性数据库对临床医学和外科手术的进步做出了重大贡献。 数据库的贡献示例包括更好地理解罕见病症的治疗和结果、长期结果、更常见疾病引起的罕见并发症的发生率，以及不经常执行的复杂程序的影响。 (1-3) 数据库审查发现的问题导致了患者护理的改善，并指导了许多前瞻性研究的规划。 这些数据库的价值随着登记患者的数量和数据库维护时间的延长而逐渐增加。 最近，数据库已被用于创建和测试列线图，这些列线图越来越多地被用于进一步改善患者预后并为临床试验对患者进行分层。 (4) 我们预计，随着我们展望未来，前瞻性数据库将变得更有价值。 越来越多地鉴定出被认为对患者结果或治疗反应重要的分子标记。 当与病理组织相关联时，临床数据库可用作这些新发现的标志物的初始测试，并确定哪些标志物需要进行独立的前瞻性审查。 对每个标记进行独立的前瞻性分析既费钱又费时。 与在出现新问题时测试每组标记的回顾性审查相比，前瞻性数据库更全面、更准确，并且最终耗时更少。

这项研究将扩充在华盛顿大学医学院接受调查和/或手术的食管癌患者的前瞻性数据库。 随着患者继续进行常规后续护理，该数据库将根据患者记录和计算机化医疗记录定期更新。 这些数据将用于解决有关治疗和/或疾病特定结果的问题。

此外，我们寻求获取、存储和分析这些患者的组织和血液样本。 样本将在华盛顿大学医学院的组织采购设施进行处理和储存。 我们将使用这种材料来支持正在进行的鉴定血清标志物的工作，这些标志物可用于早期诊断、预后或治疗效果。 识别的标志物将与数据库中捕获的临床结果数据相关联。 使用该数据库，我们将能够将患者和治疗结果与对先前收集的病理标本或研究标本进行的分析联系起来，并以一种节省时间和成本效益的方式将这些结果与患者的治疗反应和结果相关联。

食管腺癌的发病率呈上升趋势。 这是过去十年中注意到的趋势，并且与食管鳞状细胞癌发病率的下降密切相关。 总体而言，美国每年被诊断出患有食管癌的患者人数正在稳步增加。 在美国，食道癌每年折磨大约 19,000 名患者。 从广义上讲，食管癌可以在没有远处器官转移的早期诊断，也可以在有远处器官转移的证据时诊断为相对晚期。 不幸的是，患有转移性疾病的患者只能接受姑息治疗，而且存活率非常有限。 I - III 期食管癌通常通过初次手术或术前或术后化放疗与手术切除相结合来治疗。 对于 I 期食管癌，手术切除通常就足够了，患者的五年生存率高达 70-80%。 对于III期食管癌患者，患者通常接受诱导化放疗，然后进行手术切除。 诱导化放疗通常包括两个周期的 % 氟尿嘧啶和顺铂以及 5040 Gy 的外照射放射治疗。 这方面的治疗已经标准化 (5)。 对于 II 期食管癌，手术是治疗的支柱，然而，治疗医师对放化疗在这些患者中的疗效和作用尚无明确共识。

在食管癌手术前接受放化疗的患者中，注意到 15-30% 的患者对治疗有完全的病理反应。 因此，在这些患者的切除标本中未检测到肿瘤。 因此，理论上，这些患者进行了不必要的切除。 目前没有办法预测哪些患者在切除食管之前会产生病理反应，从而使患者暴露于与该大手术相关的显着发病率和死亡率。

下一代测序对癌症基因组学最重要的影响是能够重新测序、分析和比较单个患者匹配的肿瘤和正常基因组。 随着测序成本的显着降低和通量的极大提高，现在可以对给定癌症类型的多个患者样本进行测序。 在过去几年的基因组分析中，我们在圣路易斯华盛顿大学的基因组中心 (6-7) 做出了重大贡献，在理解某些肿瘤（包括白血病和胶质母细胞瘤）的行为方面取得了重大进展。 具体来说，在急性白血病中，我们的中心已经表明，肿瘤的某些基因型可以预测所分析患者的有利或不利结果。 这些发现现在已在至少 3 项独立 AML 队列的独立研究中得到复制。 我们这个项目的目标是加深对食管癌基因组概况和治疗变化的理解。 此外，利用放化疗前后的组织可用性，我们将能够通过诱导治疗识别恶性肿瘤基因组的变化。 此外，通过切除标本，我们将能够确定哪些患者对治疗有显着反应（包括完全病理学反应），哪些患者对治疗没有显着反应或尽管接受了治疗但疾病仍在进展。 这可能有助于我们识别食管癌谱的基因组特征，这些特征在有机会纵向研究疾病或患者的临床过程后预测对治疗的反应。 具体而言，这将通过在对这些患者进行初始诊断或初始内窥镜检查时进行任何治疗之前从恶性肿瘤中获取组织样本来实现。 随后，患者将接受基于其疾病临床分期的常规治疗。 最终，当患者回来进行根治性切除时，我们将能够访问病理学概况以评估对诱导治疗的反应，并研究诱导治疗后肿瘤组织的基因组概况。

将在心胸外科部门维护的前瞻性数据库能够将临床结果与处理过的组织（病理标本、研究标本和血浆）联系起来，从而能够进行更高水平的相关性研究。 正确使用此类资源将大大有助于我们推进我们的领域并照顾我们未来的食道癌患者。

我们分析食管癌基因组的最终目标是确定对食管癌放化疗有完全病理学反应的患者群体。 我们将能够识别此类肿瘤与其他肿瘤之间的基因组差异（如果有的话），在这些肿瘤中，诱导化放疗仅产生部分反应/无反应/疾病进展。 如果分析具有足够的预测性并根据基因组图谱有效地将患者分为这些类别，这可能是临床试验的主要基础工作，在该临床试验中，具有某些特定基因组图谱的患者将仅接受食管癌的放化疗，从而排除不必要的手术伴随着显着的发病率和死亡率。 我们已经知道，临床上约有15-30%接受诱导化放疗的患者属于这一类。 众所周知，食管切除术的并发症包括严重的肺部问题、吻合口漏、心血管问题、乳糜漏、静脉血栓形成以及其他主要问题。 食管切除术后的发病率从 20-40% 不等。 食管切除术也有 3-14% 的死亡风险。 (8-9) 因此，一种可以有效预测哪些患者不需要食管切除术来治疗食管癌的工具在临床上将非常有用。