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人类气道细胞的分类和表达谱分析(SEARCH 研究) (SEARCH)

2024年2月1日 更新者:University of California, San Francisco
这将是对哮喘受试者和健康的非哮喘对照者的单点机制研究,涉及基线特征访问和研究性支气管镜访问。 我们将通过分析来自健康对照者和特征明确的哮喘患者的新鲜分离的气道上皮细胞,确定哮喘患者气道上皮表观遗传增强子特征的差异。

研究概览

地位

完全的

条件

详细说明

气道上皮细胞对正常肺功能至关重要,上皮细胞的变化是哮喘发展的核心。 基因转录的精确调控对于气道上皮细胞分化至关重要,转录变化会导致哮喘中出现的许多异常。 尽管增强子在调节转录中起主导作用,但人们对这些 DNA 调节元件如何控制气道上皮细胞转录或增强子活性与健康相比在哮喘中有何不同知之甚少。 弥合这一知识差距将对我们对正常上皮发育和哮喘的理解产生重大影响。 此外,基于增强剂的气道上皮重编程方法有望成为剖析机制的有力工具,这将为开发新型精确靶向哮喘治疗奠定基础。 我们的总体目标是确定在调节关键气道上皮细胞基因中起重要作用的增强子,确定增强子活性如何在哮喘中发生变化,并开发针对这些增强子活性的方法。

研究类型

观察性的

注册 (实际的)

32

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习地点

    • California
      • San Francisco、California、美国、94143
        • University of California, San Francisco

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

18年 至 70年 (成人、年长者)

接受健康志愿者

是的

取样方法

非概率样本

研究人群

从社区广告中招募的健康和哮喘参与者

描述

纳入标准(健康参与者):

  1. 年龄在 18 至 70 岁之间的男性和女性受试者
  2. 提供书面知情同意书的能力和遵守研究要求的能力
  3. 对乙酰甲胆碱无过度反应性(PC20 FEV1 乙酰甲胆碱 >16 mg/mL)
  4. 无过敏性鼻炎/季节性过敏史

纳入标准(哮喘参与者):

  1. 年龄在 18 至 70 岁之间的男性和女性受试者
  2. 提供书面知情同意书的能力和遵守研究要求的能力
  3. 哮喘病史
  4. 在过去 6 周内未使用口服或吸入皮质类固醇治疗哮喘
  5. 对乙酰甲胆碱反应过度(PC20 FEV1 乙酰甲胆碱 < 8 mg/ml)

排除标准:

相同的排除标准将适用于两项子研究。

  1. 当前吸烟者,定义为 (a) 在过去 12 个月内吸了 5 支以上的香烟,并且 (b) 自上次吸烟以来 ≤ 8 周;或总吸烟史≥10包年的前吸烟者
  2. 在参与研究期间怀孕、哺乳或不愿实施节育
  3. 有除哮喘以外的肺部疾病病史的受试者
  4. 受试者有医学疾病史,研究者认为这可能会使受试者在研究相关程序中面临额外风险,或者因为疾病可能影响研究结果
  5. 食管疝手术史。
  6. 目前参与药物研究试验

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

队列和干预

团体/队列
哮喘
有哮喘病史的参与者
健康控制
没有哮喘病史的参与者
哮喘支气管镜检查亚组
有哮喘病史的参与者将接受与其他健康对照者相同的程序并增加支气管镜检查
健康支气管镜亚组
没有哮喘病史的参与者将接受与其他健康对照相同的程序并增加支气管镜检查

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
措施说明
大体时间
使用 H3K27ac ChIP-seq 和 ATAC-seq 在气道上皮刷上测量先前发现在哮喘与健康中差异表达的基因中增强子的基因组位置。
大体时间:1-12周之间
我们之前发现了哮喘患者上皮基因表达的变化。 为了确定解释这些变化的候选增强子,我们将使用 Drop-seq、ChIPseq 和 ATAC-seq 来分析来自健康对照和特征明确的哮喘受试者的新鲜分离的气道上皮细胞。
1-12周之间
气道炎症特征持久性的评估
大体时间:1-12 周和 10-14 个月
对初次支气管镜检查后 12 个月获得的纵向样本进行上皮刷基因表达谱分析和痰液诱导,以评估在哮喘中失调的 2 型和非 2 型通路的稳定性。 (通过 PISA 子研究实现)
1-12 周和 10-14 个月

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
通过 RNA 测序测量气道刷和 BAL 细胞中的基因表达,以评估哮喘与健康中差异表达的非 2 型通路。
大体时间:1-12周之间
进行支气管肺泡灌洗 (BAL) 细胞流式细胞术和上皮刷基因表达谱分析,以寻找在哮喘中失调的非 2 型通路。
1-12周之间

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Nirav Bhakta, MD, PhD、University of California, San Francisco
  • 首席研究员:Prescott Woodruff, MD, MPH、University of California, San Francisco

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2017年1月1日

初级完成 (实际的)

2023年3月1日

研究完成 (实际的)

2023年3月1日

研究注册日期

首次提交

2016年6月1日

首先提交符合 QC 标准的

2016年6月1日

首次发布 (估计的)

2016年6月6日

研究记录更新

最后更新发布 (估计的)

2024年2月5日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2024年2月1日

最后验证

2024年2月1日

更多信息

与本研究相关的术语

关键字

其他研究编号

  • 16-18550
  • U19AI077439 (美国 NIH 拨款/合同)
  • R01HL138424 (美国 NIH 拨款/合同)

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

研究美国 FDA 监管的设备产品

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