Sortering och uttrycksprofilering av luftvägsceller från människor (SEARCH-studien) (SEARCH)
1 februari 2024 uppdaterad av: University of California, San Francisco
Detta kommer att vara en enstaka plats, mekanistisk studie av astmatiska försökspersoner och friska, icke-astmatiska kontroller som involverar ett baslinjekarakteriseringsbesök och ett forskningsbronkoskopibesök.
Vi kommer att identifiera skillnader i signaturer av epigenetiska förstärkare i luftvägarna vid astma, genom att analysera nyligen isolerade luftvägsepitelceller från friska kontroller och från välkarakteriserade personer med astma.
Studieöversikt
Status
Avslutad
Betingelser
Detaljerad beskrivning
Luftvägsepitelet är avgörande för normal lungfunktion och förändringar i epitelet är centrala för utvecklingen av astma.
Exakt reglering av gentranskription är avgörande för differentiering av luftvägarnas epitelceller och transkriptionsförändringar leder till många avvikelser som ses vid astma.
Trots förstärkarnas dominerande roll för att reglera transkription är lite känt om hur dessa DNA-reglerande element kontrollerar transkriptionen av epitelceller i luftvägarna eller om hur förstärkaraktiviteten skiljer sig vid astma jämfört med hälsa.
Att täppa till denna kunskapslucka kommer att ha stor inverkan på vår förståelse av normal epitelutveckling och astma.
Dessutom lovar förstärkarbaserade tillvägagångssätt för omprogrammering av luftvägsepitelet att vara kraftfulla verktyg för dissekering av mekanismer som kommer att sätta scenen för att utveckla en ny klass av exakt riktade behandlingar för astma.
Våra övergripande mål är att identifiera förstärkare som är viktiga för reglering av nyckelgener för epitelceller i luftvägarna, att bestämma hur förstärkaraktiviteten förändras vid astma, och att utveckla metoder för att rikta in sig på aktiviteten hos dessa förstärkare.
Studietyp
Observationell
Inskrivning (Faktisk)
32
Kontakter och platser
Det här avsnittet innehåller kontaktuppgifter för dem som genomför studien och information om var denna studie genomförs.
Studieorter
-
-
California
-
San Francisco, California, Förenta staterna, 94143
- University of California, San Francisco
-
-
Deltagandekriterier
Forskare letar efter personer som passar en viss beskrivning, så kallade behörighetskriterier. Några exempel på dessa kriterier är en persons allmänna hälsotillstånd eller tidigare behandlingar.
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
18 år till 70 år (Vuxen, Äldre vuxen)
Tar emot friska volontärer
Ja
Testmetod
Icke-sannolikhetsprov
Studera befolkning
Friska och astmatiska deltagare rekryterade från samhällsreklam
Beskrivning
Inklusionskriterier (friska deltagare):
- Manliga och kvinnliga försökspersoner mellan 18 och 70 år
- Förmåga att ge skriftligt informerat samtycke och förmåga att följa studiens krav
- Ingen hyperreaktivitet mot metakolin (PC20 FEV1 Metakolin >16 mg/ml)
- Ingen historia av allergisk rinit/säsongsbetonad allergi
Inklusionskriterier (astmatiska deltagare):
- Manliga och kvinnliga försökspersoner mellan 18 och 70 år
- Förmåga att ge skriftligt informerat samtycke och förmåga att följa studiens krav
- Astmas historia
- Ingen användning av orala eller inhalerade kortikosteroider för behandling av astma under de senaste 6 veckorna
- Hyperreaktivitet mot metakolin (PC20 FEV1 Metakolin < 8 mg/ml)
Exklusions kriterier:
Samma uteslutningskriterier kommer att gälla för båda delstudierna.
- Aktuella rökare, definierade av (a) >5 cigaretter rökta under de senaste 12 månaderna, och (b) ≤ 8 veckor sedan senaste rökning; eller tidigare rökare som har en total rökhistoria ≥10 pack-år
- Gravid, ammande eller ovillig att utöva preventivmedel under deltagande i studien
- Försökspersoner med en historia av annan lungsjukdom än astma
- Försökspersoner med en anamnes på en medicinsk sjukdom, som enligt utredaren kan utsätta försökspersonen för en extra risk från studierelaterade procedurer eller för att sjukdomen kan påverka studiens resultat
- Tidigare operation av matstrupsbråck.
- Nuvarande deltagande i en prövning av läkemedel
Studieplan
Det här avsnittet ger detaljer om studieplanen, inklusive hur studien är utformad och vad studien mäter.
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
Kohorter och interventioner
Grupp / Kohort |
|---|
|
Astma
Deltagare med en historia av astma
|
|
Friska kontroller
Deltagare utan historia av astma
|
|
Astma Bronkoskopi undergrupp
Deltagare med en historia av astma som kommer att genomgå samma procedurer som andra friska kontroller med tillägg av bronkoskopi
|
|
Frisk bronkoskopi undergrupp
Deltagare utan en historia av astma som kommer att genomgå samma procedurer som andra friska kontroller med tillägg av bronkoskopi
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Mät den genomiska placeringen av förstärkare i gener som tidigare visat sig vara differentiellt uttryckta i astma kontra hälsa med hjälp av H3K27ac ChIP-seq och ATAC-seq på luftvägsepitelborstning.
Tidsram: Mellan 1-12 veckor
|
Vi har tidigare identifierat förändringar i epitelgenuttryck hos individer med astma.
För att identifiera kandidatförstärkare som står för dessa förändringar kommer vi att använda Drop-seq, ChIPseq och ATAC-seq för att analysera nyligen isolerade luftvägsepitelceller från friska kontroller och från välkarakteriserade försökspersoner med astma.
|
Mellan 1-12 veckor
|
|
Bedömning av persistens av signaturer av luftvägsinflammation
Tidsram: 1-12 veckor och vid 10-14 månader
|
Utför profilering av epitelborstegenexpression och sputuminduktion på longitudinella prover erhållna 12 månader efter den initiala bronkoskopin, för att bedöma stabiliteten hos typ-2- och icke-typ-2-vägar som är dysregulerade vid astma.
(Uppnådd via PISA-delstudien)
|
1-12 veckor och vid 10-14 månader
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Mät genuttryck genom RNA-sekvensering i både luftvägsborstar och BAL-celler för bedömning av icke-typ-2-vägar differentiellt uttryckta i astma vs hälsa.
Tidsram: Mellan 1-12 veckor
|
Utför bronkoalveolär lavage (BAL) cellflödescytometri och profilering av epitelborstegenexpression för att leta efter icke-typ-2-vägar som är dysreglerade vid astma.
|
Mellan 1-12 veckor
|
Samarbetspartners och utredare
Det är här du hittar personer och organisationer som är involverade i denna studie.
Samarbetspartners
Utredare
- Huvudutredare: Nirav Bhakta, MD, PhD, University of California, San Francisco
- Huvudutredare: Prescott Woodruff, MD, MPH, University of California, San Francisco
Studieavstämningsdatum
Dessa datum spårar framstegen för inlämningar av studieposter och sammanfattande resultat till ClinicalTrials.gov. Studieposter och rapporterade resultat granskas av National Library of Medicine (NLM) för att säkerställa att de uppfyller specifika kvalitetskontrollstandarder innan de publiceras på den offentliga webbplatsen.
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
1 januari 2017
Primärt slutförande (Faktisk)
1 mars 2023
Avslutad studie (Faktisk)
1 mars 2023
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
1 juni 2016
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
1 juni 2016
Första postat (Beräknad)
6 juni 2016
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Beräknad)
5 februari 2024
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
1 februari 2024
Senast verifierad
1 februari 2024
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- 16-18550
- U19AI077439 (U.S.S. NIH-anslag/kontrakt)
- R01HL138424 (U.S.S. NIH-anslag/kontrakt)
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
NEJ
Läkemedels- och apparatinformation, studiedokument
Studerar en amerikansk FDA-reglerad läkemedelsprodukt
Nej
Studerar en amerikansk FDA-reglerad produktprodukt
Nej
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .