Sortering og uttrykksprofilering av luftveisceller fra mennesker (SEARCH-studien) (SEARCH)
1. februar 2024 oppdatert av: University of California, San Francisco
Dette vil være et enkelt sted, mekanistisk studie av astmatiske personer og friske, ikke-astmatiske kontroller som involverer et baseline-karakteriseringsbesøk og et forskningsbronkoskopibesøk.
Vi vil identifisere forskjeller i epigenetiske forsterkersignaturer i luftveiene ved astma, ved å analysere nyisolerte luftveisepitelceller fra friske kontroller og fra velkarakteriserte personer med astma.
Studieoversikt
Status
Fullført
Forhold
Detaljert beskrivelse
Luftveisepitelet er kritisk for normal lungefunksjon og endringer i epitelet er sentrale for utviklingen av astma.
Nøyaktig regulering av gentranskripsjon er avgjørende for luftveisepitelcelledifferensiering og transkripsjonsendringer fører til mange abnormiteter sett ved astma.
Til tross for den dominerende rollen til forsterkere i å regulere transkripsjon, er lite kjent om hvordan disse DNA-regulerende elementene kontrollerer transkripsjon av luftveisepitelceller eller om hvordan forsterkeraktiviteten er forskjellig ved astma sammenlignet med helse.
Å lukke dette kunnskapsgapet vil ha stor innvirkning på vår forståelse av normal epitelutvikling og astma.
I tillegg lover enhancer-baserte tilnærminger for omprogrammering av luftveisepitelet å være kraftige verktøy for dissekere mekanismer som vil sette scenen for å utvikle en ny klasse med nøyaktig målrettede behandlinger for astma.
Våre overordnede mål er å identifisere forsterkere som er viktige i regulering av sentrale luftveisepitelcellegener, for å bestemme hvordan forsterkeraktivitet endres ved astma, og å utvikle tilnærminger for å målrette aktiviteten til disse forsterkerne.
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Faktiske)
32
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiesteder
-
-
California
-
San Francisco, California, Forente stater, 94143
- University of California, San Francisco
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
18 år til 70 år (Voksen, Eldre voksen)
Tar imot friske frivillige
Ja
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Friske og astmatiske deltakere rekruttert fra fellesskapsannonsering
Beskrivelse
Inkluderingskriterier (friske deltakere):
- Mannlige og kvinnelige forsøkspersoner mellom 18 og 70 år
- Evne til å gi skriftlig informert samtykke og evne til å oppfylle kravene til studien
- Ingen hyperreaktivitet overfor metakolin (PC20 FEV1 Metakolin >16 mg/ml)
- Ingen historie med allergisk rhinitt/sesongens allergier
Inkluderingskriterier (astmatiske deltakere):
- Mannlige og kvinnelige forsøkspersoner mellom 18 og 70 år
- Evne til å gi skriftlig informert samtykke og evne til å oppfylle kravene til studien
- Historie om astma
- Ingen bruk av orale eller inhalerte kortikosteroider for behandling av astma de siste 6 ukene
- Hyperreaktivitet mot metakolin (PC20 FEV1 Metakolin < 8 mg/ml)
Ekskluderingskriterier:
De samme eksklusjonskriteriene vil gjelde for begge delstudiene.
- Nåværende røykere, definert ved (a) >5 sigaretter røkt de siste 12 månedene, og (b) ≤ 8 uker siden sist røyking; eller tidligere røykere som har en total røykehistorie på ≥10 pakningsår
- Gravid, ammende eller uvillig til å praktisere prevensjon under deltakelse i studien
- Personer med en historie med andre lungesykdommer enn astma
- Forsøkspersoner med en historie med en medisinsk sykdom, som etter etterforskerens mening kan sette forsøkspersonen i ekstra risiko fra studierelaterte prosedyrer eller fordi sykdommen kan påvirke resultatene av studien
- Tidligere esophageal brokkoperasjon.
- Nåværende deltakelse i en utprøvende legemiddelforsøk
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
|---|
|
Astma
Deltakere med en historie med astma
|
|
Sunne kontroller
Deltakere uten astmahistorie
|
|
Astma Bronkoskopi undergruppe
Deltakere med en historie med astma som vil gjennomgå de samme prosedyrene som andre friske kontroller med tillegg av bronkoskopi
|
|
Sunn bronkoskopi undergruppe
Deltakere uten astmahistorie som vil gjennomgå de samme prosedyrene som andre friske kontroller med tillegg av bronkoskopi
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Mål den genomiske plasseringen av forsterkere i gener som tidligere er funnet å være differensielt uttrykt i astma vs helse ved å bruke H3K27ac ChIP-seq og ATAC-seq på luftveisepitelbørsting.
Tidsramme: Mellom 1-12 uker
|
Vi har tidligere identifisert endringer i epitelgenuttrykk hos personer med astma.
For å identifisere kandidatforsterkere som står for disse endringene, vil vi bruke Drop-seq, ChIPseq og ATAC-seq for å analysere nyisolerte luftveisepitelceller fra friske kontroller og fra velkarakteriserte personer med astma.
|
Mellom 1-12 uker
|
|
Vurdering av persistens av signaturer av luftveisbetennelse
Tidsramme: 1-12 uker og ved 10-14 måneder
|
Utfør profilering av epitelbørstegenekspresjon og sputuminduksjon på langsgående prøver oppnådd 12 måneder etter den første bronkoskopien, for å vurdere stabiliteten til type-2- og ikke-type-2-veier som er dysregulert ved astma.
(Oppnådd via PISA-delstudien)
|
1-12 uker og ved 10-14 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Mål genuttrykk ved RNA-sekvensering i både luftveisbørster og BAL-celler for vurdering av ikke-type-2-veier differensielt uttrykt i astma vs helse.
Tidsramme: Mellom 1-12 uker
|
Utfør bronkoalveolar lavage (BAL) cellestrømscytometri og profilering av epitelbørstegenekspresjon for å se etter ikke-type-2-veier som er dysregulert ved astma.
|
Mellom 1-12 uker
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Nirav Bhakta, MD, PhD, University of California, San Francisco
- Hovedetterforsker: Prescott Woodruff, MD, MPH, University of California, San Francisco
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
1. januar 2017
Primær fullføring (Faktiske)
1. mars 2023
Studiet fullført (Faktiske)
1. mars 2023
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
1. juni 2016
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
1. juni 2016
Først lagt ut (Antatt)
6. juni 2016
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Antatt)
5. februar 2024
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
1. februar 2024
Sist bekreftet
1. februar 2024
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- 16-18550
- U19AI077439 (U.S. NIH-stipend/kontrakt)
- R01HL138424 (U.S. NIH-stipend/kontrakt)
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
NEI
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .