Sortowanie i profilowanie ekspresji komórek dróg oddechowych u ludzi (badanie SEARCH) (SEARCH)
1 lutego 2024 zaktualizowane przez: University of California, San Francisco
Będzie to jednoośrodkowe, mechanistyczne badanie osób chorych na astmę i zdrowych, nieastmatycznych grup kontrolnych, obejmujące wizytę w celu charakterystyki wyjściowej oraz wizytę badawczą w celu wykonania bronchoskopii.
Zidentyfikujemy różnice w sygnaturach wzmacniaczy epigenetycznych nabłonka dróg oddechowych w astmie, analizując świeżo wyizolowane komórki nabłonka dróg oddechowych od zdrowych kontroli i od dobrze scharakteryzowanych pacjentów z astmą.
Przegląd badań
Status
Zakończony
Warunki
Szczegółowy opis
Nabłonek dróg oddechowych ma kluczowe znaczenie dla prawidłowego funkcjonowania płuc, a zmiany w nabłonku są kluczowe dla rozwoju astmy.
Precyzyjna regulacja transkrypcji genów jest niezbędna do różnicowania komórek nabłonka dróg oddechowych, a zmiany w transkrypcji prowadzą do wielu nieprawidłowości obserwowanych w astmie.
Pomimo dominującej roli wzmacniaczy w regulacji transkrypcji niewiele wiadomo o tym, w jaki sposób te elementy regulacyjne DNA kontrolują transkrypcję komórek nabłonka dróg oddechowych lub o tym, jak aktywność wzmacniacza różni się w astmie w porównaniu ze zdrowiem.
Zamknięcie tej luki w wiedzy będzie miało duży wpływ na nasze rozumienie prawidłowego rozwoju nabłonka i astmy.
Ponadto podejścia oparte na wzmacniaczach do przeprogramowania nabłonka dróg oddechowych zapowiadają się jako potężne narzędzia do analizy mechanizmu, który przygotuje grunt pod opracowanie nowej klasy precyzyjnie ukierunkowanych metod leczenia astmy.
Naszym ogólnym celem jest zidentyfikowanie wzmacniaczy, które są ważne w regulacji kluczowych genów komórek nabłonka dróg oddechowych, określenie, w jaki sposób zmienia się aktywność wzmacniacza w astmie, oraz opracowanie podejść do ukierunkowania aktywności tych wzmacniaczy.
Typ studiów
Obserwacyjny
Zapisy (Rzeczywisty)
32
Kontakty i lokalizacje
Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.
Lokalizacje studiów
-
-
California
-
San Francisco, California, Stany Zjednoczone, 94143
- University of California, San Francisco
-
-
Kryteria uczestnictwa
Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
18 lat do 70 lat (Dorosły, Starszy dorosły)
Akceptuje zdrowych ochotników
Tak
Metoda próbkowania
Próbka bez prawdopodobieństwa
Badana populacja
Zdrowi i chorzy na astmę uczestnicy rekrutowani z reklamy społecznościowej
Opis
Kryteria włączenia (zdrowi uczestnicy):
- Mężczyźni i kobiety w wieku od 18 do 70 lat
- Zdolność do wyrażenia pisemnej świadomej zgody i zdolność do spełnienia wymagań badania
- Brak nadreaktywności na metacholinę (PC20 FEV1 metacholina >16 mg/ml)
- Brak historii alergicznego nieżytu nosa/alergii sezonowych
Kryteria włączenia (uczestnicy z astmą):
- Mężczyźni i kobiety w wieku od 18 do 70 lat
- Zdolność do wyrażenia pisemnej świadomej zgody i zdolność do spełnienia wymagań badania
- Historia astmy
- Brak stosowania doustnych lub wziewnych kortykosteroidów w leczeniu astmy w ciągu ostatnich 6 tygodni
- Nadreaktywność na metacholinę (PC20 FEV1 metacholina < 8 mg/ml)
Kryteria wyłączenia:
Te same kryteria wykluczenia będą miały zastosowanie do obu badań cząstkowych.
- Aktualni palacze, zdefiniowani jako (a) > 5 papierosów wypalonych w ciągu ostatnich 12 miesięcy oraz (b) ≤ 8 tygodni od ostatniego palenia; lub byli palacze, których łączna historia palenia wynosi ≥10 paczkolat
- Ciąża, karmienie piersią lub niechęć do stosowania środków antykoncepcyjnych podczas udziału w badaniu
- Pacjenci z historią chorób płuc innych niż astma
- Osoby z historią choroby, która w opinii badacza może narazić osobę na dodatkowe ryzyko związane z procedurami związanymi z badaniem lub ponieważ choroba może wpłynąć na wyniki badania
- Przebyta operacja przepukliny przełyku.
- Bieżący udział w eksperymentalnym badaniu leku
Plan studiów
Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
|---|
|
Astma
Uczestnicy z historią astmy
|
|
Zdrowe kontrole
Uczestnicy bez historii astmy
|
|
Podgrupa Astma Bronchoskopia
Uczestnicy z historią astmy, którzy zostaną poddani tym samym procedurom, co inni zdrowi kontrolni, z dodatkiem bronchoskopii
|
|
Podgrupa zdrowej bronchoskopii
Uczestnicy bez historii astmy, którzy zostaną poddani tym samym procedurom, co inni zdrowi kontrolni, z dodatkiem bronchoskopii
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Zmierz genomową lokalizację wzmacniaczy w genach, o których wcześniej stwierdzono, że ulegają różnej ekspresji w astmie w porównaniu ze zdrowiem, używając H3K27ac ChIP-seq i ATAC-seq na wymazach z nabłonka dróg oddechowych.
Ramy czasowe: Od 1 do 12 tygodni
|
Wcześniej zidentyfikowaliśmy zmiany w ekspresji genów nabłonkowych u osób z astmą.
Aby zidentyfikować potencjalne wzmacniacze, które odpowiadają za te zmiany, użyjemy Drop-seq, ChIPseq i ATAC-seq do analizy świeżo wyizolowanych komórek nabłonka dróg oddechowych od zdrowych kontroli i od dobrze scharakteryzowanych pacjentów z astmą.
|
Od 1 do 12 tygodni
|
|
Ocena utrzymywania się objawów zapalenia dróg oddechowych
Ramy czasowe: 1-12 tygodni i 10-14 miesięcy
|
Wykonać profilowanie ekspresji genów szczoteczki nabłonkowej i indukcję plwociny na podłużnych próbkach pobranych 12 miesięcy po wstępnej bronchoskopii, aby ocenić stabilność szlaków typu 2 i innych niż typu 2, które są rozregulowane w astmie.
(Osiągnięto dzięki badaniu cząstkowemu PISA)
|
1-12 tygodni i 10-14 miesięcy
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Zmierz ekspresję genów za pomocą sekwencjonowania RNA zarówno w szczoteczkach dróg oddechowych, jak i komórkach BAL, aby ocenić szlaki inne niż typu 2, które ulegają różnej ekspresji w astmie i zdrowiu.
Ramy czasowe: Od 1 do 12 tygodni
|
Wykonaj cytometrię przepływową z płukania oskrzelowo-pęcherzykowego (BAL) i profilowanie ekspresji genów szczoteczki nabłonkowej, aby znaleźć szlaki inne niż typu 2, które są rozregulowane w astmie.
|
Od 1 do 12 tygodni
|
Współpracownicy i badacze
Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.
Współpracownicy
Śledczy
- Główny śledczy: Nirav Bhakta, MD, PhD, University of California, San Francisco
- Główny śledczy: Prescott Woodruff, MD, MPH, University of California, San Francisco
Daty zapisu na studia
Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)
1 stycznia 2017
Zakończenie podstawowe (Rzeczywisty)
1 marca 2023
Ukończenie studiów (Rzeczywisty)
1 marca 2023
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
1 czerwca 2016
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
1 czerwca 2016
Pierwszy wysłany (Szacowany)
6 czerwca 2016
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (Szacowany)
5 lutego 2024
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
1 lutego 2024
Ostatnia weryfikacja
1 lutego 2024
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- 16-18550
- U19AI077439 (Grant/umowa NIH USA)
- R01HL138424 (Grant/umowa NIH USA)
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
NIE
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Nie
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .