癌症中的肌肉萎缩 (MWIC) (MWIC)

患者：将招募计划进行切除手术的上消化道和下消化道癌症患者。 患者将由临床团队在相关的多学科团队会议上确定，然后在外科门诊获取研究信息和同意。 年龄匹配的健康对照接受良性条件下的择期手术（例如 疝）也将被招募。

患者表型分析：作为诊断和分期的常规部分进行的 CT 扫描将用于身体成分分析。 所有招募的患者都将在存在的地方进行 CT 扫描分析。 对照患者（例如 疝气）可能没有 CT 扫描，但如果有的话，将进行分析。 来自第三腰椎的横向 CT 图像将由一名训练有素的观察员进行评估和组织体积估计。 肌肉和脂肪组织的横截面积将针对身高 (cm2/m2) 进行标准化。 将使用回归方程从原始数据 (cm2) 生成全身储存的估计值。 低肌肉的临界值是基于基于 CT 的肌肉减少症加上癌症患者的肥胖研究。 在之前的一项研究中，CT 扫描后进行肌肉活检的中位时间为 18 天。 表型分析还将涉及测量基本身体属性（例如体重、身高等）和自我报告的身体能力（通过问卷调查）。

肌肉功能/身体活动评估：将在诊所对所有患者进行身体能力的客观评估。 这将涉及“计时启动”测试和“6 分钟步行”测试。 这些测试已在文献中得到充分验证，并具有良好的评分者间信度。 虽然它们确实给患者就诊带来了轻微的不便，但这是微乎其微的。 此外，身体活动计将在防水敷料下应用于患者的大腿。 研究人员已经在癌症患者身上验证了这些仪表，它们体积小 (35x53x7mm) 且重量轻 (20g)。 当在以前的研究中使用时，患者发现它们并不引人注目并且耐受性良好。 在可能的情况下，研究者将要求患者在术后 12 个月内在术后门诊重复“定时起步”和“6 分钟步行测试”。

患者自我报告的评估：在常规诊所，所有患者都将被要求完成关于他们的身体健康状况以及他们对此的看法的经过验证的问卷调查。 这些将用于评估合并症的严重程度，以及评估脆弱性。 示例问卷包括苏格兰合并症严重程度评分、查尔森合并症指数和埃德蒙顿虚弱量表。 将考虑与自我报告的食欲和功能相关的其他问卷，但总体目标将是提出选择问题以减轻提问负担并防止问卷疲劳。 研究人员将要求参与者在术后 12 个月内在常规诊所重复这些问卷。

血液和尿液取样：在常规的国民健康服务 (NHS) 诊所，所有患者都将被要求提供血液和尿液样本。 如果这是不可能的，研究小组将请求允许在计划的手术中通过作为常规护理的一部分插入的导尿管和血管导管在全身麻醉下采集这些样本。 在术后阶段，研究人员将要求参与者在可能的情况下在手术后长达 12 个月的常规诊所提供血液和尿液样本。

肌肉活检：所有患者的手术外科医生将在手术时对腹直肌进行活检。 这将从为计划的手术执行的切口中取出，不需要进一步的切口。 在可能的情况下，还将对股四头肌（大腿肌肉）进行额外的穿刺活检以进行比较。 样品将去除脂肪、血液/纤维组织，在液氮中快速冷冻并储存在 -80°C，对于免疫组织化学 (IHC)，将肌肉标本缝合到软木塞上，用最佳切割温度 (OCT) 处理，然后在 -80°C 下储存之前，将其放入冷却的异戊烷溶剂 (-190°C) 中。

脂肪活检：皮下脂肪活检，并在可能的情况下，在手术时由手术外科医生为所有患者收集内脏脂肪。 此过程不需要任何额外的切口。 这些样品将在液氮中速冻并储存在-80°C。

肿瘤活检：对于癌症患者，一旦切除标本在手术中被取出，这将被带到病理实验室，值班病理学家将取出肿瘤切片。 这将在不影响临床分期的情况下并根据当前程序完成。 将肿瘤样品分成等分试样并在-80°C的液氮中快速冷冻。 这不适用于对照组。

重复取样：在后续的 NHS 诊所，所有患者将被要求提供重复的血液和尿液样本，这些样本将被分成等份，并在 -80°C 的液氮中快速冷冻。 如果患者愿意，他们还将被要求提供股四头肌的单次重复穿刺活检。 这将在临床上使用标准无菌技术在局部麻醉下进行。 注射局部麻醉剂会引起一些不适，但这是暂时的。 还有一些与肌肉活检相关的不适，但这是短暂的，并且在过去已经被很好地耐受了。 仅在常规随访（手术后约 6-8 个月）时要求股四头肌活检。 在可能的情况下，在研究期间的后续例行随访预约中将要求重复血液和尿液样本。 研究人员预计这种情况会在术后长达 12 个月内发生。

免疫组织化学 (IHC) 和蛋白质印迹：这些将按照以前的出版物进行。 对于 IHC，冷冻肌肉切片将针对层粘连蛋白和肌球蛋白重链或 lla 进行共染色，以区分纤维类型。 石蜡切片也可以使用和染色。 纤维类型的分布、单个纤维的横截面积和细胞核的分布（中心位置与外围位置以评估再生水平）将通过专有图像分析平台进行评估。 用于测量的潜在标志物将包括自噬通路成员（beclin、灯、抗胸腺细胞球蛋白 (ATG)）；细胞凋亡（聚腺苷二磷酸核糖聚合酶 (PARP)、caspase-3）；氧化应激（亚硝基化 4-羟基壬醛 (HNE) 和泛素化 [K48、K63] 蛋白）；细胞应激（核因子（红细胞衍生 2）-样 2 Kelch 样红细胞衍生蛋白与 Cap 'N' Collar 同源相关蛋白 1 (NRF2KEAP1)、热休克蛋白 (HSP)、内质网 (ER)-应激);炎症（IkB 激酶 (IKK)、活化 B 细胞核因子 kappa 轻链增强子 (NFkB)-9p65、p.38、细胞外信号相关激酶 (erk)1/2、c-Jun N 末端激酶(jnk));卫星细胞成熟 (Paired Box (Pax)3, Pax7, Myogenic factor (MYF)5, M-cadherin)；肌生成（肌细胞生成素、结蛋白）； sma/mothers against decapentaplegic (SMAD) (SMAD3, phosphoSMAD3);和 P-选择素。

C-反应蛋白 (CRP) 分析：系统性炎症 (SI) 将使用血浆 CRP 浓度进行评估，血浆 CRP 浓度将由爱丁堡皇家医院 (RIE) 临床化学系使用自动免疫比浊法进行测量。

这些分析将在爱丁堡大学和国际合作者的场所进行。 任何离开大学保管的组织都将使用唯一的研究标识符完全匿名化。

当前的这项研究是之前一项由英国癌症研究中心 (Cancer Research United Kingdom, UK) 资助和支持的研究的延续。 作为该研究的一部分，收集了组织样本，其中一些留在了大学。 研究人员打算使用这些剩余样本通过增加队列规模来增加研究人员收集的新样本的能力，从而增加识别出的任何潜在生物标志物的可能性是重要的而不是错误的。 此外，将这些样本包括在分析中将增加它们的价值，超过之前项目中已经获得的价值。