Identifikace hostitelských faktorů norovirových infekcí v modelu Mini-Gut
Skríning CRISPR pro celý genom pro hostitelské faktory spojené s norovirovými infekcemi v modelu lidského střevního enteroidu odvozeného z kmenových buněk
Primárním cílem této studie je sestavit seznam hostitelských buněčných proteinů, které zprostředkovávají norovirovou infekci.
Norovirus je jedním z nejčastějších patogenů připisovaných průjmovým onemocněním z nebezpečných potravin. Je také hlavní příčinou úmrtnosti malých dětí a dospělých na infekce přenášené potravinami. Norovirus není jen potravinová zátěž. V nedávné metaanalýze představuje norovirus téměř jednu pětinu všech příčin (včetně přenosu z člověka na člověka) akutní gastroenteritidy ve sporadických i ohniskových situacích a postihuje všechny věkové skupiny. Norovirus je nepochybně hlavním problémem veřejného zdraví v rozvinutých i rozvojových zemích. Pro cílenou intervenci bude nutné výzkumné úsilí k lepšímu pochopení patobiologie noroviru.
Od koronaviru respiračního syndromu na Středním východě po virus Zika bylo vždy prioritou výzkumu úsilí o identifikaci hostitelských faktorů důležitých pro zprostředkování virové infekce. Takové informace vrhnou světlo na potenciální terapeutické cíle při antivirové intervenci. Studie interakce mezi virem a hostitelem noroviru byly v posledních 20 letech ztíženy nedostatkem robustního modelu buněčné kultury. V roce 2016 byl norovirus konečně úspěšně kultivován v trojrozměrné struktuře podobné lidskému střevu odvozené z kmenových buněk, která se nazývá enteroid nebo mini-gut.
V této studii budou střevní kmenové buňky izolovány z duodenálních biopsií odebraných od účastníků, po kterých bude následovat diferenciace do ministřev. Genomový genetický screening esenciálních a restriktivních faktorů hostitele bude proveden na infikovaných mini-střevech pomocí knockout CRISPR a gain-of-function CRISPR SAM, v daném pořadí. Kandidáti z užšího výběru podstoupí předběžnou funkční validaci v buněčných liniích. Tato data poskytnou náhled na potenciální terapeutické cíle proti norovirové infekci.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Detailní popis
Návrh a přehled studie – Toto je laboratorní studie. Vyšetřovatelé plánují sestavit seznam hostitelských buněčných proteinů regulujících norovirovou infekci. Metody budou zahrnovat vytvoření lidských střevních enteroidů pocházejících z kmenových buněk specifických pro pacienta jako infekčního modelu a genetické screeningy CRISPR a CRISPR SAM pro celý genom po infekcích dvou genotypů noroviru.
***Vytvoření modelu enteroidních střev u člověka***
- Biopsie duodena a odběr slin – Po získání informovaného souhlasu schváleného IRB budou od každého účastníka podstupujícího endoskopii horní části gastrointestinálního traktu odebrány dva vzorky biopsie duodena bez kontraindikací pro odběr biopsie, jako jsou účastníci na antikoagulaci nebo s jinými příčinami krvácivé diatézy. Bioptické vzorky budou ponořeny do ledově vychlazeného 1xPBS a do 30 minut ihned transportovány do laboratoře k dalšímu zpracování. Kromě toho budou od každého účastníka odebrány sliny (1-2 ml) pro testování stavu sekrece pomocí ELISA.
- Izolace kmenových buněk krypt a diferenciace - Po příjezdu budou vzorky biopsie nejprve nasekány na menší kousky. Buňky střevních krypt budou izolovány opakovaným promytím a inkubací s 1x kompletním chelatačním roztokem (1xCCS) a EDTA pufrem. Supernatant obsahující buňky krypt pak bude pěstován v Matrigelu obsahujícím kompletní médium s růstovými faktory (CMGF+) (kondicionované médium Wnt 3 a Rspo-1, Noggin, A83, B27, EGF, N2, n-acetylcystein, gastrin, nikotinamid a SB202190) . Pučící krypty pak budou inkubovány v diferenciačním médiu (CMGF+, s výjimkou Wnt 3 kondicionovaného média, SB202190 a nikotinamidu, stejně jako se sníženým množstvím Rspo-1 kondicionovaného média a Nogginu). Tvorba trojrozměrných střevních enteroidů bude sledována denně.
Typ studie
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Zápis
Fáze
Fáze
- Nelze použít
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
Studijní kontakt
- Jméno: Chi-Wai Chan, PhD
- Telefonní číslo: +852 35051523
- E-mail: martin.chan@cuhk.edu.hk
Studijní místa
-
-
-
Hong Kong, Čína
- Nábor
- Endoscopy Centre, Prince of Wales Hospital
-
Kontakt:
- Chi-Wai Chan, PhD
- Telefonní číslo: +852 35051523
- E-mail: martin.chan@cuhk.edu.hk
-
Vrchní vyšetřovatel:
- Chi-Wai Chan, PhD
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Kay-Sheung Chan, MD
-
Dílčí vyšetřovatel:
- Hei Wong, MBChB; DPhil
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Dospělí ve věku 18 let nebo starší
- Potenciální ambulantní pacienti podstupující gastrointestinální endoskopii pro příznaky dyspepsie na endoskopické jednotce nemocnice Prince of Wales, Shatin, Hong Kong, Čína
- Schopný a ochotný poskytnout informovaný písemný souhlas
Kritéria vyloučení:
- Užívání antikoagulancií a/nebo aspirinu, které mohou zvýšit riziko krvácení
- Krvácející diatéza v anamnéze
- Kontraindikace odběru biopsie
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: ZÁKLADNÍ_VĚDA
- Přidělení: NA
- Intervenční model: SINGLE_GROUP
- Maskování: ŽÁDNÝ
Počet zbraní
Zbraně a zásahy
Skupina účastníků / ArmSkupina účastníků / Arm |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Experimentální: Enteroidy odvozené ze střevních kmenových buněk
Vzorky duodenální biopsie a sliny budou odebrány účastníkům a poté zpracovány v laboratoři, aby se vytvořily enteroidy odvozené ze střevních kmenových buněk.
|
Od každého účastníka budou odebrány dva vzorky duodenální biopsie
Každému účastníkovi budou odebrány sliny (1-2 ml) pro testování stavu sekrece
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Vytvoření enteroidů pocházejících z lidských střevních kmenových buněk
Časové okno: V průměru tři měsíce
|
Životaschopnost enteroidů stanovená mikroskopicky
|
V průměru tři měsíce
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Chi-Wai Chan, PhD, Chinese University of Hong Kong
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Začátek studia
Primární dokončení (Očekávaný)
Primární dokončení
Dokončení studie (Očekávaný)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- MIC_CHAN_GRF_17_18_v1_20160930
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .