Zájem o vysoce výkonné sekvenování RNA pro diagnostiku heterogenních genetických chorob
Nástup vysoce výkonného sekvenování genomové DNA vedl k velkému pokroku v diagnostice genetických onemocnění heterogenního původu. Naše nemocniční laboratoř tak v posledních letech vyvinula několik diagnostických testů založených na cíleném sekvenování kódujících sekvencí genových panelů (od asi dvaceti genů pro onemocnění opravující DNA až po téměř pět set genů pro mentální postižení). Tyto cílené analýzy provedené záchytem tak vyřešily 25 až 80 % případů podle indikací, aniž by umožnily diagnostiku všech pacientů.
Pro tyto negativní případy bylo pak hledání mutací v kódujících sekvencích rozšířeno na Whole Exome Sequencing, čímž bylo poskytnuto několik dalších diagnóz.
Pacienti po této exomové studii stále zůstávají bez diagnózy. Mohlo by se jednat o složité případy genetického nebo dokonce negenetického původu, ale také o monogenní patologie spojené s mutacemi, které nejsou identifikovatelné pomocí analýzy kódujících sekvencí, a zejména ovlivňující messenger RNA.
Přehled studie
Postavení
Postavení
Podmínky
Podmínky
Intervence / Léčba
Intervence / Léčba
Typ studie
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Zápis
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Strasbourg, Francie, 67091
- Les Hopitaux Universitaires de Strasbourg
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- DOSPĚLÝ
- OLDER_ADULT
- DÍTĚ
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení společná pro všechny účastníky:
- Menší nebo větší pacient
- Pacient trpící patologií studovanou v laboratoři vysoce výkonným sekvenováním: mentální postižení, myopatie, neurosenzorické onemocnění (Bardet-Biedlův syndrom, retinitis pigmentosa, ....), onemocnění reparace DNA (Cockayne syndrom, ...)
- Odběr vzorků umožňující extrakci dostupné RNA (nebo RNA dostupné v bance)
- Pacient (nebo jeho zákonný zástupce), který již udělil svůj souhlas, na jedné straně k provedení genetických analýz ke zjištění příčiny jeho onemocnění a na straně druhé k uchování části jejich nevyužitých pro další použití za účelem pokračovat v diagnostických výzkumech ve světle vyvíjejících se znalostí a pro výzkumné účely.
- Pacient (nebo jeho zákonný zástupce) souhlasí s použitím údajů z jeho lékařské dokumentace a údajů spojených s genetickou diagnózou pro výzkumné účely
- Pacient zapojený do systému sociálního zabezpečení Kritéria pro zařazení do testovací fáze
- Známé pertogenní mutace Kritéria pro zařazení do prospektivní fáze
- Magnetická molekulární diagnostika po obvyklých vyšetřeních (vysoce výkonné sekvenování panelu genů na genomové DNA, sekvenování exomu nebo dokonce genomu.
Kritéria nezařazení:
◾ Odmítnutí pacienta (nebo jeho zákonného zástupce) zúčastnit se studie.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Počet skupin / kohort
Kohorty a intervence
Skupina / kohortaSkupina / kohorta |
Intervence / LéčbaIntervence / Léčba |
|---|---|
|
Ověřovací fáze
Projekt bude probíhat ve dvou fázích: fáze validačního testu zahrnující 5 pacientů se známým genotypem a fáze prospektivní zahrnující 10 pacientů.
|
Testovací zájem sekvenování messenger RNA pro etiologickou diagnózu nevyřešených pacientů po sekvenování kódujících oblastí.
|
|
Prospektivní fáze
Projekt bude probíhat ve dvou fázích: fáze validačního testu zahrnující 5 pacientů se známým genotypem a fáze prospektivní zahrnující 10 pacientů.
|
Testovací zájem sekvenování messenger RNA pro etiologickou diagnózu nevyřešených pacientů po sekvenování kódujících oblastí.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
RNA sekvenování
Časové okno: 3 roky
|
testování zájmu o sekvenování messenger RNA pro etiologickou diagnostiku nevyřešených pacientů po sekvenování kódujících oblastí a její integraci do nemocniční rutiny s cílem zlepšit diagnostiku heterogenních genetických onemocnění.
|
3 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Sponzor
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (OČEKÁVANÝ)
Začátek studia
Primární dokončení (OČEKÁVANÝ)
Primární dokončení
Dokončení studie (OČEKÁVANÝ)
Dokončení studie
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (AKTUÁLNÍ)
První zveřejněno
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)
Poslední zveřejněná aktualizace
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
Další identifikační čísla studie
- 7004 (CTEP)
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .